The problem of IC50 prediction for ligand-protein pairs using Transformer architecture under limited resources
The article discusses approaches to optimizing the training of models for predicting the half-maximal inhibitory concentration (IC50) of ligand-protein pairs under limited computational resources. A method of smart bucketing of data by protein length with a dynamic selection of the number of groups...
Gespeichert in:
| Datum: | 2026 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | Krysenko, Pavlo, Bektimirov, Alim |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainisch |
| Veröffentlicht: |
Kyiv National University of Construction and Architecture
2026
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://es-journal.in.ua/article/view/365080 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Environmental safety and natural resources |
| Завантажити файл: | |
Institution
Environmental safety and natural resourcesÄhnliche Einträge
The problem of prediction of the transmission coefficient using neural networks with a limited quantity of data
von: Krysenko, Pavlo
Veröffentlicht: (2025)
von: Krysenko, Pavlo
Veröffentlicht: (2025)
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
von: Sudakov, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: Sudakov, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2013)
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
von: Hurmach, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Hurmach, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
von: Lisitsyna, O.M., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Lisitsyna, O.M., et al.
Veröffentlicht: (2017)
Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)
New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)
Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
von: Bondarenko, V.S., et al.
Veröffentlicht: (2015)
von: Bondarenko, V.S., et al.
Veröffentlicht: (2015)
Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
von: Lykhenko, O., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Lykhenko, O., et al.
Veröffentlicht: (2017)
Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2017)
The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
von: Mykuliak, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Mykuliak, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014)
Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Babichev, S.A., et al.
Veröffentlicht: (2016)
Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
von: Chellapandi P., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Chellapandi P., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
von: Polishchuk, L.V.
Veröffentlicht: (2017)
von: Polishchuk, L.V.
Veröffentlicht: (2017)
Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
von: Куклін, А.В., et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: Куклін, А.В., et al.
Veröffentlicht: (2013)
Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
von: Pydiura, N.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Pydiura, N.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
von: Rayevsky, O.V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Rayevsky, O.V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
PTI-1: novel way to oncogenicity
von: Vislovukh, A.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Vislovukh, A.A., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
von: Сліщук, Г.І., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Сліщук, Г.І., et al.
Veröffentlicht: (2012)
A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
von: Palchevska, O.L., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Palchevska, O.L., et al.
Veröffentlicht: (2016)
Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
von: Rayevsky, A.V., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Rayevsky, A.V., et al.
Veröffentlicht: (2016)
Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
von: Dotsenko, V.A., et al.
Veröffentlicht: (2014)
von: Dotsenko, V.A., et al.
Veröffentlicht: (2014)
A prediction of the frequency of non-periodic signals based on convolutional neural networks
von: Subbotin, S. A., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Subbotin, S. A., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Aggregated proteins in malignant and benign neoplasms
von: Zabolotnyi, D.I., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Zabolotnyi, D.I., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Development and research of a modified convolutional neural network for malaria cell pattern recognition
von: Федорченко, Є. М., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Федорченко, Є. М., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Prediction of protein-ligand binding sites modulating activity of MAST protein kinases
von: P. A. Karpov, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: P. A. Karpov, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Machine learning methods analysis in the document classification problem
von: Zhyrkova, A.P., et al.
Veröffentlicht: (2021)
von: Zhyrkova, A.P., et al.
Veröffentlicht: (2021)
The effects of early postoperative immunization with xenogeneic embryo proteins on Lewis lung carcinoma model
von: Symchych, T.V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Symchych, T.V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Recurrent neural networks for the problem of improving numerical meteorological forecasts
von: Doroshenko, А.Yu., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Doroshenko, А.Yu., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Application of deep learning and computer vision frameworks for solving video context prediction problem
von: Voloshyn, D.
Veröffentlicht: (2018)
von: Voloshyn, D.
Veröffentlicht: (2018)
Developing a semantic image model using machine learning based on convolutional neural networks
von: Andon, P.I., et al.
Veröffentlicht: (2020)
von: Andon, P.I., et al.
Veröffentlicht: (2020)
Prediction of hydraulic resistance coefficient using an ensemble neural network algorithm
von: Khodnevych, Yaroslav, et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Khodnevych, Yaroslav, et al.
Veröffentlicht: (2025)
Overexpression of the mitochondrial ribosomal protein S18-2 in the invasive breast carcinomas
von: Buchynska, L.G., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Buchynska, L.G., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Digital twins in intrusion detection systems based on deep learning
von: Letychevskyi, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Letychevskyi, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2025)
A generalized methodology of sign language recognition on video streams based on neural networks and transformers
von: Кузнєцова, Н. В., et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: Кузнєцова, Н. В., et al.
Veröffentlicht: (2023)
Automatic development of deep neural networks for improving numerical meteorological forecast
von: Doroshenko, А.Yu., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Doroshenko, А.Yu., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Development of the intelligent control system of an unmanned car
von: Dakhno, N.B., et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: Dakhno, N.B., et al.
Veröffentlicht: (2024)
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
von: O. O. Sudakov, et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: O. O. Sudakov, et al.
Veröffentlicht: (2013)
Hybrid method for tracking moving objects in video streams under dynamic observation conditions
von: Semko, Oleksiy, et al.
Veröffentlicht: (2026)
von: Semko, Oleksiy, et al.
Veröffentlicht: (2026)
APPLICATION OF DEEP LEARNING NEURAL NETWORK FOR CLASSIFICATION OF BIG DATA OF ASTRONOMIC OBSERVATIONS
von: Gorbunov, A. A., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Gorbunov, A. A., et al.
Veröffentlicht: (2017)
Application of deep learning technology for creating intellectual autonomous machines
von: Bilokon, O.S.
Veröffentlicht: (2020)
von: Bilokon, O.S.
Veröffentlicht: (2020)
Ähnliche Einträge
-
The problem of prediction of the transmission coefficient using neural networks with a limited quantity of data
von: Krysenko, Pavlo
Veröffentlicht: (2025) -
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
von: Sudakov, O.O., et al.
Veröffentlicht: (2013) -
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
von: Hurmach, V.V., et al.
Veröffentlicht: (2014) -
Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
von: Lisitsyna, O.M., et al.
Veröffentlicht: (2017) -
Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
von: Yesylevskyy, S.O.
Veröffentlicht: (2010)