Зображення обкладинки

The problem of IC50 prediction for ligand-protein pairs using Transformer architecture under limited resources

The article discusses approaches to optimizing the training of models for predicting the half-maximal inhibitory concentration (IC50) of ligand-protein pairs under limited computational resources. A method of smart bucketing of data by protein length with a dynamic selection of the number of groups...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2026
Автори та афіліації:	Pavlo Krysenko — Доктор філософії, молодший науковий співробітник, Інститут телекомунікацій і глобального інформаційного простору НАН України, Київ Alim Bektimirov — Провідний інженер, Інститут телекомунікацій і глобального інформаційного простору НАН України, Київ
Ключові слова:	keywords
Автори:	Krysenko, Pavlo, Bektimirov, Alim
Формат:	Стаття
Мова:	Українська
Опубліковано:	Kyiv National University of Construction and Architecture 2026
Теми:	deep learning ligand protein bioinformatics convolutional neural networks data compression
Онлайн доступ:	https://es-journal.in.ua/article/view/365080
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Environmental safety and natural resources
Завантажити файл:

Репозитарії

Environmental safety and natural resources

Схожі ресурси

The problem of prediction of the transmission coefficient using neural networks with a limited quantity of data
за авторством: Krysenko, Pavlo
Опубліковано: (2025)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)

Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)

New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)

Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)

Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)

Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)

Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

PTI-1: novel way to oncogenicity
за авторством: Vislovukh, A.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
за авторством: Сліщук, Г.І., та інші
Опубліковано: (2012)

A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
за авторством: Palchevska, O.L., та інші
Опубліковано: (2016)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: Rayevsky, A.V., та інші
Опубліковано: (2016)

Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
за авторством: Dotsenko, V.A., та інші
Опубліковано: (2014)

Aggregated proteins in malignant and benign neoplasms
за авторством: Zabolotnyi, D.I., та інші
Опубліковано: (2023)

A prediction of the frequency of non-periodic signals based on convolutional neural networks
за авторством: Subbotin, S. A., та інші
Опубліковано: (2018)

Development and research of a modified convolutional neural network for malaria cell pattern recognition
за авторством: Федорченко, Є. М., та інші
Опубліковано: (2023)

Prediction of protein-ligand binding sites modulating activity of MAST protein kinases
за авторством: P. A. Karpov, та інші
Опубліковано: (2024)

The effects of early postoperative immunization with xenogeneic embryo proteins on Lewis lung carcinoma model
за авторством: Symchych, T.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Machine learning methods analysis in the document classification problem
за авторством: Zhyrkova, A.P., та інші
Опубліковано: (2021)

Overexpression of the mitochondrial ribosomal protein S18-2 in the invasive breast carcinomas
за авторством: Buchynska, L.G., та інші
Опубліковано: (2018)

Recurrent neural networks for the problem of improving numerical meteorological forecasts
за авторством: Doroshenko, А.Yu., та інші
Опубліковано: (2023)

Application of deep learning and computer vision frameworks for solving video context prediction problem
за авторством: Voloshyn, D.
Опубліковано: (2018)

Prediction of hydraulic resistance coefficient using an ensemble neural network algorithm
за авторством: Khodnevych, Yaroslav, та інші
Опубліковано: (2025)

Digital twins in intrusion detection systems based on deep learning
за авторством: Letychevskyi, O.O., та інші
Опубліковано: (2025)

A generalized methodology of sign language recognition on video streams based on neural networks and transformers
за авторством: Кузнєцова, Н. В., та інші
Опубліковано: (2023)

Automatic development of deep neural networks for improving numerical meteorological forecast
за авторством: Doroshenko, А.Yu., та інші
Опубліковано: (2024)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: O. O. Sudakov, та інші
Опубліковано: (2013)

Hybrid method for tracking moving objects in video streams under dynamic observation conditions
за авторством: Semko, Oleksiy, та інші
Опубліковано: (2026)

APPLICATION OF DEEP LEARNING NEURAL NETWORK FOR CLASSIFICATION OF BIG DATA OF ASTRONOMIC OBSERVATIONS
за авторством: Gorbunov, A. A., та інші
Опубліковано: (2017)

An approach to prediction and providing of compression ratio for DCT based coder applied to remote sensing images
за авторством: Kozhemiakin, Ruslan, та інші
Опубліковано: (2016)

Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2024)

Development of the intelligent control system of an unmanned car
за авторством: Dakhno, N.B., та інші
Опубліковано: (2024)