Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных матрицах доми...
Збережено в:
| Дата: | 2008 |
|---|---|
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
2008
|
| Назва видання: | Физика низких температур |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/117480 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-117480 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1174802017-05-24T03:03:42Z Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr Иванов, А.Ю. Физические свойства криокристаллов С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца: С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного син-конформера. За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду 2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця: С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2. Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера. The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine (dU) in the low-temperature matrices of Ar and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation spectroscopy and quantum chemical calculations with the DFT and MP2 methods. It is found that two anti-conformers of dU with different structures of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are dominated. The main syn-conformer is stabilized by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2 and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated that in the low-temperature matrices there may occur minor minor syn-conformers without intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar ring is found to depend on matrix. 2008 Article Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. 0132-6414 PACS : 33.15.–e;67.80.–s http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/117480 ru Физика низких температур Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Физические свойства криокристаллов Физические свойства криокристаллов |
| spellingShingle |
Физические свойства криокристаллов Физические свойства криокристаллов Иванов, А.Ю. Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr Физика низких температур |
| description |
С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических
расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида
2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных
матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца:
С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной
связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в
низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных
образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено
влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного
син-конформера. |
| format |
Article |
| author |
Иванов, А.Ю. |
| author_facet |
Иванов, А.Ю. |
| author_sort |
Иванов, А.Ю. |
| title |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_short |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_full |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_fullStr |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_full_unstemmed |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_sort |
особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах ar и kr |
| publisher |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України |
| publishDate |
2008 |
| topic_facet |
Физические свойства криокристаллов |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/117480 |
| citation_txt |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
/ А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. |
| series |
Физика низких температур |
| work_keys_str_mv |
AT ivanovaû osobennostikonformacionnyhstruktur2dezoksiuridinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricaharikr |
| first_indexed |
2023-10-18T20:29:54Z |
| last_indexed |
2023-10-18T20:29:54Z |
| _version_ |
1796150356807254016 |