Soliton and ratchet motions in helices
The most simple and straightforward generalization of the standard one-dimensional molecular chain with nearest-neighbour interactions to three dimensions is shown to be a helix backbone with three types of intermolecular interactions, the chain with secondary structure (e.g., α -helix in biology)....
Збережено в:
| Видавець: | Інститут фізики конденсованих систем НАН України |
|---|---|
| Дата: | 1999 |
| Автори: | , , , |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Інститут фізики конденсованих систем НАН України
1999
|
| Назва видання: | Condensed Matter Physics |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/120378 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Цитувати: | Soliton and ratchet motions in helices / A.V. Zolotaryuk, P.L. Christiansen, B. Norde, A.V. Savin // Condensed Matter Physics. — 1999. — Т. 2, № 2(18). — С. 293-302. — Бібліогр.: 19 назв. — англ. |
Репозиторії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-120378 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1203782017-06-13T03:04:05Z Soliton and ratchet motions in helices Zolotaryuk, A.V. Christiansen, P.L. Norde, B. Savin, A.V. The most simple and straightforward generalization of the standard one-dimensional molecular chain with nearest-neighbour interactions to three dimensions is shown to be a helix backbone with three types of intermolecular interactions, the chain with secondary structure (e.g., α -helix in biology). The set of coupled nonlinear field equations with respect to the longitudinal and transverse displacements of the chain molecules is derived and stable non-topological three-component soliton solutions are found numerically. These solutions describe supersonic pulses of longitudinal compression accompanied by a localized transverse bulge and a localized torsional stretching of the helix backbone. Asymmetry caused by helicity of the backbone is shown to rectify zero-mean oscillating or fluctuating motions on a simple experimental mechanical model. Показано, що найбільш просте і безпосереднє тривимірне узагальнення стандартного одновимірного молекулярного ланцюжка із взаємодією найближчих сусідів має вигляд спірального скелета з трьома типами міжмолекулярних взаємодій – ланцюг із вторинною структурою (наприклад, α -спіраль у біології). Виведено систему зв’язаних нелінійних польових рівнянь стосовно поперечних і поздовжніх зміщень молекул ланцюжка і знайдені стійкі нетопологічні трикомпонентні солітонні розв’язки. Ці розв’язки описують надзвукові биття поздовжнього стиску, що судпроводжуються локалізованою поперечною опуклістю і локалізованим скрученим розтягом спірального скелета. На прикладі простої механічної моделі показано, що спричинена спіральністю скелета асиметрія виправляє середні осцилюючі або флюктуюючі рухи. 1999 Soliton and ratchet motions in helices / A.V. Zolotaryuk, P.L. Christiansen, B. Norde, A.V. Savin // Condensed Matter Physics. — 1999. — Т. 2, № 2(18). — С. 293-302. — Бібліогр.: 19 назв. — англ. 1607-324X DOI:10.5488/CMP.2.2.293 PACS: 63.20.Ry, 63.20.Pw, 87.15.-v http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/120378 en Condensed Matter Physics Інститут фізики конденсованих систем НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| description |
The most simple and straightforward generalization of the standard one-dimensional molecular chain with nearest-neighbour interactions to three
dimensions is shown to be a helix backbone with three types of intermolecular interactions, the chain with secondary structure (e.g., α -helix in biology). The set of coupled nonlinear field equations with respect to the longitudinal and transverse displacements of the chain molecules is derived and
stable non-topological three-component soliton solutions are found numerically. These solutions describe supersonic pulses of longitudinal compression accompanied by a localized transverse bulge and a localized torsional
stretching of the helix backbone. Asymmetry caused by helicity of the backbone is shown to rectify zero-mean oscillating or fluctuating motions on a
simple experimental mechanical model. |
| author |
Zolotaryuk, A.V. Christiansen, P.L. Norde, B. Savin, A.V. |
| spellingShingle |
Zolotaryuk, A.V. Christiansen, P.L. Norde, B. Savin, A.V. Soliton and ratchet motions in helices Condensed Matter Physics |
| author_facet |
Zolotaryuk, A.V. Christiansen, P.L. Norde, B. Savin, A.V. |
| author_sort |
Zolotaryuk, A.V. |
| title |
Soliton and ratchet motions in helices |
| title_short |
Soliton and ratchet motions in helices |
| title_full |
Soliton and ratchet motions in helices |
| title_fullStr |
Soliton and ratchet motions in helices |
| title_full_unstemmed |
Soliton and ratchet motions in helices |
| title_sort |
soliton and ratchet motions in helices |
| publisher |
Інститут фізики конденсованих систем НАН України |
| publishDate |
1999 |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/120378 |
| citation_txt |
Soliton and ratchet motions in helices / A.V. Zolotaryuk, P.L. Christiansen, B. Norde, A.V. Savin // Condensed Matter Physics. — 1999. — Т. 2, № 2(18). — С. 293-302. — Бібліогр.: 19 назв. — англ. |
| series |
Condensed Matter Physics |
| work_keys_str_mv |
AT zolotaryukav solitonandratchetmotionsinhelices AT christiansenpl solitonandratchetmotionsinhelices AT nordeb solitonandratchetmotionsinhelices AT savinav solitonandratchetmotionsinhelices |
| first_indexed |
2023-10-18T20:36:54Z |
| last_indexed |
2023-10-18T20:36:54Z |
| _version_ |
1796150661441650688 |