Молекулярний докінг похідних 1,3-оксазолу в активному центрі тубуліну

• Дата: 2017
• Автори: Семенюта, І.В., Танчук, В.Ю., Лобко, Є.О., Метелиця, Л.О.
• Формат: Стаття
• Мова: Ukrainian
• Опубліковано: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2017
• Назва видання: Доповіді НАН України
• Теми: Біохімія
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/126342
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Молекулярний докінг похідних 1,3-оксазолу в активному центрі тубуліну / І.В. Семенюта, В.Ю. Танчук, Є.О. Лобко, Л.О. Метелиця // Доповіді Національної академії наук України. — 2017. — № 1. — С. 103-108. — Бібліогр.: 13 назв. — укр.

Досліджено in silico вплив похідних 1,3-оксазолу на колхіцинзв'язуючий сайт (КЗС) β-тубуліну, проведено молекулярний докінг похідних 1,3-оксазолу в КЗС β-тубуліну та наведено результати аналізу ліганд-рецепторних комплексів. Створено адекватну модель КЗС Б-субодиниці β-тубуліну, яку перевірено редокінгом колхіцину в КЗС і отримано стабільний ліганд-білковий комплекс (Езв = –8,1 ккал/моль, RMSD = 1,2042 Å). Методом молекулярного докінгу обгрунтовано високу цитотоксичну активність сполук 1, 3 та 4, які утворюють стійкі ліганд-білкові комплекси (Езв = –7,7, –5,5, –6,2, –5,8 ккал/моль). Показано, що ці сполуки зв'язуються з амінокислотними залишками КЗС, подібно до колхіцину, за допомогою водневих зв'язків та π—σ зв'язків. Отримані результати дають підставу рекомендувати сполуки 1, 3 і 4 для подальшого вивчення як перспективних антимітотичних агентів.