2025-02-23T13:18:09-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: Query fl=%2A&wt=json&json.nl=arrarr&q=id%3A%22irk-123456789-126471%22&qt=morelikethis&rows=5
2025-02-23T13:18:09-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: => GET http://localhost:8983/solr/biblio/select?fl=%2A&wt=json&json.nl=arrarr&q=id%3A%22irk-123456789-126471%22&qt=morelikethis&rows=5
2025-02-23T13:18:09-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: <= 200 OK
2025-02-23T13:18:09-05:00 DEBUG: Deserialized SOLR response
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов
Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединени...
Saved in:
Main Authors: | , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | Russian |
Published: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2012
|
Series: | Цитология и генетика |
Subjects: | |
Online Access: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/126471 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
id |
irk-123456789-126471 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-1264712017-11-25T03:03:09Z Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов Демчук, О.Н. Карпов, П.А. Блюм, Я.Б. Оригинальные работы Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединений различных классов на поверхности FtsZ белка из Arabidopsis thaliana. Идентифицировано несколько потенциальных сайтов связывания бензимидазолов с растительным FtsZ. Наводиться огляд та аналіз можливостей застосування технології CUDA для прискорення обчислень в галузі структурної біології та біоінформатики. На прикладі роботи з програмою Hex 6.1 здійснено порівняльний аналіз приросту продуктивності та якості результатів жорсткого докінгу низькомолекулярних сполук різних класів на поверхні FtsZ-білка із Arabidopsis thaliana. Ідентифіковано декілька потенційних сайтів зв’язування бензімідазолів із рослинним FtsZ. The opportunities to apply the CUDA technology for faster computations in structural biology and bioinformatics are reviewed and analyzed. Using HEX 6.1 software, we performed a comparative analysis of the efficiency and the increase in quality after CUDA application. The work was conducted on the example of rigid docking of low-molecular-weight compounds of different classes on the surface of the Arabidopsis thaliana FtsZ. Several potential binding sites of benzimidazoles to the plant FtsZ were identified. 2012 Article Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. 0564-3783 DOI: 10.3103/S0095452712030048 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/126471 577.112.7(577.332+004.42) ru Цитология и генетика Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
Russian |
topic |
Оригинальные работы Оригинальные работы |
spellingShingle |
Оригинальные работы Оригинальные работы Демчук, О.Н. Карпов, П.А. Блюм, Я.Б. Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов Цитология и генетика |
description |
Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединений различных классов на поверхности FtsZ белка из Arabidopsis thaliana. Идентифицировано несколько потенциальных сайтов связывания бензимидазолов с растительным FtsZ. |
format |
Article |
author |
Демчук, О.Н. Карпов, П.А. Блюм, Я.Б. |
author_facet |
Демчук, О.Н. Карпов, П.А. Блюм, Я.Б. |
author_sort |
Демчук, О.Н. |
title |
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов |
title_short |
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов |
title_full |
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов |
title_fullStr |
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов |
title_full_unstemmed |
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов |
title_sort |
докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного ftsz-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов |
publisher |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України |
publishDate |
2012 |
topic_facet |
Оригинальные работы |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/126471 |
citation_txt |
Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. |
series |
Цитология и генетика |
work_keys_str_mv |
AT demčukon dokingnizkomolekulârnyhligandovnamolekulerastitelʹnogoftszbelkaprimenenietehnologiicudadlâuskoreniârasčetov AT karpovpa dokingnizkomolekulârnyhligandovnamolekulerastitelʹnogoftszbelkaprimenenietehnologiicudadlâuskoreniârasčetov AT blûmâb dokingnizkomolekulârnyhligandovnamolekulerastitelʹnogoftszbelkaprimenenietehnologiicudadlâuskoreniârasčetov |
first_indexed |
2023-10-18T20:50:53Z |
last_indexed |
2023-10-18T20:50:53Z |
_version_ |
1796151264542720000 |