Структурные механизмы взаимодействия цианоакрилатов с тубулином растений

• Дата: 2014
• Автори: Ныпорко, А.Ю., Блюм, Я.Б.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2014
• Назва видання: Цитология и генетика
• Теми: Оригинальные работы
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/126613
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Структурные механизмы взаимодействия цианоакрилатов с тубулином растений / А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 10-17. — Бібліогр.: 31 назв. — рос.

Структурные механизмы, обусловливающие специфическое связывание соединений цианоакрилатной природы тубулином высших растений, исследованы на примере взаимодействия этил-(2Z)-3-амино-2-циано-4-этилгекса-2-еноата (СА1) и изопропил-(2Z)-3-амино-2-циано-4-этилгекса-2-еноата (СА2) с α-тубулином Arabidopsis thaliana. Выявлено, что цианогруппа в составе цианоакрилатов является функциональным аналогом нитрильной группы, определяющей процессы специфического взаимодействия с тубулином растений у динитроанилиновых соединений. На основании данных флуктуации пространственной структуры, динамики водородных связей и энергии взаимодействия СА1 и СА2 выявлен наиболее вероятный тип связывания этих соединений с растительным α-тубулином и охарактеризован соответствующий сайт взаимодействия. При этом 7 из 10 остатков в составе этого сайта (Глн-133, Асн-249, Вал-250, Асп-251, Вал-252, Асн-253 и Глу-254) являются облигатными компоненттами сайта связывания динитроанилинов на поверхности α-тубулина растений. Таким образом, охарактеризованный нами сайт связывания на поверхности α-тубулина способен распознавать и специфически связывать вещества, кардинально отличные по своей химической природе и не имеющие общих фармакофорных групп, при условии определенного сходства их электростатической топологии.