Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar
В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹ получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ado выдерж...
Збережено в:
| Дата: | 2015 |
|---|---|
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
2015
|
| Назва видання: | Физика низких температур |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/128241 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-128241 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1282412018-01-08T03:03:54Z Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. Низкотемпературная оптическая спектроскопия В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹ получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ado выдерживает длительное испарение при температуре 465 К без термического разложения. Установлены структуры пяти основных конформеров, которые фиксируются в Ar матрицах при 6 К. Обнаружены анти-конформеры Ado с внутримолекулярной водородной связью O2’H–N3. Заселенность этих анти-конформеров более чем в полтора раза превышает заселенность син-конформеров с внутримолекулярной водородной связью O5’H–N3. В низкотемпературных матрицах большинство доминантных конформеров фиксируется с C2’-эндо структурой рибозного кольца. Подобно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформеры Ado с внутримолекулярными водородными связями O3’H–O5’ или O5’H– O3’ не были обнаружены. У діапазоні 3800–400 см⁻¹ з розділенням 0,3 см⁻¹ отримані ІЧ фур’є-спектри молекул аденозину (Ado), ізольованих у низькотемпературних матрицях Ar. Квантово-механічними методами MP2 та DFT/B3LYP проведено розрахунки основних структурних ізомерів Ado. Показано, що Ado витримує тривале випаровування при температурі 465 К без термічного розкладу. Встановлено структури п’яти основних конформерів, які фіксуються у Ar матрицях при 6 К. Виявлено анті-конформери Ado з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O2’H–N3. Заселеність цих анті-конформерів Ado більш ніж у півтори рази перевищує заселеність син-конформерів з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O5’H–N3. У низькотемпературних матрицях більшість домінантних конформерів фіксується з C2’-ендо структурою рибозного кільця. Подібно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформери Ado з внутрішньомолекулярними водневими зв’язками O3’H–O5’або O5’H–O3’ не було виявлено. The FTIR spectra of adenosine (Ado) molecules isolated in low temperature Ar matrices were obtained in the range of 3800–400 cm⁻¹ with resolution 0.3 cm⁻¹ . The populations of main structural isomers of Ado were estimated by using of the MP2 and DFT/B3LYP methods of quantum-mechanical calculations. It was shown that Ado may be evaporated over a long period at 465 K without thermodestruction. The structures of the five main Ado conformations were established. The Ado anti-conformers with intramolecular H-bond O2’H–N3 were found. The population of these Ado anti-conformers is more by a factor of 1.5 than synconformers intramolecular H-bond O5’H–N3. The majority of Ado dominant conformers are frozen in low temperature matrices with C2’-endo structure of the ribose ring. Like the 2”-deoxyadenosine (dA), the Ado conformers with the intramolecular H-bond O3’H–O5’ or O5’H–O3’ were not found. 2015 Article Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос. 0132-6414 PACS: 33.15.–e, 33.20.Ea http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/128241 ru Физика низких температур Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Низкотемпературная оптическая спектроскопия Низкотемпературная оптическая спектроскопия |
| spellingShingle |
Низкотемпературная оптическая спектроскопия Низкотемпературная оптическая спектроскопия Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar Физика низких температур |
| description |
В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹
получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ado выдерживает длительное испарение при температуре 465 К без термического
разложения. Установлены структуры пяти основных конформеров, которые фиксируются в Ar матрицах
при 6 К. Обнаружены анти-конформеры Ado с внутримолекулярной водородной связью O2’H–N3. Заселенность этих анти-конформеров более чем в полтора раза превышает заселенность син-конформеров с
внутримолекулярной водородной связью O5’H–N3. В низкотемпературных матрицах большинство доминантных конформеров фиксируется с C2’-эндо структурой рибозного кольца. Подобно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформеры Ado с внутримолекулярными водородными связями O3’H–O5’ или O5’H–
O3’ не были обнаружены. |
| format |
Article |
| author |
Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. |
| author_facet |
Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. |
| author_sort |
Иванов, А.Ю. |
| title |
Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_short |
Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_full |
Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_fullStr |
Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_full_unstemmed |
Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_sort |
конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах ar |
| publisher |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України |
| publishDate |
2015 |
| topic_facet |
Низкотемпературная оптическая спектроскопия |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/128241 |
| citation_txt |
Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос. |
| series |
Физика низких температур |
| work_keys_str_mv |
AT ivanovaû konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT rubinûv konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT egupovsa konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT belouslf konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT karačevcevva konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar |
| first_indexed |
2023-10-18T20:54:54Z |
| last_indexed |
2023-10-18T20:54:54Z |
| _version_ |
1796151439615066112 |