Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции

Рассмотрено решение задачи реконструкции генной регуляторной сети, представленной в форме S-системы. Предложен гибридный алгоритм, основанный на методе клонального отбора. Проведены экспериментальные исследования влияния параметров гибридного алгоритма на качество решения задачи идентификации S-сист...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2017
Автори: Фефелов, А.А., Литвиненко, В.И., Таиф, М.А., Вороненко, М.А.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Міжнародний науково-навчальний центр інформаційних технологій і систем НАН та МОН України 2017
Назва видання:Управляющие системы и машины
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/132392
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции / А.А. Фефелов, В.И. Литвиненко, М.А. Таиф, М.А. Вороненко // Управляющие системы и машины. — 2017. — № 6. — С. 41-51. — Бібліогр.: 23 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-132392
record_format dspace
spelling irk-123456789-1323922018-04-20T03:03:15Z Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции Фефелов, А.А. Литвиненко, В.И. Таиф, М.А. Вороненко, М.А. Методы и средства обработки данных и знаний Рассмотрено решение задачи реконструкции генной регуляторной сети, представленной в форме S-системы. Предложен гибридный алгоритм, основанный на методе клонального отбора. Проведены экспериментальные исследования влияния параметров гибридного алгоритма на качество решения задачи идентификации S-системы. На тестовых примерах проведен сравнительный анализ предложенного алгоритма с другими аналогичными вычислительными методами. Розглянуто рішення задачі реконструкції генної регуляторної мережі, представленої у формі S-системи. Запропоновано гібридний алгоритм, заснований на методі клонального відбору. Проведено експериментальні дослідження впливу параметрів гібридного алгоритму на якість виконання задачі ідентифікації S-системи. На тестових прикладах проведено порівняльний аналіз запропонованого алгоритму з іншими аналогічними обчислювальними методами. Purpose. The aim of this work is to develop an effective hybrid method for the reconstruction of the gene regulatory networks, which will increase the rate of convergence in solving the problem of the S-system optimizing. Method. We propose a hybrid method for reconstructing the GRN. This method is based on the hybridization technology, which allows combining the best qualities of the algorithm of clonal selection and the algorithm of differential evolution. Results. We propose a hybrid method of reconstruction GRN, allowing to increase the convergence rate and accuracy of the optimization algorithm to solve the problem of identification S-system. The S-system was applied, as a computational model. Parameters and structure were calculated by using the clonal selection algorithm and algorithm differential evolution. The gene expression profiles are used as input data. They were represented by time series of changes in the expression products concentration. The experiments have shown the negative effect of the differential evolution operators application such as selection and crossover. On the other hand, a significant positive effect of mutation operator is shown, which is used in the algorithm of the differential evolution. 2017 Article Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции / А.А. Фефелов, В.И. Литвиненко, М.А. Таиф, М.А. Вороненко // Управляющие системы и машины. — 2017. — № 6. — С. 41-51. — Бібліогр.: 23 назв. — рос. 0130-5395 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/132392 574:004.2 ru Управляющие системы и машины Міжнародний науково-навчальний центр інформаційних технологій і систем НАН та МОН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
topic Методы и средства обработки данных и знаний
Методы и средства обработки данных и знаний
spellingShingle Методы и средства обработки данных и знаний
Методы и средства обработки данных и знаний
Фефелов, А.А.
Литвиненко, В.И.
Таиф, М.А.
Вороненко, М.А.
Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
Управляющие системы и машины
description Рассмотрено решение задачи реконструкции генной регуляторной сети, представленной в форме S-системы. Предложен гибридный алгоритм, основанный на методе клонального отбора. Проведены экспериментальные исследования влияния параметров гибридного алгоритма на качество решения задачи идентификации S-системы. На тестовых примерах проведен сравнительный анализ предложенного алгоритма с другими аналогичными вычислительными методами.
format Article
author Фефелов, А.А.
Литвиненко, В.И.
Таиф, М.А.
Вороненко, М.А.
author_facet Фефелов, А.А.
Литвиненко, В.И.
Таиф, М.А.
Вороненко, М.А.
author_sort Фефелов, А.А.
title Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
title_short Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
title_full Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
title_fullStr Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
title_full_unstemmed Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
title_sort реконструкция s-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции
publisher Міжнародний науково-навчальний центр інформаційних технологій і систем НАН та МОН України
publishDate 2017
topic_facet Методы и средства обработки данных и знаний
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/132392
citation_txt Реконструкция S-системы гибридным алгоритмом клонального отбора и дифференциальной эволюции / А.А. Фефелов, В.И. Литвиненко, М.А. Таиф, М.А. Вороненко // Управляющие системы и машины. — 2017. — № 6. — С. 41-51. — Бібліогр.: 23 назв. — рос.
series Управляющие системы и машины
work_keys_str_mv AT fefelovaa rekonstrukciâssistemygibridnymalgoritmomklonalʹnogootboraidifferencialʹnojévolûcii
AT litvinenkovi rekonstrukciâssistemygibridnymalgoritmomklonalʹnogootboraidifferencialʹnojévolûcii
AT taifma rekonstrukciâssistemygibridnymalgoritmomklonalʹnogootboraidifferencialʹnojévolûcii
AT voronenkoma rekonstrukciâssistemygibridnymalgoritmomklonalʹnogootboraidifferencialʹnojévolûcii
first_indexed 2023-10-18T21:04:18Z
last_indexed 2023-10-18T21:04:18Z
_version_ 1796151848702312448