Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии

Изучали вариации спектральных данных четырех представителей микроводорослей. Обнаружены существенные различия в составе их основных макромолекул. Scenedesmus obliquus (Turpin) Kütz. имеет сильные пики в областях липидов и белковых спектров, у Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick и Euglena...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Видавець:	Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України
Дата:	2017
Автори:	Сурешкумар, П., Томас, Дж., Субраманян, Дж.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України 2017
Назва видання:	Альгология
Теми:	Физиология, биохимия, биофизика
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/140270
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии / П. Сурешкумар, Дж. Томас, Дж. Субраманян // Альгология. — 2017. — Т. 27, № 4. — С. 403-414. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-140270
record_format	dspace
spelling	irk-123456789-1402702018-07-04T01:22:46Z Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии Сурешкумар, П. Томас, Дж. Субраманян, Дж. Физиология, биохимия, биофизика Изучали вариации спектральных данных четырех представителей микроводорослей. Обнаружены существенные различия в составе их основных макромолекул. Scenedesmus obliquus (Turpin) Kütz. имеет сильные пики в областях липидов и белковых спектров, у Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick и Euglena gracilis Klebs наблюдались умеренные и менее интенсивные пики во всех пяти спектральных областях. Инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье (ИК-ПФ) представляет собой спектроскопический метод высокого разрешения, способный выявить особенности макромолекулярного спектра в интактных клетках, что позволяет различать, классифицировать и идентифицировать микроорганизмы, поскольку состав их макромолекул специфичен. Иерархический кластерный анализ с использованием ИК-ПФ-спектров позволяет получить дендрограмму, отражающую четкие различия между исследуемыми штаммами в соответствии с вариациями их фенотипа. Проведен филогенетический анализ с использованием 16S рДНК этих микроагрегатных штаммов. Полученная филограмма показала ту же структуру кластеров, что и дендрограммы на основе ИК-ПФ. Сочетание филогенетического анализа и ИК-ПФ-спектров обеспечивает эффективный способ распознавания вида, а также преимущество одновременного определения биохимического состава видов. Fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy is a high-resolution spectroscopic method used in whole-organism molecular fingerprinting. This analysis helps for the characteristic determination of macromolecular spectrum in intact cells. Spectral analysis can discriminate, classify, and identify the microorganisms as composition of macromolecules is different between strains of the same species. In the present investigation, four different microalgae were studied for their variations in spectral data, which showed striking differences on their major macromolecules. Scenedesmus obliquus (Turp.) Kütz. have intense peaks in the lipids and protein spectral regions when compared to the other species. Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick and Euglena gracilis Klebs possessed moderate and less intense peaks in sub sequential order in all the five spectral regions. Using FT-IR spectra, hierarchical clustering analyses resulted in a dendrogram with clear discrimination between species according to their phenotype variations. To support this, phylogenetic analysis using 16S rDNA microbial barcode sequences of these microalgal strains was evaluated and the resulting phylogram showed the same cluster pattern as revealed by FT-IR based dendrogram. Hence, this study concludes that the combination of phylogenetic analysis and the FT-IR spectra provides an effective way of distinguishing the species as well as the advantage of simultaneous determination of biochemical composition of the species. 2017 Article Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии / П. Сурешкумар, Дж. Томас, Дж. Субраманян // Альгология. — 2017. — Т. 27, № 4. — С. 403-414. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. 0868-8540 DOI: 10.15407/alg27.04.403 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/140270 ru Альгология Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Russian
topic	Физиология, биохимия, биофизика Физиология, биохимия, биофизика
spellingShingle	Физиология, биохимия, биофизика Физиология, биохимия, биофизика Сурешкумар, П. Томас, Дж. Субраманян, Дж. Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии Альгология
description	Изучали вариации спектральных данных четырех представителей микроводорослей. Обнаружены существенные различия в составе их основных макромолекул. Scenedesmus obliquus (Turpin) Kütz. имеет сильные пики в областях липидов и белковых спектров, у Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick и Euglena gracilis Klebs наблюдались умеренные и менее интенсивные пики во всех пяти спектральных областях. Инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье (ИК-ПФ) представляет собой спектроскопический метод высокого разрешения, способный выявить особенности макромолекулярного спектра в интактных клетках, что позволяет различать, классифицировать и идентифицировать микроорганизмы, поскольку состав их макромолекул специфичен. Иерархический кластерный анализ с использованием ИК-ПФ-спектров позволяет получить дендрограмму, отражающую четкие различия между исследуемыми штаммами в соответствии с вариациями их фенотипа. Проведен филогенетический анализ с использованием 16S рДНК этих микроагрегатных штаммов. Полученная филограмма показала ту же структуру кластеров, что и дендрограммы на основе ИК-ПФ. Сочетание филогенетического анализа и ИК-ПФ-спектров обеспечивает эффективный способ распознавания вида, а также преимущество одновременного определения биохимического состава видов.
format	Article
author	Сурешкумар, П. Томас, Дж. Субраманян, Дж.
author_facet	Сурешкумар, П. Томас, Дж. Субраманян, Дж.
author_sort	Сурешкумар, П.
title	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_short	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_full	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_fullStr	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_full_unstemmed	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_sort	быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
publisher	Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України
publishDate	2017
topic_facet	Физиология, биохимия, биофизика
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/140270
citation_txt	Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии / П. Сурешкумар, Дж. Томас, Дж. Субраманян // Альгология. — 2017. — Т. 27, № 4. — С. 403-414. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
series	Альгология
work_keys_str_mv	AT sureškumarp bystryjmetododnovremennojdiskriminaciimikrovodoroslejiopredeleniâihbiohimičeskogosostavanaosnovevibracionnojspektroskopii AT tomasdž bystryjmetododnovremennojdiskriminaciimikrovodoroslejiopredeleniâihbiohimičeskogosostavanaosnovevibracionnojspektroskopii AT subramanândž bystryjmetododnovremennojdiskriminaciimikrovodoroslejiopredeleniâihbiohimičeskogosostavanaosnovevibracionnojspektroskopii
first_indexed	2023-10-18T21:22:20Z
last_indexed	2023-10-18T21:22:20Z
_version_	1796152636786868224

Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии

Репозиторії

Схожі ресурси