Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season
Aim. To perform the phylogenetic analysis of segments, encoding hemagglutinin and neuraminidase of A(H1N1) pdm influenza viruses, isolated in Ukraine. Methods. In this study the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), sequencing and phylogenetic analysis methods were used. Results. Key mutatio...
Збережено в:
| Дата: | 2013 |
|---|---|
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2013
|
| Назва видання: | Вiopolymers and Cell |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152482 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season / L.V. Leibenko, V.P. Polischuk, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 2. — С. 143-149. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-152482 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1524822019-06-12T01:26:10Z Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. Viruses and Cell Aim. To perform the phylogenetic analysis of segments, encoding hemagglutinin and neuraminidase of A(H1N1) pdm influenza viruses, isolated in Ukraine. Methods. In this study the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), sequencing and phylogenetic analysis methods were used. Results. Key mutations in amino acid sequences of proteins of Ukrainian pandemic influenza isolates were analyzed. High genetic similarity of Ukrainian and foreign pandemic isolates (99 %) was observed. Conclusions. The stability of Ukrainian isolates genes during 2009–2010 pandemic season was shown. Мета. Здійснити філогенетичний аналіз сегментів, кодуючих гемаглютинін та нейрамінідазу пандемічних вірусів грипу A(H1N1) pdm, виділених в Україні. Методи. Полімеразно-ланцюгова реакція у реальному часі (real-time RT-PCR), секвенування і філогенетичний аналіз. Результати. Проаналізовано ключові мутації в амінокислотних послідовностях поверхневих антигенів досліджуваних вірусів. Виявлено високу генетичну подібність (99 %) українських ізолятів до вірусів, виділених в інших країнах. Висновки. Показано стабільність генів українських ізолятів протягом пандемічного сезону 2009–2010 рр. Цель. Осуществить филогенетический анализ сегментов, кодирующих гемагглютинин и нейраминидазу пандемических вирусов гриппа A(H1N1)pdm, выделенных в Украине. Методы. Полимеразная цепная реакция в реальном времени (real-time RT-PCR), секвенирование и филогенетический анализ. Результаты. Проанализированы ключевые мутации в аминокислотных последовательностях поверхностных антигенов исследуемых вирусов. Выявлено высокое генетическое сходство (99 %) украинского изолятов и вирусов, выделенных в других странах. Выводы. Показана стабильность генов украинских изолятов во время пандемического сезона 2009–2010 гг. 2013 Article Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season / L.V. Leibenko, V.P. Polischuk, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 2. — С. 143-149. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000812 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152482 575.22 + 578.53 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| topic |
Viruses and Cell Viruses and Cell |
| spellingShingle |
Viruses and Cell Viruses and Cell Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season Вiopolymers and Cell |
| description |
Aim. To perform the phylogenetic analysis of segments, encoding hemagglutinin and neuraminidase of A(H1N1) pdm influenza viruses, isolated in Ukraine. Methods. In this study the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), sequencing and phylogenetic analysis methods were used. Results. Key mutations in amino acid sequences of proteins of Ukrainian pandemic influenza isolates were analyzed. High genetic similarity of Ukrainian and foreign pandemic isolates (99 %) was observed. Conclusions. The stability of Ukrainian isolates genes during 2009–2010 pandemic season was shown. |
| format |
Article |
| author |
Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. |
| author_facet |
Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. |
| author_sort |
Leibenko, L.V. |
| title |
Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_short |
Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_full |
Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_fullStr |
Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_full_unstemmed |
Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_sort |
phylogenetic analysis of influenza a(h1n1)pdm viruses isolated in ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2013 |
| topic_facet |
Viruses and Cell |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152482 |
| citation_txt |
Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season / L.V. Leibenko, V.P. Polischuk, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 2. — С. 143-149. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
| series |
Вiopolymers and Cell |
| work_keys_str_mv |
AT leibenkolv phylogeneticanalysisofinfluenzaah1n1pdmvirusesisolatedinukraineduringthe20092010pandemicseason AT polischukvp phylogeneticanalysisofinfluenzaah1n1pdmvirusesisolatedinukraineduringthe20092010pandemicseason AT mironenkoap phylogeneticanalysisofinfluenzaah1n1pdmvirusesisolatedinukraineduringthe20092010pandemicseason |
| first_indexed |
2023-05-20T17:38:52Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:38:52Z |
| _version_ |
1796153763315056640 |