Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer

Aim. The article presents the researches on the optimization of the DNA microarray data processing, which is aimed at improving the quality of object clustering. Methods. Data preprocessing was performed with program R using Bioconductor package. Modelling the clustering process was made in the soft...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2016
Автори:	Babichev, S.A., Kornelyuk, A.I., Lytvynenko, V.I., Osypenko, V.V.
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2016
Назва видання:	Вiopolymers and Cell
Теми:	Bioinformatics
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152773
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer / S.A. Babichev, A.I. Kornelyuk, V.I. Lytvynenko, V.V. Osypenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 70-79. — Бібліогр.: 16 назв. — англ.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)

Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: S. A. Babichev, та інші
Опубліковано: (2016)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)

Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

PTI-1: novel way to oncogenicity
за авторством: Vislovukh, A.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)

Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)

Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
за авторством: Dotsenko, V.A., та інші
Опубліковано: (2014)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: Rayevsky, A.V., та інші
Опубліковано: (2016)

Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)

A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
за авторством: Palchevska, O.L., та інші
Опубліковано: (2016)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)

New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
за авторством: Сліщук, Г.І., та інші
Опубліковано: (2012)

Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)

Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
за авторством: Litovkin, K.V., та інші
Опубліковано: (2008)

Molecular profiling and genomic microarrays in prostate cancer
за авторством: Golias, Ch., та інші
Опубліковано: (2007)

Comparison of microarray and sage techniques in gene expression analysis of human glioblastoma
за авторством: Kavsan, V.M., та інші
Опубліковано: (2007)

PROMETHEE filter-based method for microarray gene expression data
за авторством: T. Ouaderhman, та інші
Опубліковано: (2023)

Technology of Wavelet-Filtra¬tion of the Gene Expression Profiles in Order to Remove the Background Noise
за авторством: S. A. Babichev
Опубліковано: (2017)

Expression of cancer-associated genes in prostate tumors
за авторством: Rosenberg, E.E., та інші
Опубліковано: (2017)

Immunohistochemical evaluation of p53 expression in lung cancer of patients with paraneoplastic rheumatic syndrome
за авторством: Lysenko, S.A.
Опубліковано: (2013)

Development of gene expression panels to determine prostate cancer
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2019)

Genetic and epigenetic alterations of human chromosome 3, investigated by NotI-microarrays in seven types of epithelial cancers
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Development of gene expression panels to determine prostate cancer
за авторством: G. V. Gerashchenko, та інші
Опубліковано: (2019)

TRP genes family expression in colorectal cancer
за авторством: Sozucan, Y., та інші
Опубліковано: (2015)

TRP genes family expression in colorectal cancer
за авторством: Y. Sozucan, та інші
Опубліковано: (2015)

Recurrent neural network usage for computer-aided lung cancer detection system
за авторством: B. V. Chapaliuk, та інші
Опубліковано: (2019)

Paraneoplastic syndrome in lung cancer
за авторством: Dumansky, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Paraneoplastic syndrome in lung cancer
за авторством: Dumansky, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Expression profiling of SCN8A and NDUFC2 genes in colorectal carcinoma
за авторством: Igci, Y.Z., та інші
Опубліковано: (2015)

Expression of cancer-associated genes in prostate tumors at mRNA and protein levels
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2019)

Heterogeneity of premetastatic niches gene expression in breast cancer cells
за авторством: L. A. Tashireva, та інші
Опубліковано: (2015)

Endothelial dysfunction of vessels at lung cancer
за авторством: Yu. V. Dumanskiy, та інші
Опубліковано: (2015)

Heterogeneity of premetastatic niches gene expression in breast cancer cells
за авторством: Tashireva, L.A., та інші
Опубліковано: (2015)