Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1

Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1

ITSN1 adaptor/scaffold protein takes part in a variety of physiological and pathological cellular processes. It has a complex expression regulation and many protein partners. Aim. Characterization of the ITSN1 functioning and expression control is important for understanding its role in cell. Method...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2016
Автори: Kropyvko, S.V., Gubar, O.S., Gryaznova, T.A., Morderer, D.Ye., Gerasymchuk, D.O., Syvak, L.A., Grabovoy, A.N., Rynditch, A.V.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2016
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152823
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1 / S.V. Kropyvko, O.S. Gubar, T.A. Gryaznova, D.Ye. Morderer, D.O. Gerasymchuk, L.A. Syvak, A.N. Grabovoy, A.V. Rynditch // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 3. — С. 203-221. — Бібліогр.: 76 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-152823
record_format dspace
spelling irk-123456789-1528232019-06-14T01:26:57Z Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1 Kropyvko, S.V. Gubar, O.S. Gryaznova, T.A. Morderer, D.Ye. Gerasymchuk, D.O. Syvak, L.A. Grabovoy, A.N. Rynditch, A.V. Genomics, Transcriptomics and Proteomics ITSN1 adaptor/scaffold protein takes part in a variety of physiological and pathological cellular processes. It has a complex expression regulation and many protein partners. Aim. Characterization of the ITSN1 functioning and expression control is important for understanding its role in cell. Methods. Bioinformatic analysis, semi-quantitative expression analysis by RT-PCR, immunoprecipitation. Results. We have described and analyzed the ITSN1 promoter regions, detected ITSN1 alternatively spliced isoforms at mRNA and protein levels in different cancer specimens. By means of different bioinformatic servers, we have identified the sites for miRNA binding and analyzed the sites for serine, threonine and tyrosine phosphorylation of the ITSN1 protein. Conclusions. We have obtained new data on the ITSN1 expression in pathology. We have also shown the possibility of ITSN1 expression regulation by miRNA and phosphorylation of serine, threonine and tyrosine. ITSN1 – адаптерний/скафолдний білок який приймає участь у різноманітних фізіологічних та патологічних клітинних процесах. Він має складну регуляцію експресії та багаточисельні білки партнери. Мета. Характеристика функціонування та регуляції експресії ITSN1 має важливе значення для розуміння ролі ITSN1 в житті клітини. Методи. Біоінформатичний аналіз, напівкількісний аналіз експресії за допомогою ЗТ-ПЛР, іммунопреципітація. Результати. Описано та проаналізовано промоторні регіони ITSN1, детектовано альтернативно сплайсовані ізоформи ITSN1 на рівні мРНК та білка в різних зразках раку. За допомогою різноманітних біоінформатичних серверів виявлено сайти зв’язування з мікроРНК, проаналізовано сайти серин-, треонін- та тирозин-фосфорилювання білка ITSN1. Висновки. Отримано нові дані про експресію ITSN1 при патологіях. Показано можливість регуляції экспресії ITSN1 за допомогою мікроРНК та ролі фосфорилювання серину, треоніну и тирозину в регуляції взаємодії ITSN1 з білками партнерами. ITSN1 – адапторный/скафолдный белок который принимает участие в различных физиологических и патологических клеточных процессах. Он имеет сложное регулирование экспрессии и многочисленные белки партнеры. Цель. Характеристика функционирования и регуляция экспрессии ITSN1 имеет важное значение для понимания роли ITSN1 в жизни клетки. Методы. Биоинформатический анализ, полуколичественный анализ экспрессии с помощью ОТ-ПЦР, иммунопреципитация. Результаты. Описано и проанализировано промоторные области ITSN1, детектировано альтернативно сплайсированные изоформы ITSN1 на уровне мРНК и белка в разных образцах рака. С помощью различных биоинформатических серверов определены сайты связывания с микроРНК, также проанализированы сайты серин-, треонин- и тирозин-фосфорилирования белка ITSN1. Выводы. Получены новые данные о экспрессии ITSN1 при патологиях. Показана возможность регуляции экспрессии ITSN1 с помощью микроРНК и потенциальной роли фосфорилирования серина, треонина и тирозина в регуляции взаимодействия ITSN1 с белками партнерами. 2016 Article Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1 / S.V. Kropyvko, O.S. Gubar, T.A. Gryaznova, D.Ye. Morderer, D.O. Gerasymchuk, L.A. Syvak, A.N. Grabovoy, A.V. Rynditch // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 3. — С. 203-221. — Бібліогр.: 76 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000921 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152823 577.218 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
spellingShingle Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Kropyvko, S.V.
Gubar, O.S.
Gryaznova, T.A.
Morderer, D.Ye.
Gerasymchuk, D.O.
Syvak, L.A.
Grabovoy, A.N.
Rynditch, A.V.
Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1
Вiopolymers and Cell
description ITSN1 adaptor/scaffold protein takes part in a variety of physiological and pathological cellular processes. It has a complex expression regulation and many protein partners. Aim. Characterization of the ITSN1 functioning and expression control is important for understanding its role in cell. Methods. Bioinformatic analysis, semi-quantitative expression analysis by RT-PCR, immunoprecipitation. Results. We have described and analyzed the ITSN1 promoter regions, detected ITSN1 alternatively spliced isoforms at mRNA and protein levels in different cancer specimens. By means of different bioinformatic servers, we have identified the sites for miRNA binding and analyzed the sites for serine, threonine and tyrosine phosphorylation of the ITSN1 protein. Conclusions. We have obtained new data on the ITSN1 expression in pathology. We have also shown the possibility of ITSN1 expression regulation by miRNA and phosphorylation of serine, threonine and tyrosine.
format Article
author Kropyvko, S.V.
Gubar, O.S.
Gryaznova, T.A.
Morderer, D.Ye.
Gerasymchuk, D.O.
Syvak, L.A.
Grabovoy, A.N.
Rynditch, A.V.
author_facet Kropyvko, S.V.
Gubar, O.S.
Gryaznova, T.A.
Morderer, D.Ye.
Gerasymchuk, D.O.
Syvak, L.A.
Grabovoy, A.N.
Rynditch, A.V.
author_sort Kropyvko, S.V.
title Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1
title_short Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1
title_full Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1
title_fullStr Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1
title_full_unstemmed Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1
title_sort transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene itsn1
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2016
topic_facet Genomics, Transcriptomics and Proteomics
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152823
citation_txt Transcriptional and posttranscriptional regulation of the adaptor/scaffold protein gene ITSN1 / S.V. Kropyvko, O.S. Gubar, T.A. Gryaznova, D.Ye. Morderer, D.O. Gerasymchuk, L.A. Syvak, A.N. Grabovoy, A.V. Rynditch // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 3. — С. 203-221. — Бібліогр.: 76 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT kropyvkosv transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT gubaros transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT gryaznovata transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT mordererdye transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT gerasymchukdo transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT syvakla transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT grabovoyan transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
AT rynditchav transcriptionalandposttranscriptionalregulationoftheadaptorscaffoldproteingeneitsn1
first_indexed 2023-05-20T17:40:00Z
last_indexed 2023-05-20T17:40:00Z
_version_ 1796153814752952320

Схожі ресурси