Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics

The karyotype of the cultivated rye (Secale cereale) is one of the complex plant genomes whose chromosomes are difficult to discriminate because of their similar size. Aim. The purpose of this study is to reveal the chromosome variable sites using DNA repetitive sequences as probes and to define a p...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2017
Автори:	Alkhimova, O.G., Zimina, O.V.
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2017
Назва видання:	Вiopolymers and Cell
Теми:	Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152915
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics / O.G. Alkhimova, O.V. Zimina // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 2. — С. 116-123. — Бібліогр.: 17 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-152915
record_format	dspace
spelling	irk-123456789-1529152019-06-14T01:24:54Z Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics Alkhimova, O.G. Zimina, O.V. Genomics, Transcriptomics and Proteomics The karyotype of the cultivated rye (Secale cereale) is one of the complex plant genomes whose chromosomes are difficult to discriminate because of their similar size. Aim. The purpose of this study is to reveal the chromosome variable sites using DNA repetitive sequences as probes and to define a possibility of sorting rye chromosomes. Methods. Flow cytometry analysis and karyotyping, chromosome sorting, fluorescence in situ hybridization and microscopy. Results. Different distribution of repetitive DNA sites between two rye accessions was demonstrated and an ability to sort chromosome 1 in the ‘Zhyttedaine’ rye variety was shown. This is the second case when chromosome 1R was sorted by flow cytometry in S. cereale. Conclusions. The present study revealed chromosome polymorphisms of microsatellite sequence GAA in accessions and the potential of chromosome sorting in S. cereale varieties. We also identified sequence elements including microsatellites and classic satellites which can be utilized for future research and in rye breeding. Каріотип жита посівного (Secale cereale) розглядається як один із складних рослинних геномів, хромосоми якого важко відрізнити через однаковий розмір хромосом. Мета. Виявлення варіабельних ділянок хромосом з викорис-танням повторюваних послідовностей ДНК в якості зондів і визначення можливості сортування хромосом у сортів жита. Методи. Проточна цитометрія і каріотипування, сортинг хромосом, флуоресцентна гібридизація in situ та мікроскопія. Результа-ти. Показано різний розподіл повторюваних послідовностей ДНК між двома сортами жита і здатність до сортингу хромосоми 1 у жита ‘Життєдайне’. Вдруге продемонстровано можливість сортувати хромо-сому 1R методом проточної цитометрії у жита S. cereale. Висновки. Дослідження виявило хромосомний полімор-фізм микросателітної послідовності GAA у сортів жита і потенційну можливість сортингу хромосом у Secale, і показало, що мікросателіти і класичні сателіти можуть бути використані у подальших дослідженнях, а також в селекції жита. Кариотип ржи посевной (Secale cereale) рассматривается в качестве одного из самых сложных растительных геномов, хромосомы которого трудно различить ввиду одинакового размера. Цель. Выявление вариабельных участков хромосом с помощью повторяющихся последовательностей ДНК в качестве зондов и определение возможности сортинга хромосом у сортов ржи. Методы. Проточная цитометрия и кариотипирование, сортинг хромосом, флуоресцентная гибридизация in situ и микроскопия. Результаты. Различное распределение повторяющихся последовательностей ДНК продемонстрировано у двух сортов ржи и показана возможность сортинга хромосомы 1 у ржи ‘Життедайне’. Это второй случай, когда хромосома 1R была сортирована методом проточной цитометрии у ржи S. cereale. Выводы. Настоящее исследование выявило хромосомный полиморфизм микросателлитной последовательности GAA у сортов ржи и потенциальную возможность сортинга хромосом у Secale и показало возможность использования микросателлитов и классических сателлитов для дальнейших исследований, а также в селекции ржи. 2017 Article Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics / O.G. Alkhimova, O.V. Zimina // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 2. — С. 116-123. — Бібліогр.: 17 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000949 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152915 576.316 + 575.11 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	English
topic	Genomics, Transcriptomics and Proteomics Genomics, Transcriptomics and Proteomics
spellingShingle	Genomics, Transcriptomics and Proteomics Genomics, Transcriptomics and Proteomics Alkhimova, O.G. Zimina, O.V. Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics Вiopolymers and Cell
description	The karyotype of the cultivated rye (Secale cereale) is one of the complex plant genomes whose chromosomes are difficult to discriminate because of their similar size. Aim. The purpose of this study is to reveal the chromosome variable sites using DNA repetitive sequences as probes and to define a possibility of sorting rye chromosomes. Methods. Flow cytometry analysis and karyotyping, chromosome sorting, fluorescence in situ hybridization and microscopy. Results. Different distribution of repetitive DNA sites between two rye accessions was demonstrated and an ability to sort chromosome 1 in the ‘Zhyttedaine’ rye variety was shown. This is the second case when chromosome 1R was sorted by flow cytometry in S. cereale. Conclusions. The present study revealed chromosome polymorphisms of microsatellite sequence GAA in accessions and the potential of chromosome sorting in S. cereale varieties. We also identified sequence elements including microsatellites and classic satellites which can be utilized for future research and in rye breeding.
format	Article
author	Alkhimova, O.G. Zimina, O.V.
author_facet	Alkhimova, O.G. Zimina, O.V.
author_sort	Alkhimova, O.G.
title	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics
title_short	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics
title_full	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics
title_fullStr	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics
title_full_unstemmed	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics
title_sort	identification of rye chromosomes by flow cytogenetics
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate	2017
topic_facet	Genomics, Transcriptomics and Proteomics
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152915
citation_txt	Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics / O.G. Alkhimova, O.V. Zimina // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 2. — С. 116-123. — Бібліогр.: 17 назв. — англ.
series	Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv	AT alkhimovaog identificationofryechromosomesbyflowcytogenetics AT ziminaov identificationofryechromosomesbyflowcytogenetics
first_indexed	2023-05-20T17:40:22Z
last_indexed	2023-05-20T17:40:22Z
_version_	1796153827105177600

Identification of rye chromosomes by flow cytogenetics

Репозитарії

Схожі ресурси