Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA

Aim. To determine the similarity and dissimilarity of the nucleotide sequences of the S. globisporus 1912-2 chromosome and primary structures of genomes of some Streptomycetes strains. Methods. NCBI tools (BLAST: blastn and bl2seq: megablast) and Internet NCBI databases (Genome, Nucleotide) were use...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2017
Автор:	Polishchuk, L.V.
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2017
Назва видання:	Вiopolymers and Cell
Теми:	Bioinformatics
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152932
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA / L.V. Polishchuk // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 3. — С. 206-213. — Бібліогр.: 29 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
за авторством: Dotsenko, V.A., та інші
Опубліковано: (2014)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: Rayevsky, A.V., та інші
Опубліковано: (2016)

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)

Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)

A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
за авторством: Palchevska, O.L., та інші
Опубліковано: (2016)

Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)

Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)

Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)

New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
за авторством: Сліщук, Г.І., та інші
Опубліковано: (2012)

Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)

PTI-1: novel way to oncogenicity
за авторством: Vislovukh, A.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Similarity of Genomic Sequences of Five Streptomyces globisporus Strains
за авторством: L. V. Polishchuk
Опубліковано: (2020)

Genomes Identity of Streptomyces globisporus 1912-4Crt, Streptomyces globisporus C-1027, Streptomyces sp. TUE6075 and Streptomyces sp. S063
за авторством: B. P. Matseliukh
Опубліковано: (2019)

Homology of Primary Structures of the Beta-Galactosidase Gene of Streptomyces globisporus 1912 and Similar Genes of Streptomycetes
за авторством: L. V. Polishchuk, та інші
Опубліковано: (2019)

Identification of Consanguinity of the Strain Streptomyces globisporus 1912-2
за авторством: L. V. Polishchuk, та інші
Опубліковано: (2017)

In silico seaching of Streptomyces globisporus 1912-2 gvp-clasters
за авторством: L. V. Polishchuk
Опубліковано: (2015)

Difference in sequences of the Streptomyces globisporus 1912 and 2 its mutants
за авторством: L. V. Polishchuk
Опубліковано: (2020)

Genes of Streptomyces globisporus 1912-4Crt Encoding Chitin Catabolism Enzymes
за авторством: Polishchuk, L.V., та інші
Опубліковано: (2024)

Chromosomal fragment from Streptomyces globisporus 1912-2 homologous to afsA-gene of S. griseus NBRC 13350
за авторством: L. V. Polishchuk
Опубліковано: (2015)

Cloning of sequence of homologous crt-cluster in Streptomyces globisporus 1912-bp
за авторством: V. V. Lukianchuk, та інші
Опубліковано: (2018)

Phenotypic traits variability in Streptomyces globisporus 1912–b/p transfotmants
за авторством: L. V. Polishchuk, та інші
Опубліковано: (2012)

Molecular mechanism of the carotenoid biosynthesis activation in the producer Streptomyces globisporus 1912
за авторством: B. P. Matselyukh, та інші
Опубліковано: (2014)

In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2
за авторством: Поліщук, Л.В.
Опубліковано: (2015)

Виділення і рестрикційний аналіз двох плазмід Streptomyces globisporus 1912
за авторством: Мацелюх, Б.П., та інші
Опубліковано: (1998)

Complete sequence of Landomycin E biosynthetic gene cluster from Streptomyces Globisporus 1912
за авторством: B. P. Matselyukh, та інші
Опубліковано: (2015)

Nucleotide sequences of tRNA-methionine genes of streptomyces globisporus 1912-2, identified in silico
за авторством: L. V. Polishchuk
Опубліковано: (2016)

Поиск in silico у актиномицетов паттернов, гомологичных LndJ-белку Streptomyces globisporus 1912
за авторством: Полищук, Л.В., та інші
Опубліковано: (2013)

Sequences Similar to the lan-Cluster (Streptomyces cyanogenus S136) Were Found in the Genomes of Other Streptomycetes
за авторством: Polishchuk, L.V., та інші
Опубліковано: (2023)

Sequences of Landomycin E and Carotenoid Biosynthetic Gene Clusters, and Molecular Structure of Transcriptional Regulator of Streptomyces globisporus 1912
за авторством: B. P. Matselyukh, та інші
Опубліковано: (2016)

pРНК-гены актиномицетов, гомологичные генам pРНК-кластера Streptomyces globisporus 1912-2
за авторством: Полищук, Л.В., та інші
Опубліковано: (2014)

Sequences Similar to the lan-Cluster (Streptomyces cyanogenus S136) Were Found in the Genomes of Other Streptomycetes
за авторством: L. V. Polishchuk, та інші
Опубліковано: (2023)

Isolation of Streptomyces globisporus and Blakeslea trispora Mutants with Increased Carotenoid Content
за авторством: B. P. Matselyukh, та інші
Опубліковано: (2013)