Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening

Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening

Aim. To search for new CK2 inhibitors by virtual screening. Methods. Virtual screening of a small organic compounds library was performed by molecular docking using the Autodock 4.2.6 package and pharmacophore screening with the “PharmDeveloper” program. The compound activity was determined by in vi...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2017
Автори: Protopopov, M.V., Starosyla, S.A., Borovykov, O.V., Sapelkin, V.N., Bilokin, Y.V., Bdzhola, V.G., Yarmoluk, S.M.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2017
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Bioorganic Chemistry
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152985
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening / M.V. Protopopov, S.A. Starosyla, O.V. Borovykov, V.N. Sapelkin, Y.V. Bilokin, V.G. Bdzhola, S.M. Yarmoluk // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 4. — С. 291-301. — Бібліогр.: 30 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-152985
record_format dspace
spelling irk-123456789-1529852019-06-14T01:26:13Z Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening Protopopov, M.V. Starosyla, S.A. Borovykov, O.V. Sapelkin, V.N. Bilokin, Y.V. Bdzhola, V.G. Yarmoluk, S.M. Bioorganic Chemistry Aim. To search for new CK2 inhibitors by virtual screening. Methods. Virtual screening of a small organic compounds library was performed by molecular docking using the Autodock 4.2.6 package and pharmacophore screening with the “PharmDeveloper” program. The compound activity was determined by in vitro biochemical tests using γ-P³² ATP. Results. 298 compounds were selected for biochemical testing according to the results of virtual screening. In vitro experiments showed that 18 compounds have inhibitory activity against CK2 with IC₅₀ in the range of 1.4 to 20 μM. The active compounds belonged to 15 chemical classes. Conclusions. A number of effective CK2 inhibitors were found using molecular modeling and biochemical testing methods. LE values of these compounds were higher than 0.3 that makes these compounds excellent candidates for further drug development. Мета. Пошук нових інгібіторів протеїнкінази СК2. Методи. Віртуальний скринінг бібліотеки низькомолекулярних сполук проводили методами молекулярного докінгу, програмним пакетом Autodock 4.2.6 та фармакофорного моделювання – програмою «PharmDeveloper». Активність інгібіторів визначали у біохімічних тестах in vitro (із використанням γ-P³² ATФ). Результати. За результатами віртуального скринінгу було відібрано 298 сполук для біохімі-чного тестування. Експерименти in vitro показали, що 18 сполук проявляють інгібувальну активність щодо СК2 із IC₅₀ в межах від 1.4 до 20 µМ. Активні сполуки належать до 15 хімічних класів. Висновки. За допомогою методів молекулярного моделювання та біохімічного тестування було знайдено ряд інгібіторів СК2, що мали показник LE вище 0.3 та є перспективними для подальшої оптимізації з метою створення лікарських засобів на їхній основі. Цель. Поиск новых химических соединений со способностью ингибировать протеинкиназу СК2. Методы. Виртуальный скрининг библиотеки низкомолекулярных органических соединений осуществляли при помощи методов молекулярного докинга программным пакетом Autodock 4.2.6 и фармакофорного моделирования – программой «PharmDeveloper». Активность ингибиторов изучали при помощи биохимических тестов in vitro, используя γ-P³² ATФ). Результаты. По результатам виртуального скрининга было отобрано 298 соединений для in vitro исследования. Биохимическое тестирование показало, что 18 соединений показали способность ингибировать протеинкиназу СК2 в диапазоне значений IC₅₀ от 1.4 до 20 μМ. Активные соединения являются производными от 15 химических классов. Выводы. Используя методы молекулярного моделирования и биохимического тестирования было обнаружено ряд ингибиторов протеинкиназиы СК2, со значением LE выше 0.3, которые являются перспективными для последующей оптимизации с целью разработки на их основе лекарственных средств. 2017 Article Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening / M.V. Protopopov, S.A. Starosyla, O.V. Borovykov, V.N. Sapelkin, Y.V. Bilokin, V.G. Bdzhola, S.M. Yarmoluk // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 4. — С. 291-301. — Бібліогр.: 30 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00095B http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152985 577.322 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Bioorganic Chemistry
Bioorganic Chemistry
spellingShingle Bioorganic Chemistry
Bioorganic Chemistry
Protopopov, M.V.
Starosyla, S.A.
Borovykov, O.V.
Sapelkin, V.N.
Bilokin, Y.V.
Bdzhola, V.G.
Yarmoluk, S.M.
Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening
Вiopolymers and Cell
description Aim. To search for new CK2 inhibitors by virtual screening. Methods. Virtual screening of a small organic compounds library was performed by molecular docking using the Autodock 4.2.6 package and pharmacophore screening with the “PharmDeveloper” program. The compound activity was determined by in vitro biochemical tests using γ-P³² ATP. Results. 298 compounds were selected for biochemical testing according to the results of virtual screening. In vitro experiments showed that 18 compounds have inhibitory activity against CK2 with IC₅₀ in the range of 1.4 to 20 μM. The active compounds belonged to 15 chemical classes. Conclusions. A number of effective CK2 inhibitors were found using molecular modeling and biochemical testing methods. LE values of these compounds were higher than 0.3 that makes these compounds excellent candidates for further drug development.
format Article
author Protopopov, M.V.
Starosyla, S.A.
Borovykov, O.V.
Sapelkin, V.N.
Bilokin, Y.V.
Bdzhola, V.G.
Yarmoluk, S.M.
author_facet Protopopov, M.V.
Starosyla, S.A.
Borovykov, O.V.
Sapelkin, V.N.
Bilokin, Y.V.
Bdzhola, V.G.
Yarmoluk, S.M.
author_sort Protopopov, M.V.
title Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening
title_short Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening
title_full Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening
title_fullStr Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening
title_full_unstemmed Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening
title_sort hit identification of ck2 inhibitors by virtual screening
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2017
topic_facet Bioorganic Chemistry
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/152985
citation_txt Hit identification of CK2 inhibitors by virtual screening / M.V. Protopopov, S.A. Starosyla, O.V. Borovykov, V.N. Sapelkin, Y.V. Bilokin, V.G. Bdzhola, S.M. Yarmoluk // Вiopolymers and Cell. — 2017. — Т. 33, № 4. — С. 291-301. — Бібліогр.: 30 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT protopopovmv hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
AT starosylasa hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
AT borovykovov hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
AT sapelkinvn hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
AT bilokinyv hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
AT bdzholavg hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
AT yarmoluksm hitidentificationofck2inhibitorsbyvirtualscreening
first_indexed 2023-05-20T17:40:50Z
last_indexed 2023-05-20T17:40:50Z
_version_ 1796153837179895808

Схожі ресурси