Конформационные переходы поли (С) и поли(сІС): исследование методом протонной буферной емкости

• Дата: 2000
• Автори: Зарудная, М.И., Потягайло, А.Л., Говорун, Д,Н.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2000
• Назва видання: Биополимеры и клетка
• Теми: Структура и функции биополимеров
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153619
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Конформационные переходы поли (С) и поли(сІС): исследование методом протонной буферной емкости / М.И. Зарудная, А.Л. Потягайло, Д.Н. Говорун // Биополимеры и клетка. — 2000. — Т. 16, № 6. — С. 495-504. — Бібліогр.: 46 назв. — рос.

По литературным данным рассчитаны кривые протонной буферной емкости поли(С) (при 0,1 М Na⁺) и поли(dC) (при 0,05 М Na⁺). Проведено их разложение по базисным функциям, соответст­вующим ионизации атомных групп с одинаковыми значениями рК. Обнаружено, что кривая протонной буферной емкости поли(С) имеет четыре пика – два узких и два широких. Первый узкий пик (рК-5,6) отождествлен с кооперативным процессом образования двойных спиралей, индуцируемым протонированием нуклеотидных оснований по атому азота N3. Второй узкий пик (рК=2,9) отнесен к кооперативному распаду этих спиралей. Первый широкий пик (рК-5,3) соответствует некооперативному протонированию двойных спиралей поли(С) по атомам азота N3, частично экспонированных в раствор цитидиновых оснований. Второй широкий пик (рК= 3,1) отнесен к некооперативному протонированию электронейтральных цитидиновых оснований по атому кислорода с цис-ориентацией присоединенного протона относительно гликозидной связи. Эта реакция приводит к уменьшению термодинамической стабильности двойных спиралей поли(С) и, в конечном счете, к их диссоциации. Обсуждаются также конформационные переходы поли(йС), индуцированные его протонированием.