Моделирование пространственной структуры СООН-концевого цитокин-подобного модуля цитоплазматической тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих

• Дата: 2000
• Автори: Голуб, А.Г., Одынец, К.А., Ныпорко, А.Ю., Корнелюк, А.И.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2000
• Назва видання: Биополимеры и клетка
• Теми: Структура и функции биополимеров
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153624
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Моделирование пространственной структуры СООН-концевого цитокин-подобного модуля цитоплазматической тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих / А.Г. Голуб, К.А. Одынец, А.Ю. Ныпорко, А.И. Корнелюк // Биополимеры и клетка. — 2000. — Т. 16, № 6. — С. 515-524. — Бібліогр.: 49 назв. — рос.

СООН-концевой модуль (С-модуль) цитоплазматических тирозил-тРНК синтетаз хордовых и насекомых гомологичен цитокину ЕМАР II млекопитающих (52,7 % идентичности) и в свободном состоянии обладает сходными биологическими свойствами в экспериментах in vitro. С использованием методов сравнительного моделирования по гомологии создана модель пространственной структуры С-модуля тирозил-тРНК синтетазы быка (Bos taurus). Основной частью С-модуля является домен с типом пространственной укладки ЮВ-fold» (В-домен, остатки Val363-Lys470)t содержащий пять β-складок, характерных для этого типа укладки. Подобно ряду «ОВ-fold»-доменов С-модуль имеет сродство к нуклеиновым кислотам. Сравнение модели С-моду­ля с антикодон-связывающими «ОВ-fold»-доменами аспартил- и лизил-тРНК синтетаз позволило предсказать поверхность взаимодействия с РНК и возможные функционально важные аминокислотные остатки. Структурная модель С-модуля является основой для дальнейшего изучения структуры и функций тирозил-тРНК синтетазы, ее взаимодействия с тРНКТуr, а также цитокин-подобных свойств свободного С-модуля.