EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine

Aim. Analysis the EPHA1 gene G1475A and G1891A alleles distribution in the population of Ukraine, and to study the protein secondary structure as the first step in the investigation of EPHA1 gene involvement in intellectual disability pathogenesis. Methods. Observation group consisted of 300 individ...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2013
Автори: Gulkovskyi, R.V., Chernushyn, S.Y., Kravchenko, S.A., Bychkova, G.M., Livshits, L.A.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2013
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153675
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine / R.V. Gulkovskyi, S.Y. Chernushyn, S.A. Kravchenko, G.M. Bychkova, L.A. Livshits // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 506-510. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-153675
record_format dspace
spelling irk-123456789-1536752019-06-15T01:27:43Z EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine Gulkovskyi, R.V. Chernushyn, S.Y. Kravchenko, S.A. Bychkova, G.M. Livshits, L.A. Biomedicine Aim. Analysis the EPHA1 gene G1475A and G1891A alleles distribution in the population of Ukraine, and to study the protein secondary structure as the first step in the investigation of EPHA1 gene involvement in intellectual disability pathogenesis. Methods. Observation group consisted of 300 individuals, including 164 (54.6 %) male and 136 (45.3 %) female individuals. Polymorphic variants were detected using PCR followed by Kpn1 RFLP analysis for G1475A and ARMS PCR analysis for G1891A. Results. The data concerning EPHA1 genotypes and allelic variants distribution were obtained. The low frequency of 1475A allele (0,012) and the absence of 1891A allele (not previously described) were revealed in the population of Ukrainian. Conclusions. Assays for the detection of EPHA1 gene G1475A and G1891A SNPs based on ARMS and restriction analysis were developed and the preliminary data on distribution of G1475A and G1891A polymorphisms in the population of Ukraine were obtained. Мета. Аналіз розподілу алельних варіантів поліморфізмів G1475A і G1891A гена EPHA1 у популяції України та вивчення вторинної структури білка як перший етап визначення ролі гена EPHA1 у патогенезі інтелектуальної недієздатності. Методи. Алельні варіанти SNP для G1475A і G1891A досліджували методами ПЛР- ПДРФ та алель-специфічної ПЛР відповідно. Результати. Отримано дані стосовно розподілу генотипів і алельних варіантів гена EPHA1. Виявлено низьку частоту алеля 1475A (0,012) та відсутність алеля 1891A в популяції України. Висновки. Створено методики детекції замін G1475A і G1891A в гені EPHA1 та проведено попередні дослідження розподілу поліморфізмів G1475A і G1891A у популяції Україні. Цель. Анализ распределения аллельных вариантов полиморфизмов G1475A и G1891A гена EPHA1 в популяции Украины и изучение вторичной структуры белка как первый этап определения роли гена EPHA1 в патогенезе интеллектуальной недееспособности. Методы. Аллельные варианты SNP для G1475A и G1891A исследовали методами ПЦР-ПДРФ и аллель-специфической ПЦР соотетственно. Результаты. Получены данные относительно распределения генотипов и аллельных вариантов гена EPHA1. Выявлена низкая частота аллеля 1475A (0,012) и отсутствие аллеля 1891A в популяции Украины. Выводы. Созданы методики обнаружения замен G1475A и G1891A в гене EPHA1 и проведены предварительные исследования распределения полиморфизмов G1475A и G1891A в популяции Украины. 2013 Article EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine / R.V. Gulkovskyi, S.Y. Chernushyn, S.A. Kravchenko, G.M. Bychkova, L.A. Livshits // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 506-510. — Бібліогр.: 15 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000841 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153675 577.11 + 577.21 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Biomedicine
Biomedicine
spellingShingle Biomedicine
Biomedicine
Gulkovskyi, R.V.
Chernushyn, S.Y.
Kravchenko, S.A.
Bychkova, G.M.
Livshits, L.A.
EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine
Вiopolymers and Cell
description Aim. Analysis the EPHA1 gene G1475A and G1891A alleles distribution in the population of Ukraine, and to study the protein secondary structure as the first step in the investigation of EPHA1 gene involvement in intellectual disability pathogenesis. Methods. Observation group consisted of 300 individuals, including 164 (54.6 %) male and 136 (45.3 %) female individuals. Polymorphic variants were detected using PCR followed by Kpn1 RFLP analysis for G1475A and ARMS PCR analysis for G1891A. Results. The data concerning EPHA1 genotypes and allelic variants distribution were obtained. The low frequency of 1475A allele (0,012) and the absence of 1891A allele (not previously described) were revealed in the population of Ukrainian. Conclusions. Assays for the detection of EPHA1 gene G1475A and G1891A SNPs based on ARMS and restriction analysis were developed and the preliminary data on distribution of G1475A and G1891A polymorphisms in the population of Ukraine were obtained.
format Article
author Gulkovskyi, R.V.
Chernushyn, S.Y.
Kravchenko, S.A.
Bychkova, G.M.
Livshits, L.A.
author_facet Gulkovskyi, R.V.
Chernushyn, S.Y.
Kravchenko, S.A.
Bychkova, G.M.
Livshits, L.A.
author_sort Gulkovskyi, R.V.
title EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine
title_short EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine
title_full EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine
title_fullStr EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine
title_full_unstemmed EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine
title_sort epha1 gene snps analysis in population of ukraine
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2013
topic_facet Biomedicine
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153675
citation_txt EPHA1 gene SNPs analysis in population of Ukraine / R.V. Gulkovskyi, S.Y. Chernushyn, S.A. Kravchenko, G.M. Bychkova, L.A. Livshits // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 506-510. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT gulkovskyirv epha1genesnpsanalysisinpopulationofukraine
AT chernushynsy epha1genesnpsanalysisinpopulationofukraine
AT kravchenkosa epha1genesnpsanalysisinpopulationofukraine
AT bychkovagm epha1genesnpsanalysisinpopulationofukraine
AT livshitsla epha1genesnpsanalysisinpopulationofukraine
first_indexed 2023-05-20T17:42:34Z
last_indexed 2023-05-20T17:42:34Z
_version_ 1796153910878011392