Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA

Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA

Aim. To study new cyanine dye LO-7 as a reagent for dsDNA visualization in electrophoretic gels. Methods. Gel electrophoresis, restriction, fluorescence detection, mobility shift assay. Results. LO-7 binds to DNA to form stable highly fluorescent complexes. As little as 80 pg DNA can be detected in...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2013
Автори: Didan, Yu.V., Kryvorotenko, D.V., Negrutska, V.V., Dubey, I.Ya.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2013
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Bioorganic Chemistry
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153676
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA / Yu.V. Didan, D.V. Kryvorotenko, V.V. Negrutska, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 511-514. — Бібліогр.: 13 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-153676
record_format dspace
spelling irk-123456789-1536762019-06-15T01:29:21Z Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA Didan, Yu.V. Kryvorotenko, D.V. Negrutska, V.V. Dubey, I.Ya. Bioorganic Chemistry Aim. To study new cyanine dye LO-7 as a reagent for dsDNA visualization in electrophoretic gels. Methods. Gel electrophoresis, restriction, fluorescence detection, mobility shift assay. Results. LO-7 binds to DNA to form stable highly fluorescent complexes. As little as 80 pg DNA can be detected in LO-7-stained agarose gel using a laser scanner, and 0.3 ng with UV-transilluminator. This sensitivity is several times higher than can be achieved with ethidium bromide, and close to that of SYBR Green I. Conclusions. LO-7 belongs to the most efficient stains for dsDNA visualization and thus can be used in bioanalytical applications where high sensitivity is required. Мета. Дослідження нового ціанінового барвника LO-7 як реагента при візуалізації дволанцюгової ДНК в електрофоретичних гелях. Методи. Гель-електрофорез, рестрикція, флуоресцентна детекція, mobility shift (зміна електрофоретичної рухливості). Результати. LO-7 зв’язується з ДНК, утворюючи стійкі високофлуоресцентні комплекси. У пофарбованих ним агарозних гелях можна визначати ~ 80 пг ДНК за допомогою лазерного сканера і 0,3 нг – за використання УФ-трансілюмінатора. Подібна чутливість у кілька разів вища, ніж у бромистого етидію, і близька до такої для SYBR Green I. Висновки. LO-7 належить до найефективіших барвників для візуалізації дволанцюгової ДНК і може застосовуватись при вирішенні біоаналітичних завдань, де необхідна висока чутливість. Цель. Изучение нового цианинового красителя LO-7 как реагента при визуализации двухцепочечной ДНК в электрофоретических гелях. Методы. Гель-электрофорез, рестрикция, флуоресцентная детекция, mobility shift (изменение электро- форетической подвижности). Результаты. LO-7 связывается с ДНК, образуя устойчивые высокофлуоресцентные комплексы. В окрашенных им агарозных гелях можно определить ~ 80 пг ДНК при помощи лазерного сканера и 0,3 нг – при использовании УФ-трансиллюминатора. Подобная чувствительность в несколько раз выше, чем у бромистого этидия, и близка к таковой для SYBR Green I. Выводы. LO-7 принадлежит к наиболее эффективным красителям для визуализации двухцепочечной ДНК и может применяться для решения биоаналитических задач, где необходима высокая чувствительность. 2013 Article Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA / Yu.V. Didan, D.V. Kryvorotenko, V.V. Negrutska, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 511-514. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000842 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153676 577.113 + 577.336 + 543.545.2 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Bioorganic Chemistry
Bioorganic Chemistry
spellingShingle Bioorganic Chemistry
Bioorganic Chemistry
Didan, Yu.V.
Kryvorotenko, D.V.
Negrutska, V.V.
Dubey, I.Ya.
Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
Вiopolymers and Cell
description Aim. To study new cyanine dye LO-7 as a reagent for dsDNA visualization in electrophoretic gels. Methods. Gel electrophoresis, restriction, fluorescence detection, mobility shift assay. Results. LO-7 binds to DNA to form stable highly fluorescent complexes. As little as 80 pg DNA can be detected in LO-7-stained agarose gel using a laser scanner, and 0.3 ng with UV-transilluminator. This sensitivity is several times higher than can be achieved with ethidium bromide, and close to that of SYBR Green I. Conclusions. LO-7 belongs to the most efficient stains for dsDNA visualization and thus can be used in bioanalytical applications where high sensitivity is required.
format Article
author Didan, Yu.V.
Kryvorotenko, D.V.
Negrutska, V.V.
Dubey, I.Ya.
author_facet Didan, Yu.V.
Kryvorotenko, D.V.
Negrutska, V.V.
Dubey, I.Ya.
author_sort Didan, Yu.V.
title Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
title_short Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
title_full Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
title_fullStr Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
title_full_unstemmed Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA
title_sort lepidine orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of dna
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2013
topic_facet Bioorganic Chemistry
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153676
citation_txt Lepidine Orange derivative as a new dye for sensitive fluorescent detection of DNA / Yu.V. Didan, D.V. Kryvorotenko, V.V. Negrutska, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 6. — С. 511-514. — Бібліогр.: 13 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT didanyuv lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna
AT kryvorotenkodv lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna
AT negrutskavv lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna
AT dubeyiya lepidineorangederivativeasanewdyeforsensitivefluorescentdetectionofdna
first_indexed 2023-05-20T17:42:34Z
last_indexed 2023-05-20T17:42:34Z
_version_ 1796153910983917568

Схожі ресурси