Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК

Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2-мкм плазмидой из S. cerevisiae, имеет множественные точечные контакты с основаниями Flp-связывающего элемента ДНК. В настоящей работе проведен анализ относительного вклада контактов в прочность связывания белка Flp с ДНК и особенностей их распределени...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:1996
Автор: Возиянов, Ю.А.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1996
Назва видання:Биополимеры и клетка
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153792
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК / Ю.А. Возиянов // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 1. — С. 89-94. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-153792
record_format dspace
spelling irk-123456789-1537922019-06-15T01:30:19Z Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК Возиянов, Ю.А. Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2-мкм плазмидой из S. cerevisiae, имеет множественные точечные контакты с основаниями Flp-связывающего элемента ДНК. В настоящей работе проведен анализ относительного вклада контактов в прочность связывания белка Flp с ДНК и особенностей их распределения в большом и малом желобке ДНК. Контакты белка Flp с Flp-связывающим элементом ДНК были подразделены на три группы в зависимости от их вклада в прочность связывания белка с ДНК. Предполагается, что белок Flp использует контакты третьей группы, которая вносит наименьший вклад в прочность связывания, наряду с контактами в малом желобке ДНК для первичной дискриминации между различными последовательностями ДНК Показано, что белок Flp имеет контакты с Flp-связывающим элементом ДНК в малом желобке с противоположных сторон двойной спирали ДНК, и, вероятно, белок Flp оплетает ДНК. Сайт-специфічна рекомбіназа Flp, яка кодується 2-мкм плазмідою із S. cerevisiae, має множинні контакти з основами Flp-зв'язуюного елемента ДНК. В роботі здійснено аналіз відносного внеску контактів у міцність зв'язування білка Flp з ДНК та особливостей їх розподілу у великому та малому жолобках ДНК Контакти білка Flp з Flp-зв'язуючим елементом ДНК було підрозділено на три группи в залежності від їх внеску в міцність зв'язування білка з ДНК Припускається, що білок Flp використовує контакти третьої группи (котрі вносять найменший внесок у міцність зв'язування) поряд з контактами в малому жолобку ДНК для первинної дискримінації між різ­ ними послідовностями ДНК. Показано, що білок Flp має контакти з Flp-зв'язуючим элементом ДНК в малому жолобку з протилежних сторін подвійної спіралі ДНК і цілком імовірно, що білок Flp обплітає ДНК. Site-specific recombinase Flp encoded by 2 micron plasmidfrom S. cerevisiae has multiple contacts with nucleic bases of Ftp-binding element of DNA. We present an analysis of relative contribution of these contacts to strength of Ftp-protein binding to DNA, and of the peculiarities of their distribution at major and minor grooves of DNA. The contacts of Flp-protein with Ftp-binding element of DNA have been divided into three groups depending on their contribution in strength of Flp-protein binding to DNA. It has been suggested that Flp-protein uses the third group of contacts (they make the least contribution to strength of Flp-protein binding to DNA) along with minor groove contacts for initial discrimination between different DNA sequences. It has been shown that Flp-protein has contacts with nucleic bases in minor groove at opposite sides of DNA, so Flp-protein probably wraps DNA. 1996 Article Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК / Ю.А. Возиянов // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 1. — С. 89-94. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000418 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153792 577.151.45 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
description Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2-мкм плазмидой из S. cerevisiae, имеет множественные точечные контакты с основаниями Flp-связывающего элемента ДНК. В настоящей работе проведен анализ относительного вклада контактов в прочность связывания белка Flp с ДНК и особенностей их распределения в большом и малом желобке ДНК. Контакты белка Flp с Flp-связывающим элементом ДНК были подразделены на три группы в зависимости от их вклада в прочность связывания белка с ДНК. Предполагается, что белок Flp использует контакты третьей группы, которая вносит наименьший вклад в прочность связывания, наряду с контактами в малом желобке ДНК для первичной дискриминации между различными последовательностями ДНК Показано, что белок Flp имеет контакты с Flp-связывающим элементом ДНК в малом желобке с противоположных сторон двойной спирали ДНК, и, вероятно, белок Flp оплетает ДНК.
format Article
author Возиянов, Ю.А.
spellingShingle Возиянов, Ю.А.
Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
Биополимеры и клетка
author_facet Возиянов, Ю.А.
author_sort Возиянов, Ю.А.
title Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
title_short Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
title_full Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
title_fullStr Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
title_full_unstemmed Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
title_sort возможная роль индивидуальных днк-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы flp из saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями flp-связывающего элемента днк
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 1996
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153792
citation_txt Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК / Ю.А. Возиянов // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 1. — С. 89-94. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
series Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv AT voziânovûa vozmožnaârolʹindividualʹnyhdnkbelkovyhkontaktovsajtspecifičeskojrekombinazyflpizsaccharomycescerevisiaesazotistymiosnovaniâmiflpsvâzyvaûŝegoélementadnk
first_indexed 2023-05-20T17:42:39Z
last_indexed 2023-05-20T17:42:39Z
_version_ 1796153914068828160