Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом
Полиэлектролитная теория В – Z-перехода предсказывает немонотонную зависимость стабильности Z-формы от концентрации электролита. Опубликованные данные о двойном Z – В – Z-переходе с ростом концентрации соли в растворе поли [д(Г–м⁵Ц)] допускают альтернативное объяснение первого (Z – В) перехода за сч...
Збережено в:
| Дата: | 1988 |
|---|---|
| Автори: | , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1988
|
| Назва видання: | Биополимеры и клетка |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153937 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом / В.И. Иванов, Э.Е. Минят // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 4. — С. 171-177. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-153937 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1539372019-06-15T01:29:12Z Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом Иванов, В.И. Минят, Э.Е. Структура и функции биополимеров Полиэлектролитная теория В – Z-перехода предсказывает немонотонную зависимость стабильности Z-формы от концентрации электролита. Опубликованные данные о двойном Z – В – Z-переходе с ростом концентрации соли в растворе поли [д(Г–м⁵Ц)] допускают альтернативное объяснение первого (Z – В) перехода за счет вытеснения примесных ионов Mg²⁺ и Са²⁺ ионами Na⁺. Чтобы решить эту дилемму, мы провели эксперименты с поли[д(Г–м⁵Ц)], в которых наряду с электростатическим вкладом в B–Z-равновесие варьировали неэлектростатический вклад добавлением малых количеств неэлектролита (этанол). И теория, и эксперимент показывают, что максимум стабильности В-формы находится вблизи 0,1 М NaCl. Была рассчитана также энергия B/Z-границы: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким образом, согласно нашим данным, низкоионный переход имеет чисто полиэлектролитную природу, т. е. обусловлен большей линейной плотностью заряда в В-форме по сравнению с Z-формой. Поліелектролітна теорія В–Z-переходу передбачає немонотонну залежність стабільності Z-форми від концентрації електроліту. Опубліковані дані щодо подвійного Z–В–Z-перехіду зі зростанням концентрації солі у розчині полі [д(Г–м⁵Ц)] допускають альтернативне пояснення першого (Z–В)-переходу за рахунок витіснення домішкових іонів Mg²⁺ і Са²⁺ іонами Na⁺. Щоб вирішити цю дилему, ми провели експерименти з полі[д(Г–м⁵Ц)], у яких поряд з електростатичним внеском у B/Z-рівновагу варіювали неелектростатичний внесок додаванням малих кількостей неелектроліту (етанол). І теорія, і експеримент показують, що максимум стабільності В-форми знаходиться поблизу 0,1 М NaCl. Розраховано також енергію B/Z-межі: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким чином, згідно з нашими даними, низькоіонний перехід має чисто поліелектролітну природу, тобто обумовлений більшою лінійної щільністю заряду у В-формі порівняно з Z-формою. The polyelectrolyte theory for the B – Z transition has been tested with poly[d(G-m⁵C)] by changing the non-electrostatic contribution to the free energy difference between the B and Z forms. The non-electrostatic term was varied by addition of ethanol, a non-electrolyte. The experiments confirmed a bell-shaped dependence of the Z form stability on counterion concentration, the maximum B form stability being at 0.1 M NaCl. In accordance with the theory the widths of the Z-to-B transition at low ionic strengths (<0.01), when expressed in logarithms, are equal. A value of 3.6 kcal/mol was obtained for the free energy of the B/Z junction in poly[d(G-m⁵C)]. These findings make it possible to believe that an explanation of the low ionic strength reverse Z to B transition, based on an idea of pushing out the contaminating polyvalent ions by Na⁺, is unlikely. 1988 Article Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом / В.И. Иванов, Э.Е. Минят // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 4. — С. 171-177. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000225 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153937 577.323 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Структура и функции биополимеров Структура и функции биополимеров |
| spellingShingle |
Структура и функции биополимеров Структура и функции биополимеров Иванов, В.И. Минят, Э.Е. Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом Биополимеры и клетка |
| description |
Полиэлектролитная теория В – Z-перехода предсказывает немонотонную зависимость стабильности Z-формы от концентрации электролита. Опубликованные данные о двойном Z – В – Z-переходе с ростом концентрации соли в растворе поли [д(Г–м⁵Ц)] допускают альтернативное объяснение первого (Z – В) перехода за счет вытеснения примесных ионов Mg²⁺ и Са²⁺ ионами Na⁺. Чтобы решить эту дилемму, мы провели эксперименты с поли[д(Г–м⁵Ц)], в которых наряду с электростатическим вкладом в B–Z-равновесие варьировали неэлектростатический вклад добавлением малых количеств неэлектролита (этанол). И теория, и эксперимент показывают, что максимум стабильности В-формы находится вблизи 0,1 М NaCl. Была рассчитана также энергия B/Z-границы: 3,6±0,1 ккал/моль. Таким образом, согласно нашим данным, низкоионный переход имеет чисто полиэлектролитную природу, т. е. обусловлен большей линейной плотностью заряда в В-форме по сравнению с Z-формой. |
| format |
Article |
| author |
Иванов, В.И. Минят, Э.Е. |
| author_facet |
Иванов, В.И. Минят, Э.Е. |
| author_sort |
Иванов, В.И. |
| title |
Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_short |
Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_full |
Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_fullStr |
Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_full_unstemmed |
Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом |
| title_sort |
изменение стабильности z-формы днк в зависимости от ионной силы. сравнение теории с экспериментом |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
1988 |
| topic_facet |
Структура и функции биополимеров |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/153937 |
| citation_txt |
Изменение стабильности Z-формы ДНК в зависимости от ионной силы. Сравнение теории с экспериментом / В.И. Иванов, Э.Е. Минят // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 4. — С. 171-177. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. |
| series |
Биополимеры и клетка |
| work_keys_str_mv |
AT ivanovvi izmeneniestabilʹnostizformydnkvzavisimostiotionnojsilysravnenieteoriiséksperimentom AT minâtée izmeneniestabilʹnostizformydnkvzavisimostiotionnojsilysravnenieteoriiséksperimentom |
| first_indexed |
2023-05-20T17:43:08Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:43:08Z |
| _version_ |
1796153936013426688 |