Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)

Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)

В работе предложен новый алгоритм построения полной карты локального сходства двух биополимеров, значительно более быстрый по сравнению с известным алгоритмом Альтшуля — Эриксона. Haш алгоритм реализован в программе DotHelix из пакета GenBee. Эффективность алгоритма по сравнению с традиционным метод...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Видавець:Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Дата:1990
Автори: Леонтович, А.М., Бродский, Л.И., Горбаленя, А.Е.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
Назва видання:Биополимеры и клетка
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154116
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) / А.М. Леонтович, Л.И. Бродский, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 14-21. — Бібліогр.: 4 назв. — рос.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-154116
record_format dspace
spelling irk-123456789-1541162019-06-16T01:26:11Z Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) Леонтович, А.М. Бродский, Л.И. Горбаленя, А.Е. В работе предложен новый алгоритм построения полной карты локального сходства двух биополимеров, значительно более быстрый по сравнению с известным алгоритмом Альтшуля — Эриксона. Haш алгоритм реализован в программе DotHelix из пакета GenBee. Эффективность алгоритма по сравнению с традиционным методом Стадена и работа программы DotHelix проиллюстрированы на примере сопоставления полипротеинов двух штаммов вируса полиомиелита. Кратко обсуждены возможные области применения предлагаемой программы. Запропоновано новий алгоритм побудови повної карти локальної подібності двох біополімерів, значно швидший порівняно з відомим алгоритмом Альтшуля?Еріксона. Haш алгоритм реалізований у програмі DotHelix з пакету GenBee. Ефективність алгоритму порівняно з традиційним методом Стадена і робота програми DotHelix проілюстровано на прикладі зіставлення поліпротеїнів двох штамів вірусу поліомієліту. Коротко обговорено можливі галузі застосування пропонованої програми. A novel algorithm for generation of complete maps of local similarity for two biopolymers which is much faster than the similar Altschul-Erickson algorithm is described. This algorithm was implemented as the DotHelix program within the GenBee package. The algorithm effectiveness as compared to the Staden algorithm and the results obtained with the DotHelix program are illustrated by the comparison of the polyproteins of two strains of poliomyelitis virus type 3. The possible applications of the program are discussed in brief. 1990 Article Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) / А.М. Леонтович, Л.И. Бродский, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 14-21. — Бібліогр.: 4 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00029A http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154116 577.112 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
description В работе предложен новый алгоритм построения полной карты локального сходства двух биополимеров, значительно более быстрый по сравнению с известным алгоритмом Альтшуля — Эриксона. Haш алгоритм реализован в программе DotHelix из пакета GenBee. Эффективность алгоритма по сравнению с традиционным методом Стадена и работа программы DotHelix проиллюстрированы на примере сопоставления полипротеинов двух штаммов вируса полиомиелита. Кратко обсуждены возможные области применения предлагаемой программы.
format Article
author Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
spellingShingle Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
Биополимеры и клетка
author_facet Леонтович, А.М.
Бродский, Л.И.
Горбаленя, А.Е.
author_sort Леонтович, А.М.
title Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_short Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_full Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_fullStr Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_full_unstemmed Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee)
title_sort построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа dothelix пакета genbee)
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 1990
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154116
citation_txt Построение полной карты локального сходства двух биополимеров (программа DotHelix пакета GenBee) / А.М. Леонтович, Л.И. Бродский, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 14-21. — Бібліогр.: 4 назв. — рос.
series Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv AT leontovičam postroeniepolnojkartylokalʹnogoshodstvadvuhbiopolimerovprogrammadothelixpaketagenbee
AT brodskijli postroeniepolnojkartylokalʹnogoshodstvadvuhbiopolimerovprogrammadothelixpaketagenbee
AT gorbalenâae postroeniepolnojkartylokalʹnogoshodstvadvuhbiopolimerovprogrammadothelixpaketagenbee
first_indexed 2023-05-20T17:43:29Z
last_indexed 2023-05-20T17:43:29Z
_version_ 1796153942408691712

Схожі ресурси