Метод поиска структурных мотивов в аминокислотных последовательностях программа «site» пакета «GenBee»
Предложен метод поиска структурных мотивов в аминокислотных последовательностях, основанный на построении частотного профиля группы выравненных фрагментов последовательностей. На примере сканирования банка аминокислотных последовательностей мотивом, характерным для широкого класса NTР-связывающих бе...
Збережено в:
Видавець: | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
---|---|
Дата: | 1990 |
Автори: | , , |
Формат: | Стаття |
Мова: | Russian |
Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1990
|
Назва видання: | Биополимеры и клетка |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154121 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Цитувати: | Метод поиска структурных мотивов в аминокислотных последовательностях программа «site» пакета «GenBee» / Е.В. Кунин, К.М. Чумаков, А.Е. Горбаленя // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 42-48. — Бібліогр.: 9 назв. — рос. |
Репозиторії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineРезюме: | Предложен метод поиска структурных мотивов в аминокислотных последовательностях, основанный на построении частотного профиля группы выравненных фрагментов последовательностей. На примере сканирования банка аминокислотных последовательностей мотивом, характерным для широкого класса NTР-связывающих белков, рассмотрена работа программы «SITE», написанной на основе предложенного алгоритма. Продемонстрированы преимущества предложенного подхода по сравнению со стандартными программами поиска паттернов в отношении полноты и избирательности извлечения из банка последовательностей, содержащих участки, сходные с рассматриваемым мотивом. Представлена предположительная идентификация NTP-связывающих центров в нескольких белках, где они ранее не были обнаружены. Обсуждается применение разработанного алгоритма для классификации банков аминокислотных последовательностей. |
---|