Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations

Aim. To extract information on the nature of protein structural relaxation from the kinetics of electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre (RC). Methods. The kinetic curves obtained by absorption spectroscopy are processed by a maximum entropy method to get the spectrum of rela...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2010
Автори: Kharkyanen, V.N., Barabash, Yu.M., Berezetskaya, N.M., Olenchuk, M.V., Knox, P.P., Christophorov, L.N.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2010
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154128
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations / V.N. Kharkyanen, Yu.M. Barabash, N.M. Berezetskaya, M.V. Olenchuk, P.P. Knox, L.N. Christophorov // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 286-294. — Бібліогр.: 26 назв. — англ, рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-154128
record_format dspace
spelling irk-123456789-1541282019-06-16T01:28:15Z Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations Kharkyanen, V.N. Barabash, Yu.M. Berezetskaya, N.M. Olenchuk, M.V. Knox, P.P. Christophorov, L.N. Molecular Biophysics Aim. To extract information on the nature of protein structural relaxation from the kinetics of electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre (RC). Methods. The kinetic curves obtained by absorption spectroscopy are processed by a maximum entropy method to get the spectrum of relaxation times. Results. A series of distinctive peaks of this spectrum in the interval from 0.1 s to hundreds of seconds is revealed. With the time of exposure of the sample to actinic light increasing, the positions of the peak maxima grow linearly. Conclusions. Theoretical analysis of these results reveals the formation of several structural states of the RC protein. Remarkably, in each of these states the slow reaction kinetics follow the same fractional power law that reflects the glass-like properties of the protein. Цель. Определить характер структурной релаксации белка из анализа кинетики реакции электрон- ного транспорта в фотосинтетическом реакционном центре (РЦ). Методы. Кинетические кривые, полученные методами абсорбционной спектроскопии, обрабатывали с использованием метода максимальной энтропии для получения спектра времен релаксации. Результаты. Обнаружен ряд характерных пиков этого спектра в интервале от 0,1 до сотен секунд. С увеличением длительности экспозиции образца в актиничном свете положения максимумов пиков линейно возрастают. Выводы. Из теоретического анализа результатов следует, что появляется несколько структурных состояний белкового компонента РЦ, в которых, однако, медленная кинетика реакции подчиняется одному и тому же дробно-степенному закону, отражающему стеклоподобные свойства белка. Мета. Визначити характер структурної релаксації білка з аналізу кінетики реакції електронного транспорту у фотосинтетичному реакційному центрі (РЦ). Методи. Кінетичні криві, одержані з використанням абсорбційної спектроскопії, обробляли методом максимальної ентропії для отримання спектра часів релаксації. Результати. Знайдено низку характерних піків цього спектра в интервалі від 0,1 до сотень секунд. Зі збільшенням тривалості експозиції зразка в актинічному світлі положення максимумів піків лінійно зростають. Висновки. З теоретичного аналізу результатів випливає, що виникає декілька структурних станів білкового компонента РЦ, у яких, однак, повільна кінетика реакції підпорядкована одному й тому ж дрiбно-ступеневому закону, що відбиває склоподібні властивості білка. 2010 Article Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations / V.N. Kharkyanen, Yu.M. Barabash, N.M. Berezetskaya, M.V. Olenchuk, P.P. Knox, L.N. Christophorov // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 286-294. — Бібліогр.: 26 назв. — англ, рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000161 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154128 577.355 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Molecular Biophysics
Molecular Biophysics
spellingShingle Molecular Biophysics
Molecular Biophysics
Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
Вiopolymers and Cell
description Aim. To extract information on the nature of protein structural relaxation from the kinetics of electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre (RC). Methods. The kinetic curves obtained by absorption spectroscopy are processed by a maximum entropy method to get the spectrum of relaxation times. Results. A series of distinctive peaks of this spectrum in the interval from 0.1 s to hundreds of seconds is revealed. With the time of exposure of the sample to actinic light increasing, the positions of the peak maxima grow linearly. Conclusions. Theoretical analysis of these results reveals the formation of several structural states of the RC protein. Remarkably, in each of these states the slow reaction kinetics follow the same fractional power law that reflects the glass-like properties of the protein.
format Article
author Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
author_facet Kharkyanen, V.N.
Barabash, Yu.M.
Berezetskaya, N.M.
Olenchuk, M.V.
Knox, P.P.
Christophorov, L.N.
author_sort Kharkyanen, V.N.
title Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_short Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_full Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_fullStr Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_full_unstemmed Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
title_sort deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2010
topic_facet Molecular Biophysics
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154128
citation_txt Deceleration of the electron transfer reaction in the photosynthetic reaction centre as a manifestation of its structure fluctuations / V.N. Kharkyanen, Yu.M. Barabash, N.M. Berezetskaya, M.V. Olenchuk, P.P. Knox, L.N. Christophorov // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 4. — С. 286-294. — Бібліогр.: 26 назв. — англ, рос.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT kharkyanenvn decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT barabashyum decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT berezetskayanm decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT olenchukmv decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT knoxpp decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
AT christophorovln decelerationoftheelectrontransferreactioninthephotosyntheticreactioncentreasamanifestationofitsstructurefluctuations
first_indexed 2023-05-20T17:43:43Z
last_indexed 2023-05-20T17:43:43Z
_version_ 1796153953235238912