Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтраци...
Збережено в:
| Дата: | 1990 |
|---|---|
| Автори: | , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1990
|
| Назва видання: | Биополимеры и клетка |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154144 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-154144 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1541442019-06-16T01:27:52Z Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа Волков, В.В. Леонтьев, А.Ю. В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтрацией, основанной на симметричной числовой кодировке нуклеотидной последовательности. Прямые повторы обнаруживаются с помощью фурье-анализа как первого этапа поиска, существенно сокращающего число операций сравнения. Методы опробованы на модельных последовательностях и областях инициации репликации прокариотического генома. Запропоновано метод класифікації симетричних структур одноланцюгової ДНК, що використовує поняття кольорової симетрії. Наведено систематичне перерахування кольорових точкових і просторових груп. Для пошуку структур з інверсійною симетрією пропонується використовувати фур’є-аналіз з фільтрацією, заснованою на симетричному числовому кодуванні нуклеотидної послідовності. Прямі повтори виявляються за допомогою фур’є-аналізу як першого етапу пошуку, що істотно скорочує число операцій порівняння. Методи апробовано на модельних послідовностях і областях ініціації реплікації прокаріотичного геному. A system of the single strand DNA symmetry based on the theory of coloured symmetry is proposed. The search of the fragments with the inversion symmetry is carried out by means of the Fourier transformation, DNA being preliminary presented as a three-dimensional number series. For the search of the direct repeats the Fourier transformation is proposed as the first step to decrease the number of comparisons. The both methods have been tested on the model sequences as well as on the prokaryotic origins of replication. 1990 Article Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A3 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154144 576.315.42 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| description |
В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтрацией, основанной на симметричной числовой кодировке нуклеотидной последовательности. Прямые повторы обнаруживаются с помощью фурье-анализа как первого этапа поиска, существенно сокращающего число операций сравнения. Методы опробованы на модельных последовательностях и областях инициации репликации прокариотического генома. |
| format |
Article |
| author |
Волков, В.В. Леонтьев, А.Ю. |
| spellingShingle |
Волков, В.В. Леонтьев, А.Ю. Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа Биополимеры и клетка |
| author_facet |
Волков, В.В. Леонтьев, А.Ю. |
| author_sort |
Волков, В.В. |
| title |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа |
| title_short |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа |
| title_full |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа |
| title_fullStr |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа |
| title_full_unstemmed |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа |
| title_sort |
исследование симметрии генетических текстов методом фурье-анализа |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
1990 |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154144 |
| citation_txt |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос. |
| series |
Биополимеры и клетка |
| work_keys_str_mv |
AT volkovvv issledovaniesimmetriigenetičeskihtekstovmetodomfurʹeanaliza AT leontʹevaû issledovaniesimmetriigenetičeskihtekstovmetodomfurʹeanaliza |
| first_indexed |
2023-05-20T17:43:45Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:43:45Z |
| _version_ |
1796153954410692608 |