Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226»

• Дата: 1990
• Автори: Костецкий, П.В., Артемьев, И.В., Пожильцова, О.И., Ульяшин, В.В.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1990
• Назва видання: Биополимеры и клетка
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154147
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.

Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков; 3) попарного сравнения гомологичных последовательностей; 4) расчета филогенетических деревьев гомологичных белковых последовательностей; 5) идентификации местоположения вариабельных и консервативных участков в аминокислотных последовательностях гомологичных белков; 6) поиска сходства двух сравниваемых белков с распечаткой точечной матрицы сравнения; 7) предсказания локализации В- и T-клеточных антигенных детерминант; 8) перенесения аминокислотных последовательностей банка белковых последовательностей PIR, хранящихся на магнитных лентах, на гибкий магнитный диск персональной ЭВМ «Искра-226» и обратно; 9) идентификации фрагментов структурного гена с помощью набора пептидов; 10) трансляции структурных генов, содержащих интроны. Пакет программ написан на алгоритмическом языке Бейсик. С целью ускорения работы отдельных наиболее трудоемких блоков программ использован автокод микро-ЭВМ. Программы реализованы в диалоговом режиме.