Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226»
Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков;...
Збережено в:
| Дата: | 1990 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1990
|
| Назва видання: | Биополимеры и клетка |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154147 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-154147 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| description |
Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков; 3) попарного сравнения гомологичных последовательностей; 4) расчета филогенетических деревьев гомологичных белковых последовательностей; 5) идентификации местоположения вариабельных и консервативных участков в аминокислотных последовательностях гомологичных белков; 6) поиска сходства двух сравниваемых белков с распечаткой точечной матрицы сравнения; 7) предсказания локализации В- и T-клеточных антигенных детерминант; 8) перенесения аминокислотных последовательностей банка белковых последовательностей PIR, хранящихся на магнитных лентах, на гибкий магнитный диск персональной ЭВМ «Искра-226» и обратно; 9) идентификации фрагментов структурного гена с помощью набора пептидов; 10) трансляции структурных генов, содержащих интроны. Пакет программ написан на алгоритмическом языке Бейсик. С целью ускорения работы отдельных наиболее трудоемких блоков программ использован автокод микро-ЭВМ. Программы реализованы в диалоговом режиме. |
| format |
Article |
| author |
Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. |
| spellingShingle |
Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» Биополимеры и клетка |
| author_facet |
Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. |
| author_sort |
Костецкий, П.В. |
| title |
Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_short |
Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_full |
Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_fullStr |
Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_full_unstemmed |
Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» |
| title_sort |
пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-эвм «искра-226» |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
1990 |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154147 |
| citation_txt |
Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
| series |
Биополимеры и клетка |
| work_keys_str_mv |
AT kosteckijpv paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnostejnapersonalʹnojmikroévmiskra226 AT artemʹeviv paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnostejnapersonalʹnojmikroévmiskra226 AT požilʹcovaoi paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnostejnapersonalʹnojmikroévmiskra226 AT ulʹâšinvv paketprikladnyhprogrammdlâanalizaaminokislotnyhposledovatelʹnostejnapersonalʹnojmikroévmiskra226 |
| first_indexed |
2023-05-20T17:43:45Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:43:45Z |
| _version_ |
1796153954626699264 |
| spelling |
irk-123456789-1541472019-06-16T01:30:21Z Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» Костецкий, П.В. Артемьев, И.В. Пожильцова, О.И. Ульяшин, В.В. Приведено описание пакета программ для обработки аминокислотных последовательностей белков и пептидов. Входящие в пакет программы дают возможность: 1) ввода и редактирования аминокислотных последовательностей; 2) распечатки выравненных аминокислотных последовательностей семейств гомологичных белков; 3) попарного сравнения гомологичных последовательностей; 4) расчета филогенетических деревьев гомологичных белковых последовательностей; 5) идентификации местоположения вариабельных и консервативных участков в аминокислотных последовательностях гомологичных белков; 6) поиска сходства двух сравниваемых белков с распечаткой точечной матрицы сравнения; 7) предсказания локализации В- и T-клеточных антигенных детерминант; 8) перенесения аминокислотных последовательностей банка белковых последовательностей PIR, хранящихся на магнитных лентах, на гибкий магнитный диск персональной ЭВМ «Искра-226» и обратно; 9) идентификации фрагментов структурного гена с помощью набора пептидов; 10) трансляции структурных генов, содержащих интроны. Пакет программ написан на алгоритмическом языке Бейсик. С целью ускорения работы отдельных наиболее трудоемких блоков программ использован автокод микро-ЭВМ. Программы реализованы в диалоговом режиме. Наведено опис пакету програм для обробки амінокислотних послідовностей білків і пептидів. Програми, які входять до пакету, дають можливість: 1) введення і редагування амінокислотних послідовностей; 2) роздруківки вирівняних амінокислотних послідовностей родин гомологічних білків; 3) попарного порівняння гомологічних послідовностей; 4) розрахунку філогенетичних дерев гомологічних білкових послідовностей; 5) ідентифікації місця розташування варіабельних і консервативних ділянок в амінокислотних послідовностях гомологічних білків; 6) пошуку подібності двох порівнюваних білків з роздрукуванням точкової матриці порівняння; 7) передбачення локалізації В- і T-клітинних антигенних детермінант; 8) перенесення амінокислотних послідовностей банку білкових послідовностей PIR, що зберігаються на магнітних стрічках, на гнучкий магнітний диск персональної ЕОМ «Іскра-226» і назад; 9) ідентифікації фрагментів структурного гена за допомогою набору пептидів; 10) трансляції структурних генів, що містять інтрони. Пакет програм написаний на алгоритмічній мові Бейсик. Для прискорення роботи окремих найтрудомісткіших блоків програм використано автокод мікро-ЕОМ. Програми реалізовані в діалоговому режимі. Presented software package allows: 1) input and edition of amino acid sequences; 2) listing of aligned amino acid sequences of homologous protein; 3) pairwise comparison of homologous sequences; 4) calculation of phylogenetic trees of homologous protein sequences; 5) identification of variable and constant regions of amino acid sequences; 6) search for similarity between two amino acid sequences and list out comparison dot matrix; 7) prediction of B- and T-cell antigenic determinants; 8) trans forming Protein Identification Resource (PIR) from magnetic tape media to «Iskra-226» floppy disk media and vice versa; 9) identification of structure gene fragments using a set of peptides;. 10) translation of structure genes containing introns. Programs are written in BASIC for a personal computer «Iskra-226» (USSR). To accelerate some operations, computer code commands are used. Software package is realized in interactive mode and intended for specialists on peptide and protein chemistry. 1990 Article Пакет прикладных программ для анализа аминокислотных последовательностей на персональной микро-ЭВМ «ИСКРА-226» / П.В. Костецкий, И.В. Артемьев, О.И. Пожильцова, В.В. Ульяшин // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 72-79. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A4 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154147 577.112.5.0.87 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |