Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis

Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis

Aim. Investigation of intraspecies and somaclonal variability of G. acaulis, G. cruciata and G. punctata. Methods. Random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR), gel-electrophoresis. Results. It was established a species specificity for indicators of gentians genetic heteroge...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2010
Автори: Twardovska, M.O., Drobyk, N.M., Mel'nyk, V.M., Konvalyuk, I.I., Kunakh, V.A.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2010
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154214
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis / M.O. Twardovska, N.M. Drobyk, V.M. Mel'nyk, I.I. Konvalyuk, V.A. Kunakh // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 6. — С. 499-507. — Бібліогр.: 29 назв. — англ, укр.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-154214
record_format dspace
spelling irk-123456789-1542142019-06-16T01:30:00Z Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis Twardovska, M.O. Drobyk, N.M. Mel'nyk, V.M. Konvalyuk, I.I. Kunakh, V.A. Genomics, Transcriptomics and Proteomics Aim. Investigation of intraspecies and somaclonal variability of G. acaulis, G. cruciata and G. punctata. Methods. Random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR), gel-electrophoresis. Results. It was established a species specificity for indicators of gentians genetic heterogeneity – the proportion of polymorphic amplicons and genetic distances. A level of intraspecies variation decreased in the direction of G. acaulis > G. punctata > G. cruciata. Changes in gentians tissue culture by the proportion of polymorphic amplicons were shown to vary within the range of 10–15 % and failed to extend beyond the intraspecies variation. Conclusions. Genome variation of G. acaulis, G. cruciata and G. punctata was studied through the use of RAPD-PCR. The gentians were found to be characterized by different variability in both nature and culture in vitro. In the tissue culture there were discovered considerably smaller number changes as compared to intraspecies variation. Мета. Дослідити внутрішньовидову та сомаклональну мінливість Gentiana acaulis, G. cruciata та G. punctata. Методи. Полімеразна ланцюгова реакція з праймерами довільної послідовності (RAPD- ПЛР), гель-електрофорез. Результати. Виявлено видоспецифічність показників генетичної гетерогенності тирличів – відсотка поліморфних ампліконів і генетичних відстаней. Рівень внутрішньовидової мінливості зменшується у напрямку G. acaulis > G. punctata > G. cruciata. Показано, що зміни в культурі тканин тирличів за вмістом поліморфних ампліконів лежать у діапазоні 10– 15 % і не виходять за межі внутрішньовидової варіабельності. Висновки. Методом RAPD-ПЛР досліджено геномну мінливість G. acaulis, G. cruciata та G. punctata. Встановлено, що тирличі характеризуються різною варіабельністю як у природі, так і в культурі in vitro. У культурі тканин виявлено зміни, які значно менші порівняно з внутрішньовидовою мінливістю. Цель. Исследовать внутривидовую и сомаклональную изменчивость Gentiana acaulis, G. cruciata и G. punctata. Методы. Полимеразная цепная реакция с праймерами произвольной последовательности (RAPD-ПЦР), гель-электрофорез. Результаты. Обнаружена видоспецифичность показателей генетической гетерогенности горечавок – процента полиморфных ампликонов и генетических расстояний. Уровень внутривидовой изменчивости уменьшается в ряду G. acaulis > G. punctata > G. cruciata. Показано, что изменения в культуре тканей горечавок по содержанию полиморфных ампликонов лежат в диапазоне 10– 15 % и не выходят за границы внутривидовой вариабельности. Выводы. Методом RAPD-ПЦР исследована геномная изменчивость G. acaulis, G. cruciata и G. punctata. Установлено, что горечавки характеризуются различной вариабельностью как в природе, так и в культуре in vitro. В культуре тканей обнаружены значительно меньшие изменения по сравнению с внутривидовой изменчивостью. 2010 Article Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis / M.O. Twardovska, N.M. Drobyk, V.M. Mel'nyk, I.I. Konvalyuk, V.A. Kunakh // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 6. — С. 499-507. — Бібліогр.: 29 назв. — англ, укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00017A http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154214 575.22: 582.923.1 + 576.5 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
spellingShingle Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Twardovska, M.O.
Drobyk, N.M.
Mel'nyk, V.M.
Konvalyuk, I.I.
Kunakh, V.A.
Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis
Вiopolymers and Cell
description Aim. Investigation of intraspecies and somaclonal variability of G. acaulis, G. cruciata and G. punctata. Methods. Random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR), gel-electrophoresis. Results. It was established a species specificity for indicators of gentians genetic heterogeneity – the proportion of polymorphic amplicons and genetic distances. A level of intraspecies variation decreased in the direction of G. acaulis > G. punctata > G. cruciata. Changes in gentians tissue culture by the proportion of polymorphic amplicons were shown to vary within the range of 10–15 % and failed to extend beyond the intraspecies variation. Conclusions. Genome variation of G. acaulis, G. cruciata and G. punctata was studied through the use of RAPD-PCR. The gentians were found to be characterized by different variability in both nature and culture in vitro. In the tissue culture there were discovered considerably smaller number changes as compared to intraspecies variation.
format Article
author Twardovska, M.O.
Drobyk, N.M.
Mel'nyk, V.M.
Konvalyuk, I.I.
Kunakh, V.A.
author_facet Twardovska, M.O.
Drobyk, N.M.
Mel'nyk, V.M.
Konvalyuk, I.I.
Kunakh, V.A.
author_sort Twardovska, M.O.
title Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis
title_short Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis
title_full Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis
title_fullStr Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis
title_full_unstemmed Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis
title_sort genome variability of some gentiana l. species in nature and in culture in vitro: rapd-analysis
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2010
topic_facet Genomics, Transcriptomics and Proteomics
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154214
citation_txt Genome variability of some Gentiana L. species in nature and in culture in vitro: RAPD-analysis / M.O. Twardovska, N.M. Drobyk, V.M. Mel'nyk, I.I. Konvalyuk, V.A. Kunakh // Вiopolymers and Cell. — 2010. — Т. 26, № 6. — С. 499-507. — Бібліогр.: 29 назв. — англ, укр.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT twardovskamo genomevariabilityofsomegentianalspeciesinnatureandincultureinvitrorapdanalysis
AT drobyknm genomevariabilityofsomegentianalspeciesinnatureandincultureinvitrorapdanalysis
AT melnykvm genomevariabilityofsomegentianalspeciesinnatureandincultureinvitrorapdanalysis
AT konvalyukii genomevariabilityofsomegentianalspeciesinnatureandincultureinvitrorapdanalysis
AT kunakhva genomevariabilityofsomegentianalspeciesinnatureandincultureinvitrorapdanalysis
first_indexed 2023-05-20T17:43:53Z
last_indexed 2023-05-20T17:43:53Z
_version_ 1796153959419740160

Схожі ресурси