Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention

Infectious bursal disease virus (IBDV) causes a highly contagious disease in young chickens and is distributed worldwide. Primary viral antigen is VP2. The VP2 gene contains hypervariable re-gion (VP2 HRV). Mutations in this region lead to emergence of antigenically different IBDV strains. For IBDV...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2018
Автори:	Pastyria, A.S., Budzanivska, I.G., Polischuk, V.P.
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2018
Назва видання:	Вiopolymers and Cell
Теми:	Molecular and Cell Biotechnologies
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154260
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention / A.S. Pastyria, I.G. Budzanivska, V.P. Polischuk // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 1. — С. 24-31. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-154260
record_format	dspace
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	English
topic	Molecular and Cell Biotechnologies Molecular and Cell Biotechnologies
spellingShingle	Molecular and Cell Biotechnologies Molecular and Cell Biotechnologies Pastyria, A.S. Budzanivska, I.G. Polischuk, V.P. Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention Вiopolymers and Cell
description	Infectious bursal disease virus (IBDV) causes a highly contagious disease in young chickens and is distributed worldwide. Primary viral antigen is VP2. The VP2 gene contains hypervariable re-gion (VP2 HRV). Mutations in this region lead to emergence of antigenically different IBDV strains. For IBDV prevention, vaccination is used. The efficacy of vaccination depends on the ge-netic closeness of field and vaccine strains. Aim of the study was to analyze nucleotide sequence of different vaccine and field strains of IBDV circulating in Ukrainian poultry farms. Methods. In this study 11 vaccine strains and 16 field isolates were used. RNA was extracted using a magnetic separation method, reverse transcription was carried out and PCR was performed using specific primers to the VP2 gene. Obtained amplicons were used for sequencing. Phylogenetic and amino acid analysis was performed with MEGA 6 software. Results. 11 vaccine strains formed 5 phy-logenetic clusters. Cluster I represented strains GM97, 228E and MB/20. Cluster II contained mild vaccine strains LC-75 and D78. Intermediate strains Winterfield-2512 and Lukert formed cluster III. ‘Hot’ vaccine strains MB and MB/3 formed cluster IV. Cluster V was represented by strains MB/5 and V877. After addition of 16 Ukrainian field strains the tree structure remained the same. 8 isolates clustered together with ‘hot’, 5 – with intermediate, and 3 – with mild vaccine strains. Amino acid analyses confirmed antigenic closeness among vaccine and field strains of the same cluster. Conclusion. The obtained data can be used for the vaccine selection for IBD pre-vention in each particular poultry farm of Ukraine.
format	Article
author	Pastyria, A.S. Budzanivska, I.G. Polischuk, V.P.
author_facet	Pastyria, A.S. Budzanivska, I.G. Polischuk, V.P.
author_sort	Pastyria, A.S.
title	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention
title_short	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention
title_full	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention
title_fullStr	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention
title_full_unstemmed	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention
title_sort	characterization of vaccine and field ibdv strains in ukraine for proper vaccine selection for disease prevention
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate	2018
topic_facet	Molecular and Cell Biotechnologies
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154260
citation_txt	Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention / A.S. Pastyria, I.G. Budzanivska, V.P. Polischuk // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 1. — С. 24-31. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.
series	Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv	AT pastyriaas characterizationofvaccineandfieldibdvstrainsinukraineforpropervaccineselectionfordiseaseprevention AT budzanivskaig characterizationofvaccineandfieldibdvstrainsinukraineforpropervaccineselectionfordiseaseprevention AT polischukvp characterizationofvaccineandfieldibdvstrainsinukraineforpropervaccineselectionfordiseaseprevention
first_indexed	2023-05-20T17:44:02Z
last_indexed	2023-05-20T17:44:02Z
_version_	1796153965185859584
spelling	irk-123456789-1542602019-07-07T12:38:24Z Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention Pastyria, A.S. Budzanivska, I.G. Polischuk, V.P. Molecular and Cell Biotechnologies Infectious bursal disease virus (IBDV) causes a highly contagious disease in young chickens and is distributed worldwide. Primary viral antigen is VP2. The VP2 gene contains hypervariable re-gion (VP2 HRV). Mutations in this region lead to emergence of antigenically different IBDV strains. For IBDV prevention, vaccination is used. The efficacy of vaccination depends on the ge-netic closeness of field and vaccine strains. Aim of the study was to analyze nucleotide sequence of different vaccine and field strains of IBDV circulating in Ukrainian poultry farms. Methods. In this study 11 vaccine strains and 16 field isolates were used. RNA was extracted using a magnetic separation method, reverse transcription was carried out and PCR was performed using specific primers to the VP2 gene. Obtained amplicons were used for sequencing. Phylogenetic and amino acid analysis was performed with MEGA 6 software. Results. 11 vaccine strains formed 5 phy-logenetic clusters. Cluster I represented strains GM97, 228E and MB/20. Cluster II contained mild vaccine strains LC-75 and D78. Intermediate strains Winterfield-2512 and Lukert formed cluster III. ‘Hot’ vaccine strains MB and MB/3 formed cluster IV. Cluster V was represented by strains MB/5 and V877. After addition of 16 Ukrainian field strains the tree structure remained the same. 8 isolates clustered together with ‘hot’, 5 – with intermediate, and 3 – with mild vaccine strains. Amino acid analyses confirmed antigenic closeness among vaccine and field strains of the same cluster. Conclusion. The obtained data can be used for the vaccine selection for IBD pre-vention in each particular poultry farm of Ukraine. Вірус інфекційної бурсальної хвороби (ІБХ) викликає висококонтагіозне захворювання курчат та поширений у всьому світі. Головним антигеном є білок VP2. Ген VP2 містить гіперваріабельний регіон, мутації в якому призводять до появи нових антигенних варіантів вірусу ІБХ. Для попередження інфікування використовують вакцинацію, ефективність якої залежить від генетичної спорідненості вакцинних та польових штамів вірусу. Мета. проаналізувати нуклеотидну послідовність різних вакцинних та польових штамів вірусу ІБХ, поширених в господарствах України. Методи. У дослідженні було використано 11 вакцинних та 16 польових штамів вірусу ІБХ. РНК виділяли методом магнітної сорбції, здійснювали реакцію зворотної транскрипції та постановку ПЛР із специфічними праймерами до гену VP2. Амплікони секвенували, нуклеотидну та амінокислотну послідовність аналізували за допомогою програми MEGA 6. Результати. 11 вакцинних штамів формували 5 кластерів. Кластер І містив штами GM97, 228E та MB/20. Кластер ІІ бус сформований м’якими штамами LC-75 та D78. Середні штами Winterfield-2512 та Lukert формували кластер ІІІ. «Гарячі» штами MB та MB/3 містились у кластері IV. Кластер V містив штами MB/5 та V877. Після включення 16 польових ізолятів, виявлених в Україні, структура дерева не змінилась. Вісім з них групувалися разом з «гарячими», 5 – з середніми та 3 – з м’якими вакцинними штамами. Порівняння амінокислотних послідовностей підтвердило антигенну спорідненість штамів, що знаходились в одному кластері. Висновки. Отримані результати можуть бути використані для підбору вакцин для профілактики ІБХ в кожному окремому господарстві України. Вирус инфекционной бурсальной болезни (ИББ) вызывает высококонтагиозное заболевание цыплят и распространен во всем мире. Главным антигеном вируса является белок VP2. Ген VP2 содержит гипервариабельный регион, мутации в котором приводят к появлению новых антигенных вариантов вируса ИББ. Для предупреждения инфицирования используют вакцинацию, эффективность которой зависит от генетического родства вакцинных и полевых штаммов вируса. Цель. проанализировать нуклеотидную последовательность различных вакцинных и полевых штаммов вируса ИББ, распространенных в хозяйствах Украины. Методы. В исследовании были использованы 11 вакцинных и 16 полевых штаммов вируса ИББ. РНК выделяли методом магнитной сорбции, осуществляли реакцию обратной транскрипции и постановку ПЦР со специфическими праймерами к гену VP2. Ампликоны секвенировали, нуклеотидную и аминокислотную последовательность анализировали с помощью программы MEGA 6. Результаты. 11 вакцинных штаммов формировали 5 кластеров. Кластер I содержал штаммы GM97, 228E и MB/20. Кластер II был сформирован мягкими штаммами LC-75 и D78. Средние штаммы Winterfield-2512 и Lukert формировали кластер ІІІ. «Горячие» штаммы MB и MB/3 содержались в кластере IV. Кластер V содержал штаммы MB/5 и V877. После включения 16 полевых изолятов, выявленных в Украине, структура дерева не изменилась. Восемь из них группировались вместе с «горячими», 5 – средними и 3 – мягкими вакцинными штаммами. Сравнение аминокислотных последовательностей подтвердило антигенное родство штаммов, находящихся в одном кластере. Выводы. Полученные результаты могут быть использованы для подбора вакцин для профилактики ИБХ в каждом отдельном хозяйстве Украины. 2018 Article Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention / A.S. Pastyria, I.G. Budzanivska, V.P. Polischuk // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 1. — С. 24-31. — Бібліогр.: 15 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00096D http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154260 578 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України

Characterization of vaccine and field IBDV strains in Ukraine for proper vaccine selection for disease prevention

Репозитарії

Схожі ресурси