Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors

Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors

Aim. To assess relative expression (RE) levels of genes involved in lipid metabolism in prostate tumors. To define clinically significant specific alterations on the basis of the expression pattern. Methods. RE levels were analyzed in 37 samples of prostate cancer tissues by quantitative RT-PCR. The...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2018
Автори: Gerashchenko, G.V., Kononenko, O.A., Bondarenko, Yu.M., Stakhovsky, E.O., Kashuba, V.I.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2018
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Biomedicine
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154367
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors / G.V. Gerashchenko, O.A. Kononenko, Yu.M. Bondarenko, E.O. Stakhovsky, V.I. Kashuba // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 445-460. — Бібліогр.: 37 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-154367
record_format dspace
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Biomedicine
Biomedicine
spellingShingle Biomedicine
Biomedicine
Gerashchenko, G.V.
Kononenko, O.A.
Bondarenko, Yu.M.
Stakhovsky, E.O.
Kashuba, V.I.
Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
Вiopolymers and Cell
description Aim. To assess relative expression (RE) levels of genes involved in lipid metabolism in prostate tumors. To define clinically significant specific alterations on the basis of the expression pattern. Methods. RE levels were analyzed in 37 samples of prostate cancer tissues by quantitative RT-PCR. The tumors were of a different Gleason score (GS) and various stages; the paired conventionally normal prostate tissue (CNT) samples and 20 samples of prostate adenomas were also analyzed. Results. Increased RE levels of FASN and COX2 were found in an adenocarcinoma group and in adenocarcinomas with GS=7 compared to the adenoma group. Four genes, namely FASN, LDLR, HMGCR and COX2, demonstrated significant RE alterations in the adenocarcinoma groups at different stages compared to the adenoma and CNT groups. Expression of three genes (LDLR, HMGCR, COX2) showed a negative correlation with stage and GS in the adenocarcinoma group. For FASN, LDLR, HMGCR, several positive correlations of RE with levels of the epithelial cell markers were found. CPT1C and COX2 demonstrated positive correlations of RE with expression of mesenchymal, fibroblast and inflammation markers in the adenocarcinoma group. Conclusions. The studied genes controlling lipid metabolism showed differential RE in prostate cancer samples. RE levels of FASN, HMGCR and COX2 might be used as markers of sensitivity and efficacy of inhibitory drugs. Further studies are needed to confirm these data in a larger patient cohort.
format Article
author Gerashchenko, G.V.
Kononenko, O.A.
Bondarenko, Yu.M.
Stakhovsky, E.O.
Kashuba, V.I.
author_facet Gerashchenko, G.V.
Kononenko, O.A.
Bondarenko, Yu.M.
Stakhovsky, E.O.
Kashuba, V.I.
author_sort Gerashchenko, G.V.
title Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
title_short Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
title_full Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
title_fullStr Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
title_full_unstemmed Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
title_sort expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2018
topic_facet Biomedicine
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154367
citation_txt Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors / G.V. Gerashchenko, O.A. Kononenko, Yu.M. Bondarenko, E.O. Stakhovsky, V.I. Kashuba // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 445-460. — Бібліогр.: 37 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT gerashchenkogv expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors
AT kononenkooa expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors
AT bondarenkoyum expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors
AT stakhovskyeo expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors
AT kashubavi expressionpatternsofgenesthatregulatelipidmetabolisminprostatetumors
first_indexed 2023-05-20T17:44:21Z
last_indexed 2023-05-20T17:44:21Z
_version_ 1796153977128091648
spelling irk-123456789-1543672019-07-07T12:25:16Z Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors Gerashchenko, G.V. Kononenko, O.A. Bondarenko, Yu.M. Stakhovsky, E.O. Kashuba, V.I. Biomedicine Aim. To assess relative expression (RE) levels of genes involved in lipid metabolism in prostate tumors. To define clinically significant specific alterations on the basis of the expression pattern. Methods. RE levels were analyzed in 37 samples of prostate cancer tissues by quantitative RT-PCR. The tumors were of a different Gleason score (GS) and various stages; the paired conventionally normal prostate tissue (CNT) samples and 20 samples of prostate adenomas were also analyzed. Results. Increased RE levels of FASN and COX2 were found in an adenocarcinoma group and in adenocarcinomas with GS=7 compared to the adenoma group. Four genes, namely FASN, LDLR, HMGCR and COX2, demonstrated significant RE alterations in the adenocarcinoma groups at different stages compared to the adenoma and CNT groups. Expression of three genes (LDLR, HMGCR, COX2) showed a negative correlation with stage and GS in the adenocarcinoma group. For FASN, LDLR, HMGCR, several positive correlations of RE with levels of the epithelial cell markers were found. CPT1C and COX2 demonstrated positive correlations of RE with expression of mesenchymal, fibroblast and inflammation markers in the adenocarcinoma group. Conclusions. The studied genes controlling lipid metabolism showed differential RE in prostate cancer samples. RE levels of FASN, HMGCR and COX2 might be used as markers of sensitivity and efficacy of inhibitory drugs. Further studies are needed to confirm these data in a larger patient cohort. Мета. Встановити рівні відносної експресії (ВЕ) генів, що задіяні у ліпідному метаболізмі у пухлинах передміхурової залози. На основі цих патернів виявити клінічно-значущі специфічні порушення. Методи. ВЕ була встановлена у 37 зразках раку передміхурової залози (П) методом ПЛР у реальному часі. Пухлини були з різним ступенем Глісону (СГ) та різними стадіями. Крім того ВЕ виявлена у парних умовно-нормальних тканинах (УНТ) та аденомах (А) передміхурової залози. Результати. Підвищені рівні ВЕ FASN та COX2 знайдено у групі аденокарцином та аденокарцином зі СГ=7 порівняно з групою аденом. Чотири гени, а саме FASN, LDLR, HMGCR та COX2 продемонстрували значущі порушення ВЕ у групах аденокарцином з різними стадіями у порівнянні з групою аденом та УНТ. Три гени (LDLR, HMGCR, COX2) показали значущі негативні кореляції зі стадіями та СГ у групі аденокарцином. Для генів FASN, LDLR, HMGCR виявлена низка позитивних кореляцій ВЕ з маркерами епітеліальних клітин, тоді як для генів CPT1С та COX2 знайдено ряд позитивних кореляцій ВЕ з маркерами мезенхімальних клітин, фібробластів та запалення у групі аденокарцином. Висновки. Досліджені гени, що залучені до контролю ліпідного метаболізму показали диференційну експресію у пухлинах передміхурової залози. Рівні ВЕ генів FASN, HMGCR та COX2 можуть бути маркерами чутливості та ефективності препаратів-інгібіторів експресії генів. Для підтвердження отриманих результатів необхідні додаткові дослідження на більшій вибірці пацієнтів. Цель. Установить урони относительной экспрессии (ОЭ) генов, участвующих в липидном метаболизме в опухолях простаты. На основе этих паттернов выявить клинически-значимые специфические нарушения. Методы. ОЭ была установлена в 37 образцах рака простаты (О) методом ПЦР в реальном времени. Были использованы опухоли с разной степенью Глиссона (СГ) и различными стадиями заболевания. Кроме того ОЭ установлена в условно-нормальных тканях (УНТ) и аденомах (А) простаты. Результаты. Повышенные уровни ОЭ FASN и COX2 выявлены в группах аденокарцином и аденокарцином с СГ=7 по сравнению с группой аденом. Четыре гена, а именно FASN, LDLR, HMGCR и COX2 показали значимые изменения ОЭ в группах аденокарцином с разными стадиями по сравнению с группой аденом и УНТ. Три гена (LDLR, HMGCR, COX2) показали значимые негативные корреляции со стадией и СГ в группе аденокарцином. Для генов FASN, LDLR, HMGCR выявлен ряд позитивных корреляций ОЭ с маркерами эпителиальных клеток, тогда как для генов CPT1С и COX2 найден ряд позитивных корреляций с маркерами мезенхимальных клеток, фибробластов и воспаления в группе аденокарцином. Выводы. Исследованные гены, участвующие в контроле липидного метаболизма, показали дифференциальную экспрессию в опухолях простаты. Уровни ОЭ генов FASN, HMGCR и COX2 могут быть маркерами чувствительности и эффективности препаратов-ингибиторов экспрессии. Для подтверждения полученных результатов необходимы дополнительные исследования на большей выборке пациентов. 2018 Article Expression patterns of genes that regulate lipid metabolism in prostate tumors / G.V. Gerashchenko, O.A. Kononenko, Yu.M. Bondarenko, E.O. Stakhovsky, V.I. Kashuba // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 445-460. — Бібліогр.: 37 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000990 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154367 577.218+616.65 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України

Схожі ресурси