2025-02-22T16:38:32-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: Query fl=%2A&wt=json&json.nl=arrarr&q=id%3A%22irk-123456789-154396%22&qt=morelikethis&rows=5
2025-02-22T16:38:32-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: => GET http://localhost:8983/solr/biblio/select?fl=%2A&wt=json&json.nl=arrarr&q=id%3A%22irk-123456789-154396%22&qt=morelikethis&rows=5
2025-02-22T16:38:32-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: <= 200 OK
2025-02-22T16:38:32-05:00 DEBUG: Deserialized SOLR response
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform
Aim. To identify a splicing mRNA of S6K1 kinase specific for the p60-S6K1 isoform alone. Methods. RT-PCR, DNA sequencing, Western blotting. Results. RT-PCR analysis of total RNA extracted from MCF-7 cells and subsequent DNA sequencing revealed a novel S6K1 splice variant that possesses additional ex...
Saved in:
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2019
|
| Series: | Вiopolymers and Cell |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154396 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| id |
irk-123456789-154396 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| topic |
Structure and Function of Biopolymers Structure and Function of Biopolymers |
| spellingShingle |
Structure and Function of Biopolymers Structure and Function of Biopolymers Zaiets, I.V. Holiar, V.V. Filonenko, V.V. Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform Вiopolymers and Cell |
| description |
Aim. To identify a splicing mRNA of S6K1 kinase specific for the p60-S6K1 isoform alone. Methods. RT-PCR, DNA sequencing, Western blotting. Results. RT-PCR analysis of total RNA extracted from MCF-7 cells and subsequent DNA sequencing revealed a novel S6K1 splice variant that possesses additional exon 1a and encodes the p60 isoform of S6K1 only. Moreover, RT-PCR and western blotting were applied to estimate the expression levels of the p60-S6K1 mRNA and protein. A heterogeneous expression of the p60-S6K1 transcript was observed; it did not correlate with the total S6K1 mRNA expression and with the protein content of p60-S6K1 in the studied cell lines. Conclusions. We provide the evidence for the existence of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform. The cell can employ two distinct pathways of the p60-S6K1 expression based on alternative translation of mRNA common for the main S6K1 isoforms mRNA and/or translation of the novel p60-S6K1 specific mRNA. Since the levels of the p60-S6K1 transcript expression do not correlate with the expression of total S6K1 mRNA, it is plausible that the p60-S6K1 isoform plays a role distinct from that of other isoforms in cellular physiology, as well as in the development of S6K1-related pathologies. |
| format |
Article |
| author |
Zaiets, I.V. Holiar, V.V. Filonenko, V.V. |
| author_facet |
Zaiets, I.V. Holiar, V.V. Filonenko, V.V. |
| author_sort |
Zaiets, I.V. |
| title |
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform |
| title_short |
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform |
| title_full |
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform |
| title_fullStr |
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform |
| title_full_unstemmed |
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform |
| title_sort |
identification of a novel s6k1 splice variant coding for the p60-s6k1 isoform |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2019 |
| topic_facet |
Structure and Function of Biopolymers |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154396 |
| citation_txt |
Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform / I.V. Zaiets, V.V. Holiar, V.V. Filonenko // Вiopolymers and Cell. — 2019. — Т. 35, № 2. — С. 99-106. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
| series |
Вiopolymers and Cell |
| work_keys_str_mv |
AT zaietsiv identificationofanovels6k1splicevariantcodingforthep60s6k1isoform AT holiarvv identificationofanovels6k1splicevariantcodingforthep60s6k1isoform AT filonenkovv identificationofanovels6k1splicevariantcodingforthep60s6k1isoform |
| first_indexed |
2023-05-20T17:44:35Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:44:35Z |
| _version_ |
1796153985553399808 |
| spelling |
irk-123456789-1543962019-07-07T13:02:49Z Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform Zaiets, I.V. Holiar, V.V. Filonenko, V.V. Structure and Function of Biopolymers Aim. To identify a splicing mRNA of S6K1 kinase specific for the p60-S6K1 isoform alone. Methods. RT-PCR, DNA sequencing, Western blotting. Results. RT-PCR analysis of total RNA extracted from MCF-7 cells and subsequent DNA sequencing revealed a novel S6K1 splice variant that possesses additional exon 1a and encodes the p60 isoform of S6K1 only. Moreover, RT-PCR and western blotting were applied to estimate the expression levels of the p60-S6K1 mRNA and protein. A heterogeneous expression of the p60-S6K1 transcript was observed; it did not correlate with the total S6K1 mRNA expression and with the protein content of p60-S6K1 in the studied cell lines. Conclusions. We provide the evidence for the existence of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform. The cell can employ two distinct pathways of the p60-S6K1 expression based on alternative translation of mRNA common for the main S6K1 isoforms mRNA and/or translation of the novel p60-S6K1 specific mRNA. Since the levels of the p60-S6K1 transcript expression do not correlate with the expression of total S6K1 mRNA, it is plausible that the p60-S6K1 isoform plays a role distinct from that of other isoforms in cellular physiology, as well as in the development of S6K1-related pathologies. Мета. З'ясувати можливість існування сплайсової мРНК кінази S6К1 специфічної виключно для р60-S6К1 ізоформи. Методи. ЗТ-ПЛР, ДНК секвенування, Вестерн-блоттинг. Результати. ЗТ-ПЛР аналіз тотальної РНК, виділеної із клітин лінії MCF-7, з наступним секвенуванням ДНК виявив новий сплайсовий варіант мРНК S6K1, що містить додатковий екзон 1а і кодує лише p60 ізоформу S6K1. Для оцінки рівня експресії p60-S6K1 мРНК та білку було застосовано ЗТ-ПЛР та вестерн-блот. Результати. вказують на гетерогенну експресію транскрипту p60-S6K1, що не корелює ні з експресією загальної S6K1 мРНК, ні з білковим вмістом p60-S6K1 у досліджуваних клітинних лініях. Висновки. Надано докази існування нової сплайсової мРНК S6K1, яка кодує ізоформу p60-S6K1, що свідчить про існування в клітині двох незалежних шляхів експресії p60-S6K1, а саме альтернативну трансляцію спільної для головних S6K1 ізоформ мРНК та/чи трансляцію нової специфічної лише для р60-S6K1 сплайсової мРНК. Оскільки рівень експресії p60-S6K1 транскрипту в різних клітинних лініях не корелює із експресією загальної мРНК S6K1, цілком можливо, що p60-S6K1 ізоформа може відігравати відмінну від інших S6K1 ізоформ роль у клітинній фізіології, а також при розвитку патологій, які пов’язані із S6K1. Цель. Выяснить возможность существования сплайсинговой мРНК киназы S6К1 специфической исключительно для р60-S6К1 изоформы. Методы. ОТ-ПЦР, ДНК секвенирование, Вестерн-блоттинг. Результаты. ОТ-ПЦР анализ тотальной РНК, выделенной из клеток линии MCF-7, с последующим секвенированием ДНК выявил новый сплайсовый вариант S6K1, содержит дополнительный экзон 1а и кодирует только изоформу p60-S6K1. Далее были использованы ОТ-ПЦР и вестерн-блоттинг для оценки уровней p60-S6K1 мРНК и белка. Результаты показали гетерогенную экспрессию транскрипта p60-S6K1, экспрессия которого не коррелировала ни с тотальной S6K1 мРНК, ни с белковым содержанием p60-S6K1 в исследуемых клеточных линиях. Выводы. Предоставлены доказательства существования нового сплайсового варианта S6K1, который кодирует изоформу p60-S6K1, что указывает на существование в клетке двух независимых путей экспрессии p60-S6K1 изоформы, а именно альтернативную трансляцию общей для основных изоформ мРНК и/или трансляцию новой специфичной лишь для p60-S6K1 сплайсовой мРНК. Поскольку уровень экспрессии p60-S6K1 транскрипта в различных клеточных линиях не коррелируют с экспрессией тотальной S6K1 мРНК, можно предположить, что p60-S6K1 изоформа может играть отличную то других S6K1 изоформ роль в клеточной физиологии, а также при развитии патологий, которые связаны с S6K1. 2019 Article Identification of a novel S6K1 splice variant coding for the p60-S6K1 isoform / I.V. Zaiets, V.V. Holiar, V.V. Filonenko // Вiopolymers and Cell. — 2019. — Т. 35, № 2. — С. 99-106. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00099B http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154396 577 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |