Transcription factor CTCF and mammalian genome organization
The CTCF transcription factor is thought to be one of the main participants in various gene regulatory networks including transcription activation and repression, formation of independently functioning chromatin domains, regulation of imprinting etc. Sequencing of human and other genomes opened up a...
Збережено в:
| Дата: | 2014 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Назва видання: | Вiopolymers and Cell |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154432 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Transcription factor CTCF and mammalian genome organization / E.S. Kotova, S.B. Akopov, E.D. Sverdlov, L.G. Nikolaev // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 260-272. — Бібліогр.: 151 назв. — англ, рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-154432 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1544322019-06-16T01:28:45Z Transcription factor CTCF and mammalian genome organization Kotova, E.S. Akopov, S.B. Sverdlov, E.D. Nikolaev, L.G. Reviews The CTCF transcription factor is thought to be one of the main participants in various gene regulatory networks including transcription activation and repression, formation of independently functioning chromatin domains, regulation of imprinting etc. Sequencing of human and other genomes opened up a possibility to ascertain the genomic distribution of CTCF binding sites and to identify CTCF-dependent cis-regulatory elements, including insulators. In the review, we summarized recent data on CTCF functioning within a framework of the chromatin loop domain hypothesis of large-scale regulation of the genome activity. Its fundamental properties allow CTCF to serve as a transcription factor, an insulator protein and a dispersed genome-wide demarcation tool able to recruit various factors that emerge in response to diverse external and internal signals, and thus to exert its signal-specific function(s). Фактор транскрипції CTCF вважають одним з основних учасни- ків різних мереж регуляції генів, з-поміж яких активація і репресія транскрипції, утворення незалежно функціонуючих доменів хроматину, регуляція імпринтингу тощо. Секвенування геномів людини та інших организмів дозволяє виявляти геномний розподіл сайтів зв’язування CTCF та ідентифікувати CTCF-залежні регуляторні елементи, до яких належать інсулятори. В огляді підсумовано нові дані з функціонування CTCF у рамках гіпотези участі петельних доменів хроматину у великомасштабній регуляції активності геному. Фундаментальні властивості CTCF дозволяють йому діяти як регулятор транскрипції, інсуляторний білок, а також як розподілений по геному прикордонний елемент,здатний залучати різні фактори, які з’являються у відповідь на різноманітні зовнішні та внутрішні чинники і таким чином виконувати свої сигнал-специфічні функції. Фактор транскрипции CTCF считается одним из основных участников различных сетей регуляции генов, включая активацию и репрессию транскрипции, образование независимо функционирующих доменов хроматина, регуляцию импринтинга и т. д. Секвенирование геномов человека и других организмов позволяет выявить геномное рапределение сайтов связывания CTCF и идентифицировать CTCF-зависимые регуляторные элементы, включая инсуляторы. В обзоре суммированы новые данные по функционированию CTCF в рамках гипотезы участия петельных доменов хроматина в крупномасштабной регуляции активности генома. Фундаментальные свойства CTCF позволяют ему действовать как регулятор транскрипции, инсуляторный белок, а также как распределенный по геному пограничный элемент, способный привлекать различные факторы, появляющиеся в ответ на разнообразные внешние и внутренние воздействия и таким образом осуществлять свои сигнал-специфичные функции. 2014 Article Transcription factor CTCF and mammalian genome organization / E.S. Kotova, S.B. Akopov, E.D. Sverdlov, L.G. Nikolaev // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 260-272. — Бібліогр.: 151 назв. — англ, рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00089F http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154432 577.214.6 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| topic |
Reviews Reviews |
| spellingShingle |
Reviews Reviews Kotova, E.S. Akopov, S.B. Sverdlov, E.D. Nikolaev, L.G. Transcription factor CTCF and mammalian genome organization Вiopolymers and Cell |
| description |
The CTCF transcription factor is thought to be one of the main participants in various gene regulatory networks including transcription activation and repression, formation of independently functioning chromatin domains, regulation of imprinting etc. Sequencing of human and other genomes opened up a possibility to ascertain the genomic distribution of CTCF binding sites and to identify CTCF-dependent cis-regulatory elements, including insulators. In the review, we summarized recent data on CTCF functioning within a framework of the chromatin loop domain hypothesis of large-scale regulation of the genome activity. Its fundamental properties allow CTCF to serve as a transcription factor, an insulator protein and a dispersed genome-wide demarcation tool able to recruit various factors that emerge in response to diverse external and internal signals, and thus to exert its signal-specific function(s). |
| format |
Article |
| author |
Kotova, E.S. Akopov, S.B. Sverdlov, E.D. Nikolaev, L.G. |
| author_facet |
Kotova, E.S. Akopov, S.B. Sverdlov, E.D. Nikolaev, L.G. |
| author_sort |
Kotova, E.S. |
| title |
Transcription factor CTCF and mammalian genome organization |
| title_short |
Transcription factor CTCF and mammalian genome organization |
| title_full |
Transcription factor CTCF and mammalian genome organization |
| title_fullStr |
Transcription factor CTCF and mammalian genome organization |
| title_full_unstemmed |
Transcription factor CTCF and mammalian genome organization |
| title_sort |
transcription factor ctcf and mammalian genome organization |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2014 |
| topic_facet |
Reviews |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154432 |
| citation_txt |
Transcription factor CTCF and mammalian genome organization / E.S. Kotova, S.B. Akopov, E.D. Sverdlov, L.G. Nikolaev // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 4. — С. 260-272. — Бібліогр.: 151 назв. — англ, рос. |
| series |
Вiopolymers and Cell |
| work_keys_str_mv |
AT kotovaes transcriptionfactorctcfandmammaliangenomeorganization AT akopovsb transcriptionfactorctcfandmammaliangenomeorganization AT sverdloved transcriptionfactorctcfandmammaliangenomeorganization AT nikolaevlg transcriptionfactorctcfandmammaliangenomeorganization |
| first_indexed |
2023-05-20T17:44:24Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:44:24Z |
| _version_ |
1796153978965196800 |