The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype

The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype

Aim. To estimate WaaL ligase contribution in the lipopolysaccharide (LPS) phenotype profile formation of Y. enterocolitica O:3 (YeO3) bacteria. Methods. The waaL-knock-out mutants were created by an allelic exchange strategy. The LPS phenotypes of created mutants were visualized by silver-stained DO...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2014
Автори: Shevchenko, J.I., Pozur, V.K., Skurnik, M.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2014
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Structure and Function of Biopolymers
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154571
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype / J.I. Shevchenko, V.K. Pozur, M. Skurnik // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 6. — С. 443-447. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-154571
record_format dspace
spelling irk-123456789-1545712019-06-16T01:31:30Z The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype Shevchenko, J.I. Pozur, V.K. Skurnik, M. Structure and Function of Biopolymers Aim. To estimate WaaL ligase contribution in the lipopolysaccharide (LPS) phenotype profile formation of Y. enterocolitica O:3 (YeO3) bacteria. Methods. The waaL-knock-out mutants were created by an allelic exchange strategy. The LPS phenotypes of created mutants were visualized by silver-stained DOC-PAGE and immunoblotting with specific outer core (core oligosaccharide, hexasaccharide, OC) and O-polysaccharide (OPS or O-Ag) monoclonal antibodies. Results. Deletion of waaLOS gene from YeO3 genome has a marked effect on OC ligation in either single or double mutants. The waaLPS deletion has an opposite effect on the OPS ligation – barely detected increasing of OPS bands. Conclusions. The LPS ligases of YeO3 exhibit relaxed donor substrate specificity. Under given conditions the effect of WaaLOS ligase is more significant for OC and OPS ligation onto lipid A than that of WaaLPS. Мета. Дослідити участь лігаз WaaL у формуванні фенотипу ліпополісахариду (LPS) серед бактерій Y. enterocolitica O:3 (YeO3). Методи. Нокаутні мутанти по генах лігаз waaL створено внаслідок обміну алелями. Фенотипи LPS отриманих мутантів візуалізували, забарвлюючи сріблом гель DOC-PAGE, а також використовували імуноблот зі специфічними моноклональними антитілами до кору (корового олігосахариду, гексасахариду, ОC) та О-полісахариду (OPS, O-Ag). Результати. Делеція гена лігази waaLOS з геному бактерій YeO3 чинить помітний вплив на лігування ОC як в одиночних, так і в подвійних мутантах. Проте маніпуляції з геном лігази waaLPS призводять до ледь помітної стимуляції утворення OPS. Висновки. Лігази LPS бактерій YeO3 демонструють низьку субстратну специфічність. Участь лігази WaaLOS у формуванні повноцінної структури LPS є суттєвішою, аніж WaaLPS, за даних умов. Цель. Исследовать участие лигаз WaaL в формировании фенотипа липополисахарида (LPS) среди бактерий Y. enterocolitica O:3 (YeO3). Методы. Нокаутные мутанты по генам лигаз waaL созданы вследствие обмена аллелями. Фенотипы LPS полученных мутантов визуализировали, окрашивая серебром гель DOC-PAGE, а также с использованием иммуноблота со специфическими моноклональными антителами к кору (коровому олигосахариду, гексасахариду, OC) и О-полисахариду (OPS, O-Ag). Результаты. Делеция гена лигазы waaLOS из генома бактерий YeO3 оказывает заметное влияние на лигирование OC как в одиночных, так и двойных мутантах. Однако манипуляции с геном лигаз waaLPS приводят к едва заметной стимуляции образования OPS. Выводы. Лигазы LPS бактерий YeO3 демонстрируют низкую субстратную специфичность. Участие лигазы WaaLOS в образовании полноценной структуры LPS является более существенным, чем WaaLPS, при данных условиях. 2014 Article The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype / J.I. Shevchenko, V.K. Pozur, M. Skurnik // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 6. — С. 443-447. — Бібліогр.: 8 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0008BE http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154571 579.234 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Structure and Function of Biopolymers
Structure and Function of Biopolymers
spellingShingle Structure and Function of Biopolymers
Structure and Function of Biopolymers
Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
Вiopolymers and Cell
description Aim. To estimate WaaL ligase contribution in the lipopolysaccharide (LPS) phenotype profile formation of Y. enterocolitica O:3 (YeO3) bacteria. Methods. The waaL-knock-out mutants were created by an allelic exchange strategy. The LPS phenotypes of created mutants were visualized by silver-stained DOC-PAGE and immunoblotting with specific outer core (core oligosaccharide, hexasaccharide, OC) and O-polysaccharide (OPS or O-Ag) monoclonal antibodies. Results. Deletion of waaLOS gene from YeO3 genome has a marked effect on OC ligation in either single or double mutants. The waaLPS deletion has an opposite effect on the OPS ligation – barely detected increasing of OPS bands. Conclusions. The LPS ligases of YeO3 exhibit relaxed donor substrate specificity. Under given conditions the effect of WaaLOS ligase is more significant for OC and OPS ligation onto lipid A than that of WaaLPS.
format Article
author Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
author_facet Shevchenko, J.I.
Pozur, V.K.
Skurnik, M.
author_sort Shevchenko, J.I.
title The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_short The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_full The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_fullStr The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_full_unstemmed The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype
title_sort effect of waal genes deletion from yersinia enterocolitica o:3 genome on bacteria lps’ phenotype
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2014
topic_facet Structure and Function of Biopolymers
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154571
citation_txt The effect of waaL genes deletion from Yersinia enterocolitica O:3 genome on bacteria LPS’ phenotype / J.I. Shevchenko, V.K. Pozur, M. Skurnik // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 6. — С. 443-447. — Бібліогр.: 8 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT shevchenkoji theeffectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT pozurvk theeffectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT skurnikm theeffectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT shevchenkoji effectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT pozurvk effectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
AT skurnikm effectofwaalgenesdeletionfromyersiniaenterocoliticao3genomeonbacterialpsphenotype
first_indexed 2023-05-20T17:44:56Z
last_indexed 2023-05-20T17:44:56Z
_version_ 1796153998699397120

Схожі ресурси