Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК

На основе атом-атомных потенциальных функций проведено численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований в модели тринуклеотида В-формы молекулы ДНК. При помощи расчетов методом молекулярной динамики и изучения топологии поверхности потенциальной энергии, соответствующей...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Видавець:Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Дата:1994
Автор: Егоренков, А.И.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1994
Назва видання:Биополимеры и клетка
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155061
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК / А.И. Егоренков // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 79-85. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-155061
record_format dspace
spelling irk-123456789-1550612019-06-17T01:30:44Z Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК Егоренков, А.И. На основе атом-атомных потенциальных функций проведено численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований в модели тринуклеотида В-формы молекулы ДНК. При помощи расчетов методом молекулярной динамики и изучения топологии поверхности потенциальной энергии, соответствующей анализируе­мому типу конформационной подвижности, исследована степень скоррелированности не­которых типов движений азотистых оснований раскрывающейся пары молекулы ДНК и показана зависимость путей раскрытия центральной пары от нуклеотидного состава фрагмента ДНК. На основі атом-атомних потенціальних функцій здійснено чисельне моделювання динаміки локального розкриття пар азотистих основ у моделі тринуклеотида В-форми мо­лекули ДНК. За допомогою розрахунків методом молекулярної динаміки та вивчення топологи поверхні потенидальної енергії, що відповідає досліджуваному типові конформаційної рухливості, проаналізовано ступені скорельованості деяких типів руxiв азотистих основ пари, що розкривається, молекули ДНК i показано залежність шляхів розкриття центральної пари віднуклеотидного складу фрагмента ДНК. The method of atom-atomic potentials has permitted to realize the numerical simulation of local base pairs opening in a trinucleotide model of B-form DNA molecule. Having used molecular dynamics calculation and also data concerning potential energy surfase topology adequate to a type of conformation flexibility studied here, the author has determined correlation degree for some types of DNA bases movements in any opening DNA bases pair and has shown the dependence of opening processes in a central nucleotide pair on nucleotide content of DNA duplex being studied. 1994 Article Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК / А.И. Егоренков // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 79-85. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003A9 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155061 547.963.3 + 577.323 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
description На основе атом-атомных потенциальных функций проведено численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований в модели тринуклеотида В-формы молекулы ДНК. При помощи расчетов методом молекулярной динамики и изучения топологии поверхности потенциальной энергии, соответствующей анализируе­мому типу конформационной подвижности, исследована степень скоррелированности не­которых типов движений азотистых оснований раскрывающейся пары молекулы ДНК и показана зависимость путей раскрытия центральной пары от нуклеотидного состава фрагмента ДНК.
format Article
author Егоренков, А.И.
spellingShingle Егоренков, А.И.
Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
Биополимеры и клетка
author_facet Егоренков, А.И.
author_sort Егоренков, А.И.
title Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
title_short Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
title_full Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
title_fullStr Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
title_full_unstemmed Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК
title_sort численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы днк
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 1994
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155061
citation_txt Численное моделирование динамики локального раскрытия пар азотистых оснований молекулы ДНК / А.И. Егоренков // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 2. — С. 79-85. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
series Биополимеры и клетка
work_keys_str_mv AT egorenkovai čislennoemodelirovaniedinamikilokalʹnogoraskrytiâparazotistyhosnovanijmolekulydnk
first_indexed 2023-05-20T17:45:36Z
last_indexed 2023-05-20T17:45:36Z
_version_ 1796154024966225920