On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins

On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins

Calculating decay-associated spectra (DAS) is a common mode of analyzing complex fluorescence decay in proteins. Unfortunately, these spectra are attributed almost exclusively to certain species in the population of macromolecules (retainers), often without sufficient evidence. An alternative explan...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2001
Автор: Ladokhin, A.S.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2001
Назва видання:Біополімери і клітина
Теми:
Структура та функції біополімерів
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155228
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins / A.S. Ladokhin // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 3. — С. 221-224. — Бібліогр.: 14 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-155228
record_format dspace
spelling irk-123456789-1552282019-07-05T22:23:01Z On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins Ladokhin, A.S. Структура та функції біополімерів Calculating decay-associated spectra (DAS) is a common mode of analyzing complex fluorescence decay in proteins. Unfortunately, these spectra are attributed almost exclusively to certain species in the population of macromolecules (retainers), often without sufficient evidence. An alternative explanation of decay heterogeneity, based on structural relaxation., was believed to require a negative DAS component. Here we demonstrate that dipolar relaxation of the indole molecule, lacking any rotameric forms, doesn't always result in negative pre-exponential amplitude. We conclude that the shape of DAS alone is not sufficient to differentiate among various causes of heterogeneity of tryptophan fluorescence decay in proteins. Расчет спектров, ассоциированных с затуханием (САЗ), явля­ется обычным путем анализа сложного затухания флюорес­ценции в белках. К сожалению, эти спектры почти исключи­тельно относят к определенным видам в популяции молекул (ротамеров), часто без достаточных оснований Считалось, что альтернативное объяснение гетерогенности затухания, связанное со структурной релаксацией, требует отрицатель­ной компоненты САЗ. В данной работе мы демонстрируем, что дипольная релаксация молекулы индола, лишенной каких-либо ротамерных форм, не всегда приводит к отрицательным при-экспоненциальным амплитудам. Мы делаем вывод о том, что форма САЗ сама по себе недостаточна, чтобы опреде­лить среди других причину гетерогенности затухания триптофановой флюоресценции в белках. Обрахунок спектрів, асоційованих із затуханням (САЗ), є звичайним шляхом аналізу складного затухання флюоресценції в білках. На жаль, ці спектри майже виключно відносять до певних видів у популяції молекул (ротамерів), часто без достатніх на те підстав. Вважалося, що альтернативне пояснення гетерогенності затухання, пов'язане зі структур­ною релаксацією, потребує негативної компоненти САЗ. У цій роботі ми демонструємо, що дипольна релаксація молекули індолу, позбавленої будь-яких ротамерних форм, не завжди призводить до негативних при-експоненціальних амплітуд. Ми робимо висновок стосовно того, що форма САЗ сама по собі не є достатньою, щоб вирізнити серед інших причину гетерогенності затухання триптофанової флюоресценції в білках. 2001 Article On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins / A.S. Ladokhin // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 3. — С. 221-224. — Бібліогр.: 14 назв. — англ. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0005AE http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155228 577.32 + 577.322 en Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Структура та функції біополімерів
Структура та функції біополімерів
spellingShingle Структура та функції біополімерів
Структура та функції біополімерів
Ladokhin, A.S.
On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
Біополімери і клітина
description Calculating decay-associated spectra (DAS) is a common mode of analyzing complex fluorescence decay in proteins. Unfortunately, these spectra are attributed almost exclusively to certain species in the population of macromolecules (retainers), often without sufficient evidence. An alternative explanation of decay heterogeneity, based on structural relaxation., was believed to require a negative DAS component. Here we demonstrate that dipolar relaxation of the indole molecule, lacking any rotameric forms, doesn't always result in negative pre-exponential amplitude. We conclude that the shape of DAS alone is not sufficient to differentiate among various causes of heterogeneity of tryptophan fluorescence decay in proteins.
format Article
author Ladokhin, A.S.
author_facet Ladokhin, A.S.
author_sort Ladokhin, A.S.
title On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
title_short On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
title_full On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
title_fullStr On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
title_full_unstemmed On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
title_sort on the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2001
topic_facet Структура та функції біополімерів
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155228
citation_txt On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins / A.S. Ladokhin // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 3. — С. 221-224. — Бібліогр.: 14 назв. — англ.
series Біополімери і клітина
work_keys_str_mv AT ladokhinas ontheinterpretationofdecayassociatedfluorescencespectrainproteins
first_indexed 2023-05-20T17:46:23Z
last_indexed 2023-05-20T17:46:23Z
_version_ 1796154055055114240

Схожі ресурси