Моделирование стэкинга алкалоидов пуринового ряда методом Монте-Карло

• Дата: 1991
• Автори: Данилов, В.И., Слюсарчук, О.Н., Полтев, В.И., Брикманн, Ю.А.В., Алдерфер, Дж.Л., Вольман, Р.М.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1991
• Назва видання: Биополимеры и клетка
• Теми: Обзоры
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155252
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Моделирование стэкинга алкалоидов пуринового ряда методом Монте-Карло / В.И. Данилов, О.Н. Слюсарчук, В.И. Полтев, Ю.А.В. Брикманн, Дж.Л. Алдерфер, Р.М. Вольман // Биополимеры и клетка. — 1991. — Т. 7, № 5. — С. 5-14. — Бібліогр.: 24 назв. — рос.

Представлены результаты моделирования гидратации мономерных и возможных стопкообразных димерных форм алкалоидов пуринового ряда методом Монте-Карло в кластере из 200 молекул. Изучение различных форм стопкообразных пуриновых дилеров показало, что для кофеина существует один, для теофиллина – два, а для теобромина – четыре энергетически выгодных димера. Обнаружено, что основным фактором, стабилизирующим выгодные стопки, является изменение взаимодействия между молекулами воды, связанное с изменением структуры воды вокруг мономеров при их ассоциации. Проведенный анализ энергетических и структурных характеристик гидратации показал, что процесс ассоциации молекул алкалоидов в воде тесно связан с гидрофобным характером метильных групп. Изменение гидратных свойств алкалоидов пуринового ряда при переходе от мономерных форм к димерным может быть решающим при взаимодействии с биополимерами в первичных механизмах их фармакологического действия.