Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином
Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибриногена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС,...
Збережено в:
| Дата: | 1994 |
|---|---|
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1994
|
| Назва видання: | Биополимеры и клетка |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155613 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-155613 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1556132019-06-18T01:29:13Z Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибриногена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС, расстояние между донорскими и акцепторными атомами находится в пределах 2.0 – 2,2 Å. Конформационные расчеты свидетельствуют о том, что подобные взаимодействия могут обеспечить образование энергетически выгодного и стерически разрешенного комплекса рекогниции фибриноген – тромбин вне границ активного центра последнего. Предлагается гипотеза об усилении каталитического процесса вследствие конформационных изменений, сопровождающих формирование комплекса узнавания. Комплекс впізнавання фібриногена тромбіном, що складається з додаткового центра (ДЦ) зв'язування ферменту та комплементарного йому сайта (КС) на Аа-ланцюзі фібриногена, вивчали за допомогою молекулярного моделювання та конформаційного аналізу. Показано утворення чотирьох іводневих зв'язків між ДЦ та КС, відстань між донорськими та акцепторними атомами лежить у межах 2,0–2,2 Å. Конформаційні розрахунки стверджують, що ці взаємодії спроможні забезпечити створення енергетично вигідного та стерично дозволеного комплексу рекогніції фібриноген – тромбін поза межами активного центру останнього. Пропонується гіпотеза щодо підсилення каталітичного процесу внаслідок конформаційних змін, які супроводжують формування комплексу рекогніції. Fibrinogen-thrombin recognition complex consisting of enzyme additional binding exosite (ABE) and complementary site (CS) ir fibrinogen Aa-chain has been investigated by means of molecular modelling and conformational computer simulations. It is revealed that four hydrogen bonds between ABE and CS occur the distance between donor and acceptor atoms being 2.0–2.2 A. Energy estimations show that these interactions can ensure creation of energetically reliable complex of the thrombin with fibrinogen beyond the enzyme active center. Hypothesis is proposed that conformational changes arising in consequence of recognition complex formation may lead to promotion of catalytical process. 1994 Article Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0003C8 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155613 577.344 ru Биополимеры и клетка Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| description |
Комплекс узнавания фибриногена тромбином, состоящий из дополнительного центра (ДЦ) связывания фермента и комплементарного ему сайта (КС) на Аа-цепи фибриногена, изучали с помощью молекулярного моделирования и конформационного анализа. Показано возникновение четырех водородных связей между ДЦ и КС, расстояние между донорскими и акцепторными атомами находится в пределах 2.0 – 2,2 Å. Конформационные расчеты свидетельствуют о том, что подобные взаимодействия могут обеспечить образование энергетически выгодного и стерически разрешенного комплекса рекогниции фибриноген – тромбин вне границ активного центра последнего. Предлагается гипотеза об усилении каталитического процесса вследствие конформационных изменений, сопровождающих формирование комплекса узнавания. |
| format |
Article |
| author |
Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. |
| spellingShingle |
Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином Биополимеры и клетка |
| author_facet |
Карабут, Л.В. Щечкин, И.Е. Серейская, А.А. |
| author_sort |
Карабут, Л.В. |
| title |
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_short |
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_full |
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_fullStr |
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_full_unstemmed |
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| title_sort |
моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
1994 |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155613 |
| citation_txt |
Моделирование комплекса узнавания фибриногена тромбином / Л.В. Карабут, И.Е. Щечкин, А.А. Серейская // Биополимеры и клетка. — 1994. — Т. 10, № 6. — С. 83-87. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. |
| series |
Биополимеры и клетка |
| work_keys_str_mv |
AT karabutlv modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom AT ŝečkinie modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom AT serejskaâaa modelirovaniekompleksauznavaniâfibrinogenatrombinom |
| first_indexed |
2023-05-20T17:47:21Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:47:21Z |
| _version_ |
1796154089901391872 |