Структурный и термодинамический анализ комплексообразования йодистого пропидия с дезокситетрануклеотидом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии

• Дата: 2001
• Автори: Веселков, Д.А., Болотин, П.А., Сигаев, В.А., Дымант, Л.Н., Дэвис, Л.Н., Веселков, А.Н.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2001
• Назва видання: Біополімери і клітина
• Теми: Структура та функції біополімерів
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155765
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Структурный и термодинамический анализ комплексообразования йодистого пропидия с дезокситетрануклеотидом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ¹Н-ЯМР спектроскопии / Д.А. Веселков, П.А. Болотин, В.А. Сигаев, Л.Н. Дымант, Д.Б. Дэвис, А.Н. Веселков // Біополімери і клітина. — 2001. — Т. 17, № 5. — С. 363-373. — Бібліогр.: 28 назв. — рос.

В работе исследовано взаимодействие красителя фенантридинового ряда йодистого пропидия с самокомплементарным дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5'-d(TpGpCpA) в водно-соле­вом растворе методом одномерной и двухмерной ¹Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Измерены концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов взаимодейству­ющих молекул. Рассмотрены различные модели образования комплексов молекул красителя с тетрануклеотидом, рассчитаны равновесные константы, свободные энергии AG, энтальпии АН и энтропии AS реакций образования комплексов состава 1:1, 2:1, 1:2 и 2:2. Выявлены особенности динамического равновесия комплексов различного типа в зависимости от соотношения концент­раций красителя и тетрануклеотида и температуры. Сделано заключение о преимущественной интеркаляции пропидия в пиримидин-пуриновые d(T-G)- и (1(С-А)-сайты тетрануклеотида. На основании рассчитанных значений индуцированных химических сдвигов для протонов красителя и данных 2M-NOESY определены наиболее вероятные пространственные структуры 1:2 и 2:2 комплексов пропидия с тетрануклеотидом. Проведен сравнительный анализ гигрометров комплек­сообразования фенантридиновых красителей йодистого пропидия и бромистого этидия, а также акридинового красителя профлавина с дезокситетрануклеотидом d(TGCA) в идентичных услови­ях растворителя