Аналіз неструктурованих ділянок цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази людини методами біоінформатики

• Дата: 2005
• Автори: Одинець, К.О., Корнелюк, О.І.
• Формат: Стаття
• Мова: Ukrainian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2005
• Назва видання: Біополімери і клітина
• Теми: Біоінформатика
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155852
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Аналіз неструктурованих ділянок цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази людини методами біоінформатики / К.О. Одинець, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 5. — С. 446-453. — Бібліогр.: 27 назв. — укр.

Передбачено неструктуровані ділянки цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази ссавців методами біоінформатики з використанням 15 веб-серверів. Показано високу імовірність неструктурованого стану для рухливої «KMSKS»-петлі каталітичного центра (залишки Рго216–Lys231), яка набуває визначеної конформації під час каталітичного акта. Для ділянки межмодульного лінкера (залишки Asp343–Glu359) показано найбільшу імовірність перебування у неструктурованому стані. Порівняння цих даних з величинами В-факторів Cα-атомів кристалографічних структур N- і С-кінцевих модулів виявило чітку кореляцію даних біоінформатики і рентгеноструктурного аналізу. Наявність гнучкого міжмодульного лінкера є характерною ознакою білків, які містять EMAP ІІ-подібний С-кінцевий модуль. Висловлено гіпотезу стосовно того, що конформаційні перебудови у лінкерній ділянці можуть відігравати суттєву роль при форму- ванні комплексів цих білків з тРНК.