Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів

Проведено порівняльний біоінформаційний аналіз будови генів цитоплазматичних тирозил-тРНК синтетаз (TyrRS) 54 видів еукаріотів з різних таксонів. В окремих випадках перевірено коректність ідентифікації цих генів та їхніх екзонів шляхом зіставлення з відомими по слідовностями кДНК та EST. Порівняння...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2005
Автори:	Одинець, К.О., Корнелюк, О.І.
Формат:	Стаття
Мова:	Ukrainian
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2005
Назва видання:	Біополімери і клітина
Теми:	Біоінформатика
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155881
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів / К.О. Одинець, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 6. — С. 548-558. — Бібліогр.: 24 назв. — укр.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-155881
record_format	dspace
spelling	irk-123456789-1558812019-06-18T01:30:25Z Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів Одинець, К.О. Корнелюк, О.І. Біоінформатика Проведено порівняльний біоінформаційний аналіз будови генів цитоплазматичних тирозил-тРНК синтетаз (TyrRS) 54 видів еукаріотів з різних таксонів. В окремих випадках перевірено коректність ідентифікації цих генів та їхніх екзонів шляхом зіставлення з відомими по слідовностями кДНК та EST. Порівняння екзонно-інтронної структури виявило, що гени TyrRS хребетних (16 видів) мають значно більшу кількість екзонів (13–14), ніж гени комах (2–7 екзонів), дріжджів і протозоа (1–8 екзонів). У ході еволюції значно збільшується довжина інтронів за рахунок їхнього насичення геномними повторами. Позиції окремих інтронів є консервативними впродовж еволюції генів, що свідчить на користь їхньої ранньої інтеграції у ген спільного попередника хребетних і членистоногих. Для гена TyrRS людини детально про аналізовано альтернативні форми сплайсингу мРНК та геномні повтори, присутні в інтронах. Проведен сравнительный биоинформационный анализ строения генов цитоплазматических тирозил-тРНК синтетаз (TyrRS) 54 видов эукариотов из разных таксонов. В отдельных случаях проверена корректность идентификации этих генов и их экзонов путем сопоставления с известными последовательностями кДНК и EST. Сравнение экзонно-интронной структуры показало, что гены TyrRS позвоночных (16 видов) имеют значительно большее количество экзонов (13–14), чем гены насекомых (2–7 экзонов), дрожжей и протозоа (1–8 экзонов), несмотря на эволюционную консервативность доменной организации соответствующих TyrRS. В ходе эволюции значительно увеличивается длина интронов за счет их насыщения геномными повторами. Позиции отдельных интронов сохраняются консервативными в ходе эволюции, что свидетельствует в пользу их ранней интеграции в ген общего предшественника позвоночных и членистоногих. Для гена TyrRS человека детально проанализированы альтернативные формы сплайсинга мРНК и геномные повторы, присутствующие в интронах. A comparative bioinformational analysis has been performed for the structure of cytoplasmic tyrosyl-tRNA synthetase (TyrRS) genes from 54 eukaryotic organisms from different taxones. In some cases, the identification of the genes and their exons was verified by comparison with the experimental cDNA and EST sequences. The comparison of exon-intron structures shows that TyrRS genes of Chordata (16 species) have much more exons (13–14) than genes of Insecta (2–7 exons), yeasts and Protozoa (1–8 exons). The intron lengths increase intensively during the evolution due to integration of genomic repeats. The positions of some introns are conservative that marks their earlier integration into the gene of common ancestor of Chordata and Insecta. The TyrRS gene of human is analyzed in detail for alternative splicing mRNAs and genomic repeats. 2005 Article Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів / К.О. Одинець, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 6. — С. 548-558. — Бібліогр.: 24 назв. — укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000713 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155881 577.152.6 uk Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Ukrainian
topic	Біоінформатика Біоінформатика
spellingShingle	Біоінформатика Біоінформатика Одинець, К.О. Корнелюк, О.І. Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів Біополімери і клітина
description	Проведено порівняльний біоінформаційний аналіз будови генів цитоплазматичних тирозил-тРНК синтетаз (TyrRS) 54 видів еукаріотів з різних таксонів. В окремих випадках перевірено коректність ідентифікації цих генів та їхніх екзонів шляхом зіставлення з відомими по слідовностями кДНК та EST. Порівняння екзонно-інтронної структури виявило, що гени TyrRS хребетних (16 видів) мають значно більшу кількість екзонів (13–14), ніж гени комах (2–7 екзонів), дріжджів і протозоа (1–8 екзонів). У ході еволюції значно збільшується довжина інтронів за рахунок їхнього насичення геномними повторами. Позиції окремих інтронів є консервативними впродовж еволюції генів, що свідчить на користь їхньої ранньої інтеграції у ген спільного попередника хребетних і членистоногих. Для гена TyrRS людини детально про аналізовано альтернативні форми сплайсингу мРНК та геномні повтори, присутні в інтронах.
format	Article
author	Одинець, К.О. Корнелюк, О.І.
author_facet	Одинець, К.О. Корнелюк, О.І.
author_sort	Одинець, К.О.
title	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів
title_short	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів
title_full	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів
title_fullStr	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів
title_full_unstemmed	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів
title_sort	порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-трнк синтетази еукаріотів
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate	2005
topic_facet	Біоінформатика
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/155881
citation_txt	Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів / К.О. Одинець, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2005. — Т. 21, № 6. — С. 548-558. — Бібліогр.: 24 назв. — укр.
series	Біополімери і клітина
work_keys_str_mv	AT odinecʹko porívnâlʹnijanalízstrukturnoíorganízacíígenívcitoplazmatičnoítiroziltrnksintetazieukaríotív AT kornelûkoí porívnâlʹnijanalízstrukturnoíorganízacíígenívcitoplazmatičnoítiroziltrnksintetazieukaríotív
first_indexed	2023-05-20T17:48:19Z
last_indexed	2023-05-20T17:48:19Z
_version_	1796154134114598912

Порівняльний аналіз структурної організації генів цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази еукаріотів

Репозитарії

Схожі ресурси