Влияние ионного состава реакционной среды на образование комплекса короткого транскрипта tat-РНК ВИЧ-1 с рибозимом модели «головка молотка» и расщепление транскрипта рибозимом

• Дата: 2002
• Автори: Маркелова, Е.Ю., Бурьяновский, Л.Н., Китам, О.Э., Краснова, К.Ф., Швед, А.Д.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2002
• Назва видання: Біополімери і клітина
• Теми: Структура та функції біополімерів
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156009
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Влияние ионного состава реакционной среды на образование комплекса короткого транскрипта tat-РНК ВИЧ-1 с рибозимом модели «головка молотка» и расщепление транскрипта рибозимом / Е.Ю. Маркелова, Л.Н. Бурьяновский, О.Э. Китам, К.Ф. Краснова, А.Д. Швед // Вiopolymers and Cell. — 2002. — Т. 18, № 4. — С. 301-306. — Бібліогр.: 27 назв. — англ.

Связывание рибозима с субстратом происходило только в присутствии ионов Mg²⁺. Ионы щелочных металлов, как и ионы аммония, также способствовали образованию комплексов с более замедленной электрофоретической подвижностью, однако это не отражалось на эффективности разрезания субстрата. Расщепление короткого (47 нуклеотидов) транскрипта происходило с эффективностью около 50 % в присутствии ионов Mg²⁺ и не зависело от наличия в среде ионов щелочных металлов, в то время как эффективность разрезания длинного (400 нуклеотидов) субстрата, содержащего тот же сайт расщепления, была в несколько раз ниже, а моновалентные катионы вдвое повышали энзиматическую активность рибозима. Подчеркивается, что при планировании работ по конструированию рибозимов необходимо применение более совершенных методических подходов к выявлению доступных сайтов разрезания в последовательностях РНК-субстратов.