Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum

• Дата: 1993
• Автори: Менджул, М.И., Сырчин, С.А., Аверкиев, А.А., Ребентиш, Б.А.
• Формат: Стаття
• Мова: Russian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1993
• Назва видання: Биополимеры и клетка
• Теми: Структура и функции биополимеров
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156250
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Способы защиты ДНК цианофага LPP-3 oт систем рестрикции – модификации цианобактерии Plectonema boryanum / М.И. Менджул, С.А. Сырчин, А.А. Аверкиев, Б.А. Ребентиш // Биополимеры и клетка. — 1993. — Т. 9, № 5. — С. 54-61. — Бібліогр.: 26 назв. — рос.

Для проверки наличия модифицированных оснований в ДНК цианофага LPP-3 и цианобактерии P. boryanum использовали метод HPLC с помощью установки «System GOLD». Анализ профиля элюции гидролизатов позволил идентифицировать, кроме канонических оснований присутствие в ДНК P. boryanum 5-метилцитозина в концентрации 1,2 % и N-6-метиладенина — 4 5 %. ДНК LPP-3 содержит 0,8% 5-метилцитозина и не включает N-6-метиладенина. 5-Метилцитозин удалось обнаружить только модифицированным методом гидролиза, ДНК фтористоводородной кислотой. Для выявления сайтспецифического метилирования ДНК цианофага LPP-3 и ДНК P. boryanum подвергали ферментативному гидролизу рестриктазами-изошизомерами, по-разному реагирующими на метилирование остатков цитозина и аденина в сайтах узнавания. Установлено метилирование по аденину в GАТС-последовательностях ДНК P. boryanum и по второму иитозину CC(AIT )G G-последовательностей как в ДНК P. boryanum, так и в ДНК LPP-3. Делается вывод о наличии у P. boryanum систем рестрикции – модификации dam- и dcmІ -подобного типа. Защита вирусного генома от систем рестрикции-модификации хозяина осуществляется метилированием последовательности CmC(A/T)GG и контрселекцией по сайту BamHI. По данным, рестрикционного анализа, контр се лекции, очевидно, подвержена и последовательность GG(CIG)CC.