Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates
Poly(ADP-ribosyl)ation is a posttranslational protein modification significant for the genomic stability and cell survival in response to DNA damage. Poly(ADP-ribosyl)ation is catalyzed by poly(ADP-ribose)polymerases (PARPs). Whereas the role of PARP1 in response to DNA damage has been widely illu...
Збережено в:
| Дата: | 2011 |
|---|---|
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2011
|
| Назва видання: | Вiopolymers and Cell |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156332 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates / M.M. Kutuzov, J.-C. Ame, S.N. Khodyreva, V. Schreiber, O.I. Lavrik // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 5. — С. 383-386. — Бібліогр.: 5 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-156332 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1563322019-06-19T01:24:45Z Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates Kutuzov, M.M. Ame, J.-C. Khodyreva, S.N. Schreiber, V. Lavrik, O.I. Poly(ADP-ribosyl)ation is a posttranslational protein modification significant for the genomic stability and cell survival in response to DNA damage. Poly(ADP-ribosyl)ation is catalyzed by poly(ADP-ribose)polymerases (PARPs). Whereas the role of PARP1 in response to DNA damage has been widely illustrated, the contribution of another DNA-dependent PARP, PARP2, has not been studied so far. Aim. To find out specific DNA targets of PARP2. Methods. The EMSA and the PARP activity tests were used. Results. We evaluated Kd values of PARP2-DNA complexes for several DNA structures mimicking intermediates of different DNA metabolizing processes and tested these DNA as «activators» of PARP1 and PARP2 in poly(ADP-ribose) synthesis. Conclusions. Like PARP1, PARP2 does not show correlation between the activation efficiency and Kd values for DNA. PARP2 was activated most effectively in the presence of over5DNA. Keywords: PARP1, PARP2, poly(ADP-ribosyl)ation, DNA binding. Полі(ADP-рибозил)ювання – це тип посттрансляційної модифікації білків, який є важливим для забезпечення стабільності геному та виживання клітин у відповідь на пошкодження ДНК. Полі (ADP-рибозил)ювання каталізується полі(ADP-рибоза)полімеразами (PARP). У той час як роль PARP1 у клітинній відповіді на пошкодження ДНК детально досліджено, внесок іншої ДНК-залежної полі(ADP-рибоза)полімерази – PARP2 – вивчено поки що слабко. Мета. Виявити специфічні ДНК-мішені PARP2. Методи. Метод «затримки в гелі» (EMSA) і тест активності PARP. Результати. Проведено оціночні виміри значень Kd комплексів PARP2–ДНК для деяких структур ДНК, імітуючих інтермедіати різних процесів метаболізму ДНК, а також ці ДНК проаналізовано як «активатори» PARP1 і PARP2 у синтезі полі(ADP-рибози). Висновки. Як і для PARP1, для PARP2 не спостерігається кореляції між ефективністю активації та значенням Kd для різних ДНК. Найефективніше PARP2 активується за присутності over5DNA. Ключові слова: PARP1, PARP2, полі(ADP-рибозил)ювання, зв’язування ДНК. 2011 Article Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates / M.M. Kutuzov, J.-C. Ame, S.N. Khodyreva, V. Schreiber, O.I. Lavrik // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 5. — С. 383-386. — Бібліогр.: 5 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000129 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156332 576.535 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| description |
Poly(ADP-ribosyl)ation is a posttranslational protein modification significant for the genomic stability and cell
survival in response to DNA damage. Poly(ADP-ribosyl)ation is catalyzed by poly(ADP-ribose)polymerases
(PARPs). Whereas the role of PARP1 in response to DNA damage has been widely illustrated, the contribution
of another DNA-dependent PARP, PARP2, has not been studied so far. Aim. To find out specific DNA targets of
PARP2. Methods. The EMSA and the PARP activity tests were used. Results. We evaluated Kd
values of
PARP2-DNA complexes for several DNA structures mimicking intermediates of different DNA metabolizing
processes and tested these DNA as «activators» of PARP1 and PARP2 in poly(ADP-ribose) synthesis.
Conclusions. Like PARP1, PARP2 does not show correlation between the activation efficiency and Kd values for
DNA. PARP2 was activated most effectively in the presence of over5DNA.
Keywords: PARP1, PARP2, poly(ADP-ribosyl)ation, DNA binding. |
| format |
Article |
| author |
Kutuzov, M.M. Ame, J.-C. Khodyreva, S.N. Schreiber, V. Lavrik, O.I. |
| spellingShingle |
Kutuzov, M.M. Ame, J.-C. Khodyreva, S.N. Schreiber, V. Lavrik, O.I. Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates Вiopolymers and Cell |
| author_facet |
Kutuzov, M.M. Ame, J.-C. Khodyreva, S.N. Schreiber, V. Lavrik, O.I. |
| author_sort |
Kutuzov, M.M. |
| title |
Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates |
| title_short |
Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates |
| title_full |
Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates |
| title_fullStr |
Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates |
| title_full_unstemmed |
Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates |
| title_sort |
interaction of parp2 with dna structures mimicking dna repair intermediates |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2011 |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156332 |
| citation_txt |
Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking
DNA repair intermediates / M.M. Kutuzov, J.-C. Ame, S.N. Khodyreva, V. Schreiber, O.I. Lavrik // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 5. — С. 383-386. — Бібліогр.: 5 назв. — англ. |
| series |
Вiopolymers and Cell |
| work_keys_str_mv |
AT kutuzovmm interactionofparp2withdnastructuresmimickingdnarepairintermediates AT amejc interactionofparp2withdnastructuresmimickingdnarepairintermediates AT khodyrevasn interactionofparp2withdnastructuresmimickingdnarepairintermediates AT schreiberv interactionofparp2withdnastructuresmimickingdnarepairintermediates AT lavrikoi interactionofparp2withdnastructuresmimickingdnarepairintermediates |
| first_indexed |
2023-05-20T17:43:22Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:43:22Z |
| _version_ |
1796153930028154880 |