Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach...
Збережено в:
Дата: | 2011 |
---|---|
Автор: | |
Формат: | Стаття |
Мова: | English |
Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2011
|
Назва видання: | Вiopolymers and Cell |
Теми: | |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156354 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
Цитувати: | Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraineid |
irk-123456789-156354 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-1563542019-06-19T01:28:13Z Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing Chellapandi, P. Reviews The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability. The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant interest in synthetic enzyme biotechnology. Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти. Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед яких основну зацікавленість представляють металоферменти через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації, однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів. Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти. Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед яких основну зацікавленість представляють металоферменти через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації, однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів. Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. 2011 Article Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000113 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156354 577.325 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
English |
topic |
Reviews Reviews |
spellingShingle |
Reviews Reviews Chellapandi, P. Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing Вiopolymers and Cell |
description |
The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites
to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational
methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or
peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the
field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability.
The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the
evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant
interest in synthetic enzyme biotechnology.
Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation. |
format |
Article |
author |
Chellapandi, P. |
author_facet |
Chellapandi, P. |
author_sort |
Chellapandi, P. |
title |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
title_short |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
title_full |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
title_fullStr |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
title_full_unstemmed |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
title_sort |
current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
publishDate |
2011 |
topic_facet |
Reviews |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156354 |
citation_txt |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. |
series |
Вiopolymers and Cell |
work_keys_str_mv |
AT chellapandip currentscenariooncomputeraidedmetalloenzymesdesigning |
first_indexed |
2023-05-20T17:49:29Z |
last_indexed |
2023-05-20T17:49:29Z |
_version_ |
1796154178304737280 |