Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing

The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Видавець:Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Дата:2011
Автор: Chellapandi, P.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2011
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156354
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-156354
record_format dspace
spelling irk-123456789-1563542019-06-19T01:28:13Z Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing Chellapandi, P. Reviews The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability. The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant interest in synthetic enzyme biotechnology. Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти. Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед яких основну зацікавленість представляють металоферменти через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації, однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів. Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти. Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед яких основну зацікавленість представляють металоферменти через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації, однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів. Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. 2011 Article Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000113 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156354 577.325 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Reviews
Reviews
spellingShingle Reviews
Reviews
Chellapandi, P.
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
Вiopolymers and Cell
description The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability. The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant interest in synthetic enzyme biotechnology. Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation.
format Article
author Chellapandi, P.
author_facet Chellapandi, P.
author_sort Chellapandi, P.
title Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_short Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_full Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_fullStr Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_full_unstemmed Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_sort current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2011
topic_facet Reviews
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156354
citation_txt Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT chellapandip currentscenariooncomputeraidedmetalloenzymesdesigning
first_indexed 2023-05-20T17:49:29Z
last_indexed 2023-05-20T17:49:29Z
_version_ 1796154178304737280