Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие

Цель. Разделение экспериментальной энергии Гиббса реакции комплексообразования с двуспиральной ДНК на отдельные энергетические составляющие для гетероциклических соединений фаскаплизина, эллиптицина, триоксатриангулена, тионина и феносафранина. Методы. Молекулярное моделирование (молекулярная дина...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Видавець:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Дата:	2011
Автор:	Костюков, В.В.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2011
Назва видання:	Вiopolymers and Cell
Теми:	Structure and Function of Biopolymers
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156376
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие / В.В. Костюков // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 4. — С. 264-272. — Бібліогр.: 29 назв. — рос.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	irk-123456789-156376
record_format	dspace
spelling	irk-123456789-1563762019-06-19T01:25:04Z Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие Костюков, В.В. Structure and Function of Biopolymers Цель. Разделение экспериментальной энергии Гиббса реакции комплексообразования с двуспиральной ДНК на отдельные энергетические составляющие для гетероциклических соединений фаскаплизина, эллиптицина, триоксатриангулена, тионина и феносафранина. Методы. Молекулярное моделирование (молекулярная динамика, квантово-механические расчеты). Результаты. Вычислены энергетические вклады различных физических факторов, выполнен их сравнительный анализ. Выводы. Показано, что основными факторами, стабилизирующими интеркаляционные комплексы ароматических соединений при связывании с ДНК, являются гидрофобные и ван-дер-ваальсовы взаимодействия. Вклады электростатических взаимодействий, водородных связей в целом и энтропийных факторов являются энергетически невыгодными. Перенос электрона от ДНК к лиганду представляется маловероятным. Ключевые слова: двуспиральная ДНК, интеркаляция, ароматический лиганд, энергетические вклады. Aim. Partition of experimental Gibbs energy of complexation with double-stranded DNA into separate energy components for heterocyclic compounds: fascaplysin, ellipticine, trioxatriangulenum (TOTA), thionine (TH), and phenosafranine (PS). Methods. Molecular modeling (molecular dynamics simulation, quantum-mechanical calculations). Results. The energy contributions from different physical factors were calculated, a comparative analysis was performed. Conclusions. It was shown that the major factors stabilizing the intercalation complexes of aromatic compounds with DNA are hydrophobic and van der Waals interactions. The contributions from electrostatic interactions and hydrogen bonds in total and the entropic factors are energetically unfavorable. Electron transfer from DNA to ligand appears to be unlikely. Keywords: double-stranded DNA, intercalation, aromatic ligand, energy contribution. Мета. Розділення експериментальної енергії Гіббса реакції комплексоутворення з двоспіральною ДНК на окремі енергетичні складові для гетероциклічних сполук фаскаплізину, еліптицину, триоксатриангулену, тіоніну і феносафраніну. Методи. Молекулярне моделювання (молекулярна динаміка, квантово-механічні розрахунки). Результати. Обчислено енергетичні внески від різних фізичних чинників, зроблено їхній порівняльний аналіз. Висновки. Показано, що основними факторами, які стабілізують інтеркаляційні комплекси ароматичних сполук при зв’язуванні з ДНК, є гідрофобні і ван-дер-ваальсові взаємодії. Внески електростатичних взаємодій, водневих зв’язків у цілому та ентропійних чинників є енергетично невигідними. Перенесення електрона від ДНК до ліганда видається малоймовірним. Ключові слова: двоспіральна ДНК, інтеркаляція, ароматичний ліганд, енергетичні внески. 2011 Article Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие / В.В. Костюков // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 4. — С. 264-272. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000108 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156376 577.113:577.32 ru Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Russian
topic	Structure and Function of Biopolymers Structure and Function of Biopolymers
spellingShingle	Structure and Function of Biopolymers Structure and Function of Biopolymers Костюков, В.В. Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие Вiopolymers and Cell
description	Цель. Разделение экспериментальной энергии Гиббса реакции комплексообразования с двуспиральной ДНК на отдельные энергетические составляющие для гетероциклических соединений фаскаплизина, эллиптицина, триоксатриангулена, тионина и феносафранина. Методы. Молекулярное моделирование (молекулярная динамика, квантово-механические расчеты). Результаты. Вычислены энергетические вклады различных физических факторов, выполнен их сравнительный анализ. Выводы. Показано, что основными факторами, стабилизирующими интеркаляционные комплексы ароматических соединений при связывании с ДНК, являются гидрофобные и ван-дер-ваальсовы взаимодействия. Вклады электростатических взаимодействий, водородных связей в целом и энтропийных факторов являются энергетически невыгодными. Перенос электрона от ДНК к лиганду представляется маловероятным. Ключевые слова: двуспиральная ДНК, интеркаляция, ароматический лиганд, энергетические вклады.
format	Article
author	Костюков, В.В.
author_facet	Костюков, В.В.
author_sort	Костюков, В.В.
title	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
title_short	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
title_full	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
title_fullStr	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
title_full_unstemmed	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
title_sort	энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в днк и ее разделение на аддитивные составляющие
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate	2011
topic_facet	Structure and Function of Biopolymers
url	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156376
citation_txt	Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие / В.В. Костюков // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 4. — С. 264-272. — Бібліогр.: 29 назв. — рос.
series	Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv	AT kostûkovvv énergiâinterkalâciiaromatičeskihgeterocikličeskihligandovvdnkieerazdelenienaadditivnyesostavlâûŝie
first_indexed	2023-05-20T17:42:30Z
last_indexed	2023-05-20T17:42:30Z
_version_	1796153898210164736

Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие

Репозиторії

Схожі ресурси