IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860
Aim. The goal of our study was to develop an accurate detection of the SNP rs12979860 by RFLP-based method and to evaluate the polymorphic genotype distribution forthis SNP among individuals with unknown HCV status from Ukraine. Methods.The SNP rs12979860 was tested by PCR RFLP-based method in 99...
Збережено в:
| Дата: | 2011 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | English |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2011
|
| Назва видання: | Вiopolymers and Cell |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156404 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 / V.M. Pampukha, S.A. Kravchenko, L.V. Moroz, L.A. Livshits // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 3. — С. 231-234. — Бібліогр.: 15 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-156404 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1564042019-06-19T01:25:27Z IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 Pampukha, V.M. Kravchenko, S.A. Moroz, L.V. Livshits, L.A. Short Communications Aim. The goal of our study was to develop an accurate detection of the SNP rs12979860 by RFLP-based method and to evaluate the polymorphic genotype distribution forthis SNP among individuals with unknown HCV status from Ukraine. Methods.The SNP rs12979860 was tested by PCR RFLP-based method in 99 individuals from Ukraine. Results. The method of accurate detection of the SNP rs12979860 was developed. The genotypes distributions were: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Conclusions. Due to the high incidence of CC genotype, found in ourstudy, the SNP rs12979860 analysis may be useful for Ukrainian patientsto predict responsesto the treatment considering the HCV genotype and viral load. Keywords: IFN-l-3 (IL28B) gene, SNP rs12979860, PCR-RFLP method, hepatitis C. Мета. Метою даної роботи була розробка простого методу детекції поліморфізму rs12979860 на основі ПДРФ-аналізу та проведення генотипування за даним поліморфізмом серед індивідів з невизначеним статусом хронічного гепатиту С в популяції України. Методи. SNP rs12979860 проаналізовано методом ПЛР/ ПДРФ серед 99 індивідів з України. Результати. Розроблено точний метод детекції rs12979860 та виявлено такий розподіл генотипів: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Висновки. Зважаючи на визначену високу частоту генотипу СС у нашому дослідженні, аналіз поліморфізму rs12979860 можна застосовувати в Україні для прогнозу відповіді пацієнта на лікування з урахуванням генотипу вірусу С і вірусного навантаження. Ключові слова: ген IFN-l-3 (IL28B4), SNP rs12979860, метод ПЛР/ПДРФ, гепатит C. Цель. Цель данной работы состояла в разработке простого метода определения полиморфизма rs12979860 на основе ПДРФанализа и проведение генотипирования по данному полиморфизму среди индивидов с неустановленным статусом хронического гепатита С из Украины. Методы. SNPrs12979860 проанализирован методом ПЦР/ПДРФ среди 99 индивидов из Украины. Результаты. Разработан точный метод детекции rs12979860 и выявлено следующее распределение генотипов в популяции Украины: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Выводы. Принимая во внима - ние высокую частоту генотипа СС, определенную в нашем исследовании, можно сделать вывод о том, что анализ полиморфизма rs12979860 целесообразно применять в Украине для прогноза ответа пациента на лечение с учетом генотипа вируса С и вирусной нагрузки. Ключевые слова: ген IFN-l-3 (IL28B4), SNP rs12979860, метод ПЦР/ПДРФ, гепатит C. 2011 Article IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 / V.M. Pampukha, S.A. Kravchenko, L.V. Moroz, L.A. Livshits // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 3. — С. 231-234. — Бібліогр.: 15 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0000BE http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156404 577.21 en Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| topic |
Short Communications Short Communications |
| spellingShingle |
Short Communications Short Communications Pampukha, V.M. Kravchenko, S.A. Moroz, L.V. Livshits, L.A. IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 Вiopolymers and Cell |
| description |
Aim. The goal of our study was to develop an accurate detection of the SNP rs12979860 by RFLP-based method
and to evaluate the polymorphic genotype distribution forthis SNP among individuals with unknown HCV status
from Ukraine. Methods.The SNP rs12979860 was tested by PCR RFLP-based method in 99 individuals from
Ukraine. Results. The method of accurate detection of the SNP rs12979860 was developed. The genotypes
distributions were: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Conclusions. Due to the high incidence of CC genotype,
found in ourstudy, the SNP rs12979860 analysis may be useful for Ukrainian patientsto predict responsesto the
treatment considering the HCV genotype and viral load.
Keywords: IFN-l-3 (IL28B) gene, SNP rs12979860, PCR-RFLP method, hepatitis C. |
| format |
Article |
| author |
Pampukha, V.M. Kravchenko, S.A. Moroz, L.V. Livshits, L.A. |
| author_facet |
Pampukha, V.M. Kravchenko, S.A. Moroz, L.V. Livshits, L.A. |
| author_sort |
Pampukha, V.M. |
| title |
IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 |
| title_short |
IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 |
| title_full |
IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 |
| title_fullStr |
IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 |
| title_full_unstemmed |
IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 |
| title_sort |
ifn-l-3 (il28b) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2011 |
| topic_facet |
Short Communications |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156404 |
| citation_txt |
IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method:
detection polymorphism of rs12979860 / V.M. Pampukha, S.A. Kravchenko, L.V. Moroz, L.A. Livshits // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 3. — С. 231-234. — Бібліогр.: 15 назв. — англ. |
| series |
Вiopolymers and Cell |
| work_keys_str_mv |
AT pampukhavm ifnl3il28bgenotypingbyrestrictionfragmentlengthpolymorphismmethoddetectionpolymorphismofrs12979860 AT kravchenkosa ifnl3il28bgenotypingbyrestrictionfragmentlengthpolymorphismmethoddetectionpolymorphismofrs12979860 AT morozlv ifnl3il28bgenotypingbyrestrictionfragmentlengthpolymorphismmethoddetectionpolymorphismofrs12979860 AT livshitsla ifnl3il28bgenotypingbyrestrictionfragmentlengthpolymorphismmethoddetectionpolymorphismofrs12979860 |
| first_indexed |
2023-05-20T17:41:23Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:41:23Z |
| _version_ |
1796153866972037120 |