2025-02-22T12:43:32-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: Query fl=%2A&wt=json&json.nl=arrarr&q=id%3A%22irk-123456789-156495%22&qt=morelikethis&rows=5
2025-02-22T12:43:32-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: => GET http://localhost:8983/solr/biblio/select?fl=%2A&wt=json&json.nl=arrarr&q=id%3A%22irk-123456789-156495%22&qt=morelikethis&rows=5
2025-02-22T12:43:32-05:00 DEBUG: VuFindSearch\Backend\Solr\Connector: <= 200 OK
2025-02-22T12:43:32-05:00 DEBUG: Deserialized SOLR response
Локалізація сайтів 5'-CG-3' , 5'-CNG-3' , 5'-GC-3' та 5'-GNC-3' у послідовностях мікроРНК

Локалізація сайтів 5'-CG-3' , 5'-CNG-3' , 5'-GC-3' та 5'-GNC-3' у послідовностях мікроРНК

Мета. Встановлення закономірностей у локалізації динуклеотидів 5'-CG-3' та тринуклеотидів 5'- CNG-3' у послідовностях мікроРНК (miRNA). Методи. Біоінформатичний та статистичний аналіз послідовностей зрілих miRNA. Результати. Один із найвищих піків концентрації сайта 5'-CG-3...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: Галицький, В.А., Комісаренко, С.В.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2011
Series:Вiopolymers and Cell
Subjects:
Discussions
Online Access:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156495
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Description
Summary:Мета. Встановлення закономірностей у локалізації динуклеотидів 5'-CG-3' та тринуклеотидів 5'- CNG-3' у послідовностях мікроРНК (miRNA). Методи. Біоінформатичний та статистичний аналіз послідовностей зрілих miRNA. Результати. Один із найвищих піків концентрації сайта 5'-CG-3' локалізується у місці розташування нуклеотиду 10 з 5'-кінця miRNA. Рівень концентрації сайта 5'-CG-3' у даному піку більш ніж учетверо перевищує середню концентрацію даного динуклеотиду у геномі. Інші еволюційно консервативні піки у послідовності miRNA локалізуються в районі нуклеотидів 16 та 21. Піки концентрації сайта 5'-CNG-3 відповідають нуклеотидам 4 і 8. Приблизно половина послідовностей miRNA містить два чи більше сайтів 5'-CG-3' та 5'- CNG-3', відстань між якими становить у більшості випадків 1 або 3–9 нуклеотидів. Висновки. Піки концентрації сайтів 5'-CG-3' і 5'-CNG-3' не зосереджені в межах seed-ділянки, а розподілені уздовж усієї послідовності miRNA. Однак в одній і тій же молекулі miRNA дані сайти розташовані в межах одного витка подвійної спіралі. Така картина розподілу зазначених сайтів може вказувати на участь у miRNA-залежному метилюванні ДНК усієї послідовності miRNA. Ключові слова: мікроРНК, динуклеотид 5'-CG-3', тринуклеотид 5'-CNG-3', розподіл сайтів.

Similar Items