Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой

Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой

Структура гистидиновых тРНК (тPHКʰᶦˢ) отличается от структур тРНК других аминокис­ лотных специфичностей наличием на 5'-конце дополнительного нуклеотида (G-J). Для изучения молекулярного механизма взаимодействия тPHКʰᶦˢ с гистидил-тРНК синтетзой разработан метод очистки тPHКʰᶦˢ из Т. thermophil...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2006
Автори: Гудзера, О.И., Крикливый, И.А., Яремчук, А.Д., Тукало, М.А.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2006
Назва видання:Біополімери і клітина
Теми:
Структура та функції біополімерів
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156580
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой / О.И. Гудзера, И.А. Крикливый, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 3. — С. 201-209. — Бібліогр.: 23 назв. — рос., англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-156580
record_format dspace
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
topic Структура та функції біополімерів
Структура та функції біополімерів
spellingShingle Структура та функції біополімерів
Структура та функції біополімерів
Гудзера, О.И.
Крикливый, И.А.
Яремчук, А.Д.
Тукало, М.А.
Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
Біополімери і клітина
description Структура гистидиновых тРНК (тPHКʰᶦˢ) отличается от структур тРНК других аминокис­ лотных специфичностей наличием на 5'-конце дополнительного нуклеотида (G-J). Для изучения молекулярного механизма взаимодействия тPHКʰᶦˢ с гистидил-тРНК синтетзой разработан метод очистки тPHКʰᶦˢ из Т. thermophilus и изучена первичная структура изоакиепторной формы тPHКʰᶦˢ1. Индивидуальную тРНК выделяли из суммарной тРНК, используя комбинацию хроматографии низкого давления на бензоилированной ДЭАЭ-целлюлозе (БД-целлюлоза) и ДЭАЭ Toyopearl 650 с жидкостной хроматографией высокого давления на колонках DEAE 5PW и Ultrapore С8. Первичную структуру тPHКʰᶦˢ1 из Т. thermophilus определяли с использованием методов быстрого гель-секвенирования. Изученная структура отличается от тPHКʰᶦˢ из Escherichia coli по 23 положениям. Участки взаимодействия тPHКʰᶦˢ из 1Т. thermophilus с гистидил-тРНК синтетазой исследовали с помощью метода химической модификации нитрозоэтилмочевиной. Показано, что гистидил-тРНК синтетаза защищает от алкилирования этилнитрозомочевиной следующие фосфаты тPHКʰᶦˢ 8 — между акцепторным и D-стеблем; 27, 28, 29 — с 5'-стороны антикодонового стебля; фосфат 34 в антикодрне и фосфаты 67, 68 с 3'-стороны акцепторного стебля. Все обнаруженные участки тPHКʰᶦˢ локализованы на одной стороне пространственной структуры тРНК — там же, где и вариабельный стебель. D-стебель находит­ся с противоположной стороны и не взаимодействует с ферментом.
format Article
author Гудзера, О.И.
Крикливый, И.А.
Яремчук, А.Д.
Тукало, М.А.
author_facet Гудзера, О.И.
Крикливый, И.А.
Яремчук, А.Д.
Тукало, М.А.
author_sort Гудзера, О.И.
title Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
title_short Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
title_full Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
title_fullStr Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
title_full_unstemmed Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой
title_sort выделение гистидиновой трнк из thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-трнк синтетазой
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2006
topic_facet Структура та функції біополімерів
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156580
citation_txt Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой / О.И. Гудзера, И.А. Крикливый, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 3. — С. 201-209. — Бібліогр.: 23 назв. — рос., англ.
series Біополімери і клітина
work_keys_str_mv AT gudzeraoi vydeleniegistidinovojtrnkizthermusthermophilusiizučenieeepervičnojstrukturyiučastkovvzaimodejstviâsgomologičnojaminoaciltrnksintetazoj
AT kriklivyjia vydeleniegistidinovojtrnkizthermusthermophilusiizučenieeepervičnojstrukturyiučastkovvzaimodejstviâsgomologičnojaminoaciltrnksintetazoj
AT âremčukad vydeleniegistidinovojtrnkizthermusthermophilusiizučenieeepervičnojstrukturyiučastkovvzaimodejstviâsgomologičnojaminoaciltrnksintetazoj
AT tukaloma vydeleniegistidinovojtrnkizthermusthermophilusiizučenieeepervičnojstrukturyiučastkovvzaimodejstviâsgomologičnojaminoaciltrnksintetazoj
first_indexed 2023-05-20T17:50:05Z
last_indexed 2023-05-20T17:50:05Z
_version_ 1796154201134333952
spelling irk-123456789-1565802019-06-19T01:29:32Z Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой Гудзера, О.И. Крикливый, И.А. Яремчук, А.Д. Тукало, М.А. Структура та функції біополімерів Структура гистидиновых тРНК (тPHКʰᶦˢ) отличается от структур тРНК других аминокис­ лотных специфичностей наличием на 5'-конце дополнительного нуклеотида (G-J). Для изучения молекулярного механизма взаимодействия тPHКʰᶦˢ с гистидил-тРНК синтетзой разработан метод очистки тPHКʰᶦˢ из Т. thermophilus и изучена первичная структура изоакиепторной формы тPHКʰᶦˢ1. Индивидуальную тРНК выделяли из суммарной тРНК, используя комбинацию хроматографии низкого давления на бензоилированной ДЭАЭ-целлюлозе (БД-целлюлоза) и ДЭАЭ Toyopearl 650 с жидкостной хроматографией высокого давления на колонках DEAE 5PW и Ultrapore С8. Первичную структуру тPHКʰᶦˢ1 из Т. thermophilus определяли с использованием методов быстрого гель-секвенирования. Изученная структура отличается от тPHКʰᶦˢ из Escherichia coli по 23 положениям. Участки взаимодействия тPHКʰᶦˢ из 1Т. thermophilus с гистидил-тРНК синтетазой исследовали с помощью метода химической модификации нитрозоэтилмочевиной. Показано, что гистидил-тРНК синтетаза защищает от алкилирования этилнитрозомочевиной следующие фосфаты тPHКʰᶦˢ 8 — между акцепторным и D-стеблем; 27, 28, 29 — с 5'-стороны антикодонового стебля; фосфат 34 в антикодрне и фосфаты 67, 68 с 3'-стороны акцепторного стебля. Все обнаруженные участки тPHКʰᶦˢ локализованы на одной стороне пространственной структуры тРНК — там же, где и вариабельный стебель. D-стебель находит­ся с противоположной стороны и не взаимодействует с ферментом. Histidine tRNAs (tRNAʰᶦˢ) are unique in possing an extra 5?-base (G-1) not found in other tRNAs. To study the molecular mechanisms of tRNAʰᶦˢ interaction with histidyl-tRNA synthetase, the method for purification of tRNAʰᶦˢ from Thermus thermophilus has been developed and tRNA1ʰᶦˢ has been sequenced. tRNAʰᶦˢ from Thermus thermophilus was isolated by combination of low-pressure benzoyl-DEAE- cellulose and DEAE Toyopearl 650 chromatographies with HPLC on DEAE 5PW and reversed phase columns. The nucleotide sequence of T. thermophilus tRNA1ʰᶦˢ has been determined by rapid gel-sequencing method. tRNA1ʰᶦˢ from T. thermophilus is different from those of E.coli at 23 positions. The sites of interaction of tRNAʰᶦˢ with histidyl-tRNA synthetase have been studied by the method of chemical modification with ethylnitrosourea. histidyl-tRNA synthetase protects from modification following phospates: 8 – between acceptor and D-stems, 27, 28, 29 from 5?-end of anticodon stem, 34 – at the anticodon and phosphates 67, 68 from 3?-end of acceptor stem. All the protected sites of tRNAhis are found on one side of three-dimensional structure of tRNA where the variable stem is also located. D-stem is located on the opposite side and does not interact with the enzyme. Структура гістидинових тРНК тPHКʰᶦˢ відріняється від структур тРНК інших амінокислотних специфічностей наявністю на 5'-кінці додаткового нуклеотиду (G-1)- Для вив­чення молекулярних механізмів взаємодії тРНК з гістидил-тРНК синтетазою розроблено метод очищення тPHКʰᶦˢ з Т. thermophilus і вивчено первинну структуру ізоакцепторної форми mPHKʰᶦˢ₁ . індивідуальну тРНК ʰᶦˢвиділяли із сумарної тРНКʰᶦˢ, використовуючи поєднання хроматографії низького тиску на бензоїлованій ДЕАЕ-целюлозі (БД-целюлоза) і ДЕАЕ Toyopearl 650 з рідинною хроматографією високого тиску на колонку DEAE 5PW і Ultrapore С8. Первинну структуру тPHКʰᶦˢ₁ із Т. thermophilus визначено з використанням мето­ду швидкого гель-секвенування. Вивчена первинна структура відрізняється від тРНк₁8 із Escherichia coli за 23 положення­ми. Ділянки взаємодії тPHКʰᶦˢ₁з Т. thermophilus із гістидил-тРНК синтетазою досліджували методом хімічної модифі­кації нітрозоетилсечовиною. Показано, що гістидил-тРНК синтетаза захищає від алкілування нітрозоетилсечовиною такі фосфати тРНК : 8 — між акцепторную і D-гілкою; 27, 28, 29 — 3 боку 5'-кінця антикодонової гілки; фосфат 34 — в антикодоні і фосфати 67, 68 — з боку 3'-кінця акцепторное гілки. Усі виявлені ділянки тРНк локалізуються на одному боці просторової структури тРНК — там, де й варіабельна гілка. D-гілка розташована з протилежного боку і не взаємодіє з ферментом 2006 Article Выделение гистидиновой тРНК из Thermus thermophilus и изучение ее первичной структуры и участков взаимодействия с гомологичной аминоацил-тРНК синтетазой / О.И. Гудзера, И.А. Крикливый, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 3. — С. 201-209. — Бібліогр.: 23 назв. — рос., англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000731 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156580 577.217.335 ru Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України

Схожі ресурси