2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе

2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе

Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектро­скопии (500 МГц). Двухмерные экспе...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2003
Автори: Веселков, А.Н., Итон, Р.Дж., Лантушенко, А.О., Рогова, О.В., Эрнандес, Сантьяго А., Дэвис, Д.Б.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2003
Назва видання:Біополімери і клітина
Теми:
Структура та функції біополімерів
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156681
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-156681
record_format dspace
spelling irk-123456789-1566812019-06-19T01:29:58Z 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Лантушенко, А.О. Рогова, О.В. Эрнандес, Сантьяго А. Дэвис, Д.Б. Структура та функції біополімерів Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектро­скопии (500 МГц). Двухмерные эксперименты 2M-TOCSY и 2M-NOESY использованы для полного отнесения сигналов протонов феноксазонового соединения и нуклеотидов в смешанном растворе и для установления структуры интеркалированного комплекса ActII с дуплексом тетрамера На основании анализа межмолекулярных NOE-контактов сделан вывод о преимущественной интеркаляции ActII в терминальный d(TG)-сайт олигонуклеотида и построены наиболее вероятные пространственные структуры комплексов ActII с 5'-d(TpGpCpA). Анализ показывает, что боковые аминоалкильные цепи феноксазонового лиганда располагаются в малой канавке дуплекса ДНК. Представлено результати дослідження комплексоутворення синтетичної феноксазонової сполуки актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил)аміду (ActII) з самокомплементарним дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині мето­дом двовимірної 1Н ЯМР спектроскопії (500 МГц). Двовимірні екперименти 2M-TOCSY і 2M-NOESY використано для повно­го віднесення сигналів протонів феноксазонової сполуки і нуклеотидів у змішаному розчині та для визначення інтеркальованого комплексу ActII з дуплексом тетрамеру. На основі аналізу міжмолекулярних NOE-контактів зроблено вис­новок щодо переважної інтеркаляції ActII у термінальний d(TG)-сайт олігонуклеотиду та побудовано найвірогідніші просторові структури комплексів ActII з 5'-d(TpGpCpA). З аналізу випливає, що бічні аміноалкільні ланцюги феноксазоно­вого ліганду розміщуються в малій борозенці дуплексу ДНК. Complexation of a synthetic phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide (ActII) with self-complementary deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution has been studied by two-dimensional 1H-NMR spectroscopy (500 MHz). Two-dimensional homonuclear correlation NMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) has been used for complete assignment of proton signals of phenoxazone compound and nucleotides in the mixed solution and for determining the structure of the intercalated complex of ActII with the tetramer duplex. Analysis of inter-molecular NOE-contacts enables to conclude that ActII preferentially intercalates into the terminal d(TG)-site of the tetranucleotide and to propose the most favourable spatial structures of ActII-d(TpGpCpA) complexes. It follows that aminoalkyl side chains of ActII are situated in the minor groove of the tetramer duplex. 2003 Article 2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.00067B http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156681 577.113 ru Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
topic Структура та функції біополімерів
Структура та функції біополімерів
spellingShingle Структура та функції біополімерів
Структура та функції біополімерів
Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
Біополімери і клітина
description Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектро­скопии (500 МГц). Двухмерные эксперименты 2M-TOCSY и 2M-NOESY использованы для полного отнесения сигналов протонов феноксазонового соединения и нуклеотидов в смешанном растворе и для установления структуры интеркалированного комплекса ActII с дуплексом тетрамера На основании анализа межмолекулярных NOE-контактов сделан вывод о преимущественной интеркаляции ActII в терминальный d(TG)-сайт олигонуклеотида и построены наиболее вероятные пространственные структуры комплексов ActII с 5'-d(TpGpCpA). Анализ показывает, что боковые аминоалкильные цепи феноксазонового лиганда располагаются в малой канавке дуплекса ДНК.
format Article
author Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
author_facet Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
author_sort Веселков, А.Н.
title 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_short 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_full 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_fullStr 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_full_unstemmed 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_sort 2м ¹н ямр анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(tpgpcpa) в водном растворе
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2003
topic_facet Структура та функції біополімерів
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156681
citation_txt 2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
series Біополімери і клітина
work_keys_str_mv AT veselkovan 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT itonrdž 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT lantušenkoao 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT rogovaov 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT érnandessantʹâgoa 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT dévisdb 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
first_indexed 2023-05-20T17:50:23Z
last_indexed 2023-05-20T17:50:23Z
_version_ 1796154211308666880

Схожі ресурси