Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці

Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці

Light period significantly influences on the growth and development of plants. One of the major genes of photoperiod sensitivity is Ppd-D1, located on the chromosome 2D. The aim of the work was to determine the alleles and molecular structure of Ppd-D1 gene in samples from the collection of Ae. taus...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Видавець:Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Дата:2012
Автори: Чеботар, Г.О., Чеботар, С.В., Бабенко, Д.О., Моцний, І.І., Щербань, А.Б., Cивола, Ю.М.
Формат: Стаття
Мова:Ukrainian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2012
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156829
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці / Г.О. Чеботар, С.В. Чеботар, Д.О. Бабенко, І.І. Моцний, А.Б. Щербань, Ю.М. Cиволап // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 2. — С. 149-155. — Бібліогр.: 29 назв. — укр.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-156829
record_format dspace
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Ukrainian
topic Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
spellingShingle Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Genomics, Transcriptomics and Proteomics
Чеботар, Г.О.
Чеботар, С.В.
Бабенко, Д.О.
Моцний, І.І.
Щербань, А.Б.
Cивола, Ю.М.
Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
Вiopolymers and Cell
description Light period significantly influences on the growth and development of plants. One of the major genes of photoperiod sensitivity is Ppd-D1, located on the chromosome 2D. The aim of the work was to determine the alleles and molecular structure of Ppd-D1 gene in samples from the collection of Ae. tauschii accessions, which have different flowering periods, and in 29 Ukrainian wheat varieties. Methods. We used methods of allele-specific PCR with primers to the Ppd-D1 gene, sequencing and Blast-analysis. Results. The collection of Ae. tauschii accessions and several varieties of winter and spring wheat was studied. The molecular structure of the allelic variants (414, 429 and 453 b. p.) of Ppd-D1b gene was determined in the collection of Aegilops. tauschii accessions. Conclusions. The Ppd-D1a allele was present in all studied varieties of winter wheat. 60 % of spring wheat is characterized by Ppd-D1b allele (size of amplification products 414 b. p.). Blast-analysis of the sequence data banks on the basis of the reference sequence of sample k-1322 from the collection of Ae. tauschii accessions has shown a high homology (80 to 100 %) between the nucleotide sequences of PRR genes, that characterize the A and D genomes of representatives of the genera Triticum and Aegilops. Keywords: Aegilops tauschii, bread wheat, allele-specific PCR, phd-D1.
format Article
author Чеботар, Г.О.
Чеботар, С.В.
Бабенко, Д.О.
Моцний, І.І.
Щербань, А.Б.
Cивола, Ю.М.
author_facet Чеботар, Г.О.
Чеботар, С.В.
Бабенко, Д.О.
Моцний, І.І.
Щербань, А.Б.
Cивола, Ю.М.
author_sort Чеботар, Г.О.
title Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
title_short Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
title_full Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
title_fullStr Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
title_full_unstemmed Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
title_sort алелі гена ppd-d1 у зразках колекції aegilops tauschii і м’якої пшениці
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2012
topic_facet Genomics, Transcriptomics and Proteomics
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156829
citation_txt Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці / Г.О. Чеботар, С.В. Чеботар, Д.О. Бабенко, І.І. Моцний, А.Б. Щербань, Ю.М. Cиволап // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 2. — С. 149-155. — Бібліогр.: 29 назв. — укр.
series Вiopolymers and Cell
work_keys_str_mv AT čebotargo alelígenappdd1uzrazkahkolekcííaegilopstauschiiímâkoípšenicí
AT čebotarsv alelígenappdd1uzrazkahkolekcííaegilopstauschiiímâkoípšenicí
AT babenkodo alelígenappdd1uzrazkahkolekcííaegilopstauschiiímâkoípšenicí
AT mocnijíí alelígenappdd1uzrazkahkolekcííaegilopstauschiiímâkoípšenicí
AT ŝerbanʹab alelígenappdd1uzrazkahkolekcííaegilopstauschiiímâkoípšenicí
AT civolaûm alelígenappdd1uzrazkahkolekcííaegilopstauschiiímâkoípšenicí
first_indexed 2023-05-20T17:50:39Z
last_indexed 2023-05-20T17:50:39Z
_version_ 1796154221458882560
spelling irk-123456789-1568292019-06-20T01:28:57Z Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці Чеботар, Г.О. Чеботар, С.В. Бабенко, Д.О. Моцний, І.І. Щербань, А.Б. Cивола, Ю.М. Genomics, Transcriptomics and Proteomics Light period significantly influences on the growth and development of plants. One of the major genes of photoperiod sensitivity is Ppd-D1, located on the chromosome 2D. The aim of the work was to determine the alleles and molecular structure of Ppd-D1 gene in samples from the collection of Ae. tauschii accessions, which have different flowering periods, and in 29 Ukrainian wheat varieties. Methods. We used methods of allele-specific PCR with primers to the Ppd-D1 gene, sequencing and Blast-analysis. Results. The collection of Ae. tauschii accessions and several varieties of winter and spring wheat was studied. The molecular structure of the allelic variants (414, 429 and 453 b. p.) of Ppd-D1b gene was determined in the collection of Aegilops. tauschii accessions. Conclusions. The Ppd-D1a allele was present in all studied varieties of winter wheat. 60 % of spring wheat is characterized by Ppd-D1b allele (size of amplification products 414 b. p.). Blast-analysis of the sequence data banks on the basis of the reference sequence of sample k-1322 from the collection of Ae. tauschii accessions has shown a high homology (80 to 100 %) between the nucleotide sequences of PRR genes, that characterize the A and D genomes of representatives of the genera Triticum and Aegilops. Keywords: Aegilops tauschii, bread wheat, allele-specific PCR, phd-D1. Світловий період суттєво впливає на ріст і розвиток рослин. Одним із головних генів чутливості до фотоперіоду є Ppd-D1 з родини PRR, розташований на хромосомі 2D. Мета роботи полягала у визначенні алельного стану і молекулярної структури гена Ppd-D1 у зразках з колекції Ae. tauschii з різними строками цвітіння та у 29 українських сортів м’якої пшениці. Методи. Алель-специфічна ПЛР з праймерами до гена Ppd-D1, секвенування і Blast-аналіз. Результати. Досліджено колекцію зразків Ае. tauschii та низку сортів озимої і ярої м’якої пшениці, визначено молекулярну структуру алельних варіантів (414, 429 і 453 п. н.) гена Ppd-D1b у колекції Ae. tauschii. Висновки. У досліджуваних сортів озимої м’якої пшениці присутній алель Ppd-D1a, а серед ярих сортів 60 % відрізняються наявністю алеля Ppd-D1b (розмір продуктів ампліфікації 414 п. н.). Blast-аналізом нуклеотидних послідовностей цього гена з банків даних у порівнянні з референсною послідовністю зразка k-1322 з колекції Ae. tauschii показано високий рівень гомології (від 80 до 100 %) між послідовностями генів PRR, характерних для геномів А і D представників родів Triticum і Aegilops. Ключові слова: Аеgilops tauschii, м’яка пшениця, алель-специфічна ПЛР, Ppd-D1. Световой период существенно влияет на рост и развитие растений. Одним из главных генов чувствительности к фотопериоду является Ppd-D1, расположенный на хромосоме 2D. Цель работы состояла в определении аллельного состояния и молекулярной структуры гена Ppd-D1 в образцах из коллекции Ae. tauschii с разными сроками цветения и в 29 украинских сортах мягкой пшеницы. Методы. Аллель-специфичная ПЦР с праймерами к гену Ppd-D1, секвенирование и Blast-анализ. Результаты. Исследована коллекция образцов Ае. tauschii и ряд сортов озимой и яровой мягкой пшеницы, определена молекулярная структура аллельных вариантов (414, 429 и 453 п. н.) гена Ppd-D1b в коллекции Ae. tauschii. Выводы. У исследованых сортов озимой мягкой пшеницы присутствует аллель Ppd-D1a, а среди яровых сортов у 60 % определен аллель Ppd-D1b (размер продуктов амплификации 414 п. н.). Blast-анализом нуклеотидных последовательностей этого гена из банков данных в сравнении с референсной последовательностью образца k-1322 из коллекции Ae. tauschii показан высокий уровень гомологии (от 80 до 100 %) между последовательностями генов PRR, характерных для Аи D-геномов представителей родов Triticum и Aegilops. Ключевые слова: Аеgilops tauschii, мягкая пшеница, алель-специфичная ПЦР, Ppd-D1. 2012 Article Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці / Г.О. Чеботар, С.В. Чеботар, Д.О. Бабенко, І.І. Моцний, А.Б. Щербань, Ю.М. Cиволап // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 2. — С. 149-155. — Бібліогр.: 29 назв. — укр. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000042 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156829 577.2:631:581.115:542.1 uk Вiopolymers and Cell Інститут молекулярної біології і генетики НАН України

Схожі ресурси